1.提交申請。申請人可以先在網上預約，也可以直接到現場申請，並按照規定填寫《中國公民出入境證件申請表》，準備好需要提交的相關證明材料。2.數碼攝影。申請人需提交本人數碼照片兩張，可直接現場拍照(或在公安局認可的拍照點拍照，需領取照片回執)。3.收集指紋。申請人在工作人員的指導下采集或驗證指紋(雙手拇指)。16周歲以下申請人是否采集指紋，根據其監護人意見確定，采集後等待處理號。4.接受申請。工作人員將對申請人提交的材料進行初審，並向申請人出具繳款單(申請人如需使用免登記自助通關，還應簽署《免登記港澳地區自助查驗通道使用聲明》)。5.支付費用。申請人在指定窗口繳納辦證簽註所需費用，辦證費用為100元。簽註的費用取決於簽註的類型，並收到收據。6.制作文檔。省級公安機關出入境管理機構受理申請後，負責制作電子港澳通行證，並將準備好的證件反饋給受理申請的出入境管理機構。7.頒發證書。申請人完成證件準備後，到出入境管理處領取證件；如果選擇快遞，那就等快遞員上門簽收吧。
法律依據:
《中華人民共和國護照法》第二十四條:從事邊境貿易、邊境旅遊服務或者參加邊境旅遊的公民，可以向公安部委托的縣級以上地方人民政府公安機關出入境管理機構申請辦理中華人民共和國(中華人民共和國)出入境通行證。
衍生問題:
申請通行證需要多長時間？
辦理往來港澳通行證及簽註需15個工作日，網上申請、電話申請需8個工作日，窗口申請、郵政代理申請需10個工作日。但是，根據工作人員的日程安排，可能無法在指定時間拿到文件。