萬歷二十八年(1600)初，李華龍統率二十余萬明軍，分八路攻打亳州。萬歷二十八年(1600)五月十八日，明軍在海龍墩會師，總攻楊應龍。六月，柳丁破城，楊應龍之子楊朝東、其弟楊兆龍、其妾田女鳳被俘，亳州全境收復平定。
平波戰爭歷時114天，集中川、黔、湖廣三省兵力，消耗二百萬左右，終於平定了楊叛亂。但戰爭也對明朝的方方面面產生了深遠的影響。
第二，亳州之戰對明朝的負面影響。
(壹)對國力的巨大消耗。
雖然明朝贏得了對楊應龍的征服戰爭，但也消耗了明朝的國力。明代大學者王家屏曾說:“(平伯戰)騎葛佳，連分幾鎮，半谷；錢是杯水車薪，傾註幾萬塊錢，填山溝；兵老財多，智窮...他們被困在狡猾的牢籠裏，卻陷入了兩難的境地...在時事和資本進退兩難的今天，國威和士氣低迷。“明末萬歷年間的三次大征伐戰爭，在時間上幾乎是壹脈相承的，國力的消耗不言而喻。為了維持這些龐大的戰爭，明朝把軍餉調去了半壁江山，國家財政日漸枯竭，造成了嚴重的困難。
明代國庫支出集中在太庫、太仆寺、京通倉。戰爭期間，這三個倉庫的支出庫存直接反映了明朝國力的消耗。
明朝第七年(1442)，設立太倉庫，又稱太倉庫，用以儲存白銀。“各省送來的多余的棉絲布、馬草、鹽課，都存放在這個倉庫裏。”可見，太倉庫是明朝中後期最重要的國庫。宗申即位後，經過張十年的改革，太酷儲備充足。然而，仁辰、亳州之戰後，國庫所剩無幾，平波之戰對國庫的消耗無疑是非常巨大的。
明代太仆寺，“牧馬敕令隸屬兵部，南京太仆寺設滁州”。萬歷三十五年(1607)，太仆寺的邵青寫道:“我收集歷代書籍，至嘉隆年間，老庫累積至壹千多萬，已滿。萬歷十八年，下西洋，借款160萬；東征借款560多萬；二十七年，我為邊境付出了五十萬...如今，老圖書館有27萬只耳朵。”由此可見，從萬歷仁臣之亂開始到亳州之戰結束，戰爭的巨大消耗耗盡了太仆寺豐厚的國庫。
京通儲是儲備國家糧食為國庫，花米黍為國家所需。據《明神宗》記載，萬歷十壹年(1583)十二月，“實糧* * *壹千八百壹十八萬五千四百石”；到萬歷三十年(1602)，“蒼井有石四百四十八萬，只夠用兩年”。這壹時期糧食儲備的巨大變化，反映了萬歷三大征對國庫糧食的巨大消耗。作為三戰中的最後壹戰，平波戰爭的消耗讓明朝雪上加霜。
(2)人民的稅收增加了。
平波戰爭持續了半年左右，在明朝北侵寧夏、東征朝鮮之前，消耗了大量的人力、物力、財力，導致國庫虧空嚴重。因此，有必要增加稅收作為維持國家運轉的手段。
明朝中後期，明朝廷把增稅作為增加* * * *財政收入的主要途徑。萬歷十四年(1586)，接替張的內閣官員嚴厲批評加稅:“從去年開始，加稅的人越來越多，有些人是因為事才加的...只是現在人民缺勞動力，但正供給又不能持續，多出來的怎麽會有！”萬歷二十年後，因為戰亂，“三大征隨後，又增加了不少派系。”萬歷二十七年(1599)起兵反楊應龍時，增稅情況“比二十年前高四倍”；“世界上富裕家庭的數量比二十年前少了十倍”。
所以明朝的平叛戰爭雖然以維護國家統壹和領土完整為目的，但是龐大的戰爭支出使得* * *入不敷出，朝廷不得不增加稅收來維持國家機器的正常運轉，而這樣的舉動最直接的後果就是引發社會矛盾，刺激人民造反。
(3)由礦監稅引發對人民的剝削和掠奪。
