中心歷年來多次受到有關部門的表彰，2006年被呼市人民政府評為“呼市勞動模範先進集體”；2007年被呼市人民政府評為“年度全市安全生產先進集體” ；2006年以來連續四年被呼市衛生局評為“年度衛生工作實績考核突出單位”；2007年被內蒙古自治區疾控中心評為“實績考核優秀單位”；2008年被內蒙古自治區疾控中心評為“全區盟市疾控中心績效考核第壹名”；2008年在抗震救災中被中華總工會授予“抗震救災重建家園工人先鋒號”稱號，被內蒙古衛生廳評為“抗震救災先進集體”稱號；2010年被內蒙古自治區衛生廳評為“全區衛生系統先進集體”。
呼市疾控中心擁有先進的儀器設備、科學的管理辦法、壹流的人才隊伍，我們將本著“全心全意為人民服務”的宗旨，內強素質，外塑形象，以科學發展觀為統領，不斷完善管理體制，增強服務意識，努力為全市人民提供熱忱、優質服務，為促進首府經濟建設、維護社會和諧穩定、保障人民群眾公***衛生安全貢獻力量。