1，等級:烏魯木齊火車站為特站，烏魯木齊南站為壹等站。
2.位置:烏魯木齊火車站位於烏魯木齊市頭屯河區高鐵北六路1號。烏魯木齊南站位於新疆維吾爾自治區烏魯木齊市沙依巴克區南站路135號。
3.車次不同:烏魯木齊火車站動車29列，城際列車74列，直通特快列車22列，特快列車33列，特快旅客列車70列，烏魯木齊南站動車8列，城際列車2列，特快列車4列，特快旅客列車1列。