要是屬於政府強制隔離，員工沒有違規違法情況的，如果是員工個人原因造成需要隔離的，其隔離期間薪水發放有以下情況：壹、協商過後隔離期間可以通過網絡靈活工作的，公司應該按正常上班出勤給員工支付薪水。
二、隔離期間無法辦公的，公司需要給員工支付固定成分的工資，比如基本工資、崗位工資；績效、提成、獎金、車補、飯補等非固定工資成分可不支付。
要是屬於居家隔離、從外地返崗導致的隔離等非政府強制隔離，這種隔離並不是《傳染病防治法》裏面的隔離，其薪水發放情況有以下選擇：壹、隔離期間協商過後可以通過網絡在家辦公的，公司應該按正常出勤給員工支付工資。
二、隔離期不能辦公的，有以下兩種工資發放選擇：
1、通過協商企業（以企業意向為主）安排員工使用各種帶薪假期，像是年假、公休假、自設的福利假等（不含事假），這些假都是帶薪的，因此公司應支付員工全額的工資。休完帶薪假仍無法上班的，按照2的方法執行。
2、如果公司未安排員工使用各類帶薪假期，員工不在崗時間在壹個工資支付周期（壹個月）以內的，公司需要給員工支付固定工資成分，包括基本工資、崗位工資等；超出壹個支付周期的，企業需給員工發放生活費。不同城市生活費發放標準不壹樣，比如北京是不低於當地最低工資標準的70%，四川是70%，陜西是75%，廣東是80%。
此外還有兩種比較特殊的情況：
1、倘若是因為工作原因造成隔離的，企業應當按照勞動者正常出勤，全額支付工資。
2、要是是由於員工不遵守防控措施而造成被隔離，這種情況員工主張薪資的，不予支持。