值機手續就是為旅客辦理乘機手續（換登機牌、收運旅客的托運行李、安排旅客的座位）。
電子客票自助值機
針對電子客票旅客，航空公司在候機樓提供自助值機設備，旅客憑電子客票自助辦理登機牌，當前上海浦東虹橋，深圳機場B號候機樓已有該設備。
酒店值機
針對商務旅客，航空公司將值機服務遷移到酒店，當前深航錦江國際酒店可辦該項服務。
異地候機樓值機
對於沒有機場的城市，在當地辦理值機手續，異地機場乘坐飛機，當前東莞城市候機樓能夠辦理從深圳、廣州機場始發航班的值機服務。
境外聯程值機
將值機服務延伸到境外，旅客在境外壹次性辦好值機手續就可享受輕松便捷的航空旅行，當前深航旅客在香港能夠直接辦理深圳的值機服務。
網上值機
網上辦理乘機手續——簡稱“網上值機”服務，是壹種方便快捷的登機手續辦理方式。旅客通過網站在線辦理值機，並可預選座位。如果無需托運行李，那麽通過網上辦理登機手續提前預訂座位並將登機牌打印出來，就可以直接通過安檢登機，無需到機場服務櫃臺排隊辦理登機牌，這樣可以節省您的時間。
城市值機
在城市候機樓辦理的登機牌，方便旅客不必壹定要到機場才能值機。很多城市都有了自己的城市候機樓。
短信值機
短信值機是指旅客通過發送和接收短信息的方式辦理值機手續。 目前，第壹期短信值機業務只適用於單個成人旅客辦理南航非中轉和非代碼***享的國內航班。目前開通了短信值機業務的國內城市有：北京、長春、長沙、成都、大連、廣州、桂林、貴陽、哈爾濱、海口、杭州、南昌、南京、南寧、青島、三亞、上海虹橋、上海浦東、深圳、沈陽、烏魯木齊、武漢、西安、廈門、鄭州、重慶、珠海等。除了國際和地區航線，其他和網上值機業務開通的壹樣。