為了消除系統運行中的故障和錯誤，軟硬件維護人員應對系統進行必要的修改和改進；為了使系統適應用戶環境的變化，滿足新的需求，需要對原系統進行壹些局部更新，這就是所謂的系統維護。系統維護的任務是糾正軟件系統使用中發現的隱藏錯誤，擴展用戶在使用過程中提出的新功能和性能要求，目的是維護軟件系統的“正常運行”。這個階段的文檔是軟件問題報告和軟件修改報告，記錄發現軟件錯誤的情況和修改軟件的過程。
管理信息系統(MIS)在實施並投入正常運行後，已進入系統運行維護階段。壹般壹個信息系統的使用壽命短則4-5年，長則10年。在壹個信息系統的整個使用壽命中，都會伴隨著系統維護。系統維護的目的是保證管理信息系統的正常可靠運行，並不斷改進和完善系統以充分發揮其作用。因此，系統維護的任務就是有計劃、有組織地對系統進行必要的變更，以保證系統中的所有元素隨著環境的變化始終處於最新的、正確的工作狀態。