博物館分為兩層，包括100多個展廳和壹個大型圖書館。博物館入口的設計融入了古埃及藝術的特點:大門的輪廓是壹個圓形拱門，拱門兩側的壁龕中有壹個歐式浮雕，其中壹個盛放紙莎草，另壹個盛放蓮花，分別象征著古埃及的南北。在博物館的花園裏，有許多埃及著名學者的雕像和獅身人面像、方尖碑和石雕等室外展品。
2002年，埃及國家博物館慶祝100歲生日時，埃及政府宣布計劃在首都開羅附近著名的吉薩大金字塔附近建造壹座現代化的“大埃及博物館”，並向國內外公開征集設計方案。埃及希望“大埃及博物館”成為埃及文化的永恒象征，展示燦爛豐富的古埃及文明。2003年，代表愛爾蘭的中國建築師謝福林提交的設計方案，以其簡潔明快的設計理念，將傳統與現代相結合，獲得金獎。
埃及國家考古博物館