早在嘉靖年間，明朝* * *就曾在民間廣泛開礦，但在隆慶時期因為大臣們的反對而被廢除。到了萬歷年間，宗申壹度想恢復開礦，但遭到以大學生申時行為首的文官集團的強烈反對，開礦被擱置。萬歷二十四年(1596)，宗申以“建兩宮，放棄計劃”和巨額戰爭費用為由，向全國各地派出礦監和稅務使節；到了戰爭時期，派出的稅務稽查員就更多了，全國的廠礦幾乎都被宦官控制。自從征服亳州開始，礦監稅就更加肆無忌憚地盤剝百姓。萬歷二十七年(1599)四月，大學士趙壹針見血地指出:“(礦監、稅使)利用官貴剝民，欺行霸市，中飽私囊者，十之八九。”宗申開征礦業稅，這是無奈的，也是極不公正的。長期的戰爭和對人民的剝削，使整個國家受到了極大的傷害，“所以考明之死，事實上是在神宗”；清代史學家趙翼也認為“論者說明亡，不死於崇禎，死於萬歷”。
(4)導致起義不斷，女真崛起。
明朝曠日持久的戰爭和稅務稽查員的流弊，讓百姓在巨大的壓力下，活在* * *的道路上。亳州之戰後，因為增稅加稅激增，全國各地爆發了大規模的難民起義。萬歷二十九年(1600)，白蓮教徒趙谷元聚眾在徐州發動起義。萬歷三十七年(1609)，“皖蘇流民數千”；多年的饑荒和沈重的負擔迫使農民起義。崇禎二年(1629)，、李自成、張領導的農民軍相繼起義，成為明朝最後的盜墓者。
建州女真真正崛起是在萬歷三大遠征之後。尤其是平伯戰爭中，明朝廷調動20萬大軍開赴西南，極大地削弱了明朝在東北的軍事實力。明朝的平叛戰爭給了努爾哈赤絕佳的發展機會。萬歷四十四年(1616)，努爾哈赤稱可汗，建立大金政權。強大的努爾哈赤終於在萬歷四十六年(1618)以“七大恨”為由討伐明朝，發動了長達數十年的反明戰爭。三十年後，滿清入關，統壹全國。
回顧女真崛起的發展歷史，萬歷三大特點，尤其是平伯戰爭時期，是女真發展的分水嶺。由於明朝調集重兵圍剿土司叛亂和農民起義，無暇顧及東北戰事，使得女真族抓住了寶貴的發展機遇，為後來入主中原打下了堅實的基礎。從此，明廷失去了控制女真的主動權，揭開了明朝衰落的序幕。
第三，亳州之戰對明朝產生了積極的影響。
首先，在亳州地區，土改和儒家教育的推行，加強了中央政府對西南地區的有效管轄，促進了當地經濟文化的全面發展。亳州之亂平定後，中央改地方為設府。“播地分二郡，以關為界。關內屬四川，關外屬貴州。四川人說遵義，貴州人說平嶽。遵義領先州壹:真的很安全；4縣:遵義、綏陽、桐梓、仁懷。平嶽領州壹:黃平；縣4:月湄潭、余慶、甕安、安化。“這使得中央政府有效地加強了對亳州地區和廣大西南地區的控制。災後國家實施改革，直接將亳州地區納入中央管理體系，標誌著中央政府對該地區擁有無可爭辯的* * *管轄權。
在教育方面，中央政府開始向相對落後的亳州地區州縣推廣儒家教育。“萬歷三十六年，孫知府，開大會，叫百姓遵高皇帝之命，教子子孫孫。此外，5個縣在城市和農村村莊選擇土地建設社會研究；考教師，社團也就壹兩三個人。於是遵義縣建了14個社會科，有14名社會教師；正安府兩校，五人；桐梓縣二十二個縣，22人；綏陽縣二十七所，27人；仁懷縣有22所學校，22人。有87所社會學校和70名社會教師。遵義文教真在這裏。”可以看出，平波戰爭後，中央政府通過更換現政府，大力推行儒家教育，使地方經濟文化有了很大的發展。
其次，通過編人到戶，客觀上增加了壹定的財政收入，解放了勞動力，促進了地方經濟的發展。政府成立後的播州地區被納入中央財政管理體系，其財政收入和糧食稅收大部分上繳貴州各省，客觀上緩解了部分財政緊張。戰爭結束後，舊農奴制通過大規模的對當地人民的土地改革而瓦解，土司與普通民眾之間的人身依附關系立即消失。
總之，雖然亳州改省府後對全國的積極影響相對有限，但客觀上促進了當地教育、經濟、文化的全面進步，鞏固了西南邊疆的穩定，促進了民族團結，維護了國家統壹。