壹旦人體感染病毒，這些結構蛋白可以作為免疫原，刺激漿細胞產生特異性抗體。已批準的抗原檢測產品主要使用冠狀病毒肺炎-19N蛋白作為抗原檢測的靶標。抗原檢測的樣本來源通常是鼻腔、咽喉或唾液。它的壹個特點就是出成果快，大概15分鐘就能達到。可以實現嫌疑人的早期移送。操作相對簡單，在三種檢測方法中價格較便宜，但抗原檢測的靈敏度也較低。
核酸檢測更準確。雖然沒有完美的檢測方法，但核酸檢測顯然比抗原檢測更接近完美。數據顯示，目前常用的抗原檢測試劑盒對無癥狀感染的準確率僅為58%。核酸檢測通過這種方式可以知道病毒的數量，有助於分析後續的變化，從整體上控制疫情。抗原檢測只能知道是否有感染。數據共享並不容易實現。組織內進行核酸檢測，結果聯網，方便查詢和鎖定。自檢和通知抗原靠自覺，不利於疫情溯源。
核酸檢測仍然是主流，具備核酸檢測的能力。發放抗原檢測盒，讓人們自己檢測，以便更快地知道檢測者是否具有傳染性，並盡早隔離傳染性最強的患者。抗原檢測和核酸檢測應該是互補的。核酸和抗原都是重要的檢測手段，都有各自最適用的場合。比如在沒有核酸檢測能力的情況下，比如遠離檢測點，或者半夜出現發熱或感冒癥狀，可以使用更方便的抗原檢測。