對於大多數人來說，口腔潰瘍會在1-2周內自愈。如果超過三周還沒有自愈，就要引起重視了。因為除了以上因素，口腔潰瘍可能預示著某些疾病，也就是說某些疾病的臨床表現。
1.白塞病是壹種非常常見的風濕性免疫疾病血管炎。主要癥狀包括:1。復發性口腔潰瘍，疼痛劇烈時會影響患者進食；二是有眼部病變，如結膜炎、虹膜炎、虹膜睫狀體炎；三是其他癥狀，如皮膚結節性紅斑、針刺反應、多發性痤瘡等。
2.系統性紅斑狼瘡約18% ~ 54%的系統性紅斑狼瘡患者伴有口腔黏膜潰瘍，可為系統性紅斑狼瘡的首發癥狀，多見於硬腭或軟腭、鼻黏膜甚至呼吸道黏膜。潰瘍往往是無痛的，只有仔細檢查才能發現。逐漸發展到深部潰瘍或全口潰瘍，會引起明顯的疼痛。
3.幹燥綜合征幹燥綜合征是壹種侵犯外分泌腺，特別是唾液腺和淚腺的慢性炎癥性自身免疫性疾病。會引起口幹、眼幹、復發性口腔潰瘍、齲齒、關節肌肉疼痛等癥狀。如果復發性口腔潰瘍伴有眼幹、口幹等癥狀，應及時做唇黏膜活檢明確。
4.口腔癌壹般來說，復發性口腔潰瘍是良性病變，很少有惡變。但有些口腔癌可表現為口腔潰瘍，惡性腫瘤的口腔潰瘍無自愈趨勢。它們逐漸長大，固定在壹個地方，沒有復發的趨勢。鱗狀細胞癌在口腔癌中較為常見。
5.口腔結核口腔結核性潰瘍多為開放性結核直接擴散的結果，好發於軟腭、頰黏膜和舌背。潰瘍比癌性潰瘍淺，基底部軟，無浸潤和硬結，範圍廣，界限清楚。基部有桑葚肉芽腫，抗結核治療有效。
6.消化系統潰瘍口腔潰瘍與胃潰瘍、十二指腸潰瘍、克羅恩病、潰瘍性結腸炎、局限性腸炎、肝膽疾病及寄生蟲引起的各種消化道疾病或功能障礙密切相關。如果找不到復發性口腔潰瘍不愈合的原因，需要做胃鏡和腸鏡檢查消化系統。