中國疾病預防控制中心的主要職責:
1，開展疾病預防控制、突發公共衛生事件、環境與職業健康、營養與健康、老年人健康、婦幼健康、放射衛生和學校衛生等工作。，為國家制定公共衛生法律、法規、政策、規劃和項目提供技術支持和建議。
2、組織制定國家公共衛生技術方案和指南，並承擔公共衛生相關衛生標準的綜合管理工作；承擔實驗室生物安全指導和愛國衛生運動技術支持工作；為實施《煙草控制框架公約》提供技術支持；開展健康教育、健康科普和健康促進。
應急傳防所的職責是:負責非典、鼠疫、禽流感、手足口、登革熱等急性傳染病的預防和控制工作。重大傳染病和突發公共衛生事件的應急處理和管理，以及救災防病；重點傳染病的監測、分析和預警；突發公共衛生事件和重大傳染病的演練、培訓和技術指導。
衛生應急設備、物資的儲存、維護、保養等。；突發公共衛生事件風險評估和衛生應急綜合示範縣創建；傳染病和突發公共衛生事件的科學研究、對外交流與合作。