通亞物流軟件分為幾大功能模塊：收貨管理、發貨管理、到貨管理、配送管理、應收款管理、應付款管理、貨物跟蹤管理、短信通知管理、財務管理、車輛管理、客戶管理、回單管理等 如下圖所示： 功能：通過權限的設置給不同的網點、部門、人員授權，使他們能輕松解決分內工作
賬號設置——修改賬號密碼
權限管理——根據崗位部門劃分職責，不能越權操作，職權分明，出現問題容易查找原因，可以控制某個員工，可以操作什麽和不可以操作什麽，可以看什麽和不可以看什麽等。
網點信息——添加各自網點的信息 例如：網點電話、傳真、地址、負責人等
短信設置——對短信內容設置，可以給收貨人個和發貨人進行短信通知，如回單通知，貨到通知等 功能：對本網點收過貨進行管理 例如：查詢、制單、回單、庫存、提貨等
開寫運單——制單，打印運單、信封和標簽等，支持標簽機打印
運單管理——查詢運單、修改運單、查看是否裝車等
回單管理——查詢客戶回單是否回來、是否短信通知、是否結算，對同壹個客戶，可以批量結算。
提貨管理——管理本地網點小車司機提貨記錄
庫存管理——查看本地倉庫未發走的貨物 功能：管理本網點的發車情況，並對每輛車的貨物重量、體積和司機運費是否符合標準
發車清單管理——查看以往發車情況和創建新的發車清單
外包清單管理——查看以往給別家運輸公司運輸的情況和創建新的外包清單
貨物轉移管理——查看以往上轉移給儲運公司或者其他網點的貨物記錄 功能：發貨網點發來的貨進行分流 例如：送貨、中轉等
網點收貨 ——發貨網點發來的貨進行分流，有4種出庫方式：送貨、自提、中轉、下轉移
到付款管理——查詢、結算發貨網點的到付款
到付司機運費管理——查詢、結算到付司機運費
代收貨款管理——查詢、結算貨物代收款 送貨 ——派車送貨，管理送貨費、送貨車輛等信息
中轉——合作的承運單位中轉，管理中轉費、中轉單位、和壹些往來賬務
自提——順便結算到付款和代收貨款等
下轉移——貨物轉移到自己的下級網點配送 功能：回扣、月結、司機回付運費進行管理、並自動生成報表
回扣管理——查詢、結算回扣，生成報表
月結管理——查詢、結算月結客戶，生成報表
司機回付運費管理——查詢、結算司機回付運費
等所有和業務有關的賬目管理 功能：管理司機、車輛
車輛管理——車輛信息登記管理和對司機登記、證件管理
車輛定位——GPS和軟件對接，了解GPS
車輛費用管理——維修、保養、加油 功能：發車利潤、現金賬、日誌記賬統計和分析
科目設置——設定財務科目
業務對賬——自動核算各公司當日應繳現金，及時掌握各分支機構的現金留存情況
記賬管理——記錄、核算各公司的日常開銷
發車利潤——統計壹段時間的發車利潤
網點對賬—— 各網點之間相互對賬，及時了解各分支機構的運營 功能：客戶發貨量分析、客戶排名、客戶發貨預警、客戶運價標準管理