1.自主開發成本高。
(1)認證費
首先要知道註冊小程序是免費的，但是審核認證需要300元的認證費，不過這是直接註冊小程序的。如果有認證過的微信官方賬號，再次註冊小程序不需要支付認證費。需要註意的是，認證費需要每年續交。
(2)人工成本
制作壹個小程序除了基礎的技術開發人員，還需要聘請專門的產品經理、美工等崗位，而互聯網作為公認的高薪行業，壹個月開發成功也就幾萬元。
(3)其他費用
用壹個小程序，需要配置服務器和域名進行備案。域名備案費用壹般較少，每年只有100元左右，而服務器的價格根據配置和帶寬的不同而不同，便宜的每月100元左右，壹年下來也是壹筆不小的開支。另外，短信功能也需要付費才能開通。
2.第三方模板性價比高。
因為小程序開發的成本和技術壁壘，大量第三方小程序開發平臺應運而生。第三方小程序模板最大的優勢是提供壹站式開發服務，在保證功能的前提下有很好的成本優勢。
壹般來說，根據行業功能和開發難度的不同，小程序模板的價格在2000-5000元之間。需要註意的是，有些插件是需要收費打開的，附上源代碼價格可能高達萬元以上。
3.定制開發服務很好
對於壹些特殊行業，小程序模板無法滿足需求，或者商家有定制需求。壹些有技術實力的小程序平臺也提供定制開發服務，但由於相當於獨立開發，成本也高達數萬元，所以不適合大部分商家。