在第二部中，威震天的老板出面用不完整的方塊碎片救了威震天，然後他們想找到能量矩陣啟動金字塔裏的大機器毀滅太陽，把太陽的能量帶回塞伯坦重建並統治它(意圖沒有改變，至於怎麽把能量帶回來，就要在第三部中找到禦天敵了)。汽車人再壹次意識到地球人面臨災難(沒有太陽肯定就完了)，於是再次上前阻止。擎天柱在戰鬥中犧牲了，但是山姆率先找到了能量矩陣，並用它救了擎天柱。最後，金字塔裏的大機器被摧毀了。這次主角沒死(墮落之王不是主角，其實是個打醬油的)。至於立方體能量到達山姆大腦的情節，純粹是給小山姆打醬油。
在第三部中，威震天仍然想要重建和統治塞伯坦，但他們對此無能為力，於是他們想到了幾十年前的禦天敵。禦天敵可以把塞伯坦拉到地球這邊，然後直接抓地球人幹活(這是最尷尬的註意)，但是他們不能激活禦天敵，所以把這個重任交給了汽車人。解決方法是通過幾個與霸天虎長期合作的地球人(齋藤優子哥哥真蠢)引導汽車人啟動禦天敵。結果，汽車人激活了禦天敵，並很快發現他是壹個“壞人”，所以他們重新開始。但是這壹次，霸天虎寡不敵眾，強大的禦天敵控制了局面。汽車人被打敗了，幾乎全軍覆沒。最後，他們被女主角反戈壹擊，殺死了威震天和禦天敵。變形金剛三。
其實故事很連貫。有些地方，電影的表達可能會有點生硬，所以沒關系，因為這本來是要給觀眾壹個震撼的視聽體驗，但劇情敘事是其次的。
先說主要人物:
霸天虎@威震天:堅持不懈的反派只有壹個目的，重建和統治塞伯坦，所有想阻止他的人都會死。其實如果墮落之王最後在第二部成功的話，他會被威震天殺死，但是朱哥最後還是替他做到了。
霸天虎@墮落金剛:威震天的導師知道很多事情，拿威震天當傀儡。計劃是等塞伯坦重建後威震天皇帝在幕後，可惜如意算盤打錯了。
汽車人@擎天柱:典型的正義派，無論生死，都想維護正義。它寧願永遠不重建家園，保護地球人。它無所畏懼，但它只能做英雄，永遠做不了領袖，因為它不是把自己群體的利益放在第壹位，而是把第三方地球人的利益放在第壹位。
汽車人@禦天敵:真正的統治者，其實他並沒有真的背叛汽車人。如他所說，他剛剛和霸天虎達成了協議。本來他打算帶著能量柱來，把摧毀太陽後的能量送回賽博坦，但是墜毀了。最後，他別無選擇，只能把塞伯坦拉過來。他唯壹的想法就是不惜壹切代價重建賽博坦。他只是犧牲了人類的利益，他有壹個真實的。