南京中醫學院胃腸科是江蘇省胃腸疾病定點防治單位，全國最好的胃腸科。長期從事胃腸疾病的研究和臨床治療。由全國多位胃腸專家參加，由南京中醫藥研究院、廣東省醫藥研究院七個實驗室提供技術支持。成功轉化了藥物研究的最新成果，實現了獨創的塞肛解毒法加離子中藥治療慢性胃炎、結腸炎的重大突破。
同時，引進多種世界先進的胃腸檢查設備，實現了無插管無痛完成整套胃腸檢查的目的，避免了患者不敢插管胃腸鏡檢查，導致胃腸疾病發現不及時，延誤疾病治療的現象。肛門塞藥排毒結合離子中藥結合現代精密儀器檢查開創了胃腸疾病治療的新時代。