根據《中華人民***和國勞動合同法》規定，用人單位應當與勞動者直接訂立勞動合同。因此，如果南通啟東集裝箱廠需要招聘員工，就應該直接與員工簽訂勞動合同，而不是通過勞務派遣公司。但是，如果南通啟東集裝箱廠需要短期或臨時性的勞動力支持，可以考慮通過勞務派遣公司來解決。因此去南通啟東集裝箱廠不是必須得通過勞務派遣公司。
如果南通啟東集裝箱廠需要招聘員工，建議直接與員工簽訂勞動合同，這樣可以更好地保障員工的權益。