黨委辦公室、公共事務辦公室、人事處、科研處、醫務處、醫保處、護理部、門診部、保衛處、基建處、退休處、總務處、財務室、審計局、宣傳教育處、團委、醫患協調處。
臨床科室
結核、腫瘤、胸外科、骨科、普通內科、放療、急診科、麻醉科、ICU。
醫療技術部門
放射科、檢驗科、藥劑科、功能科、心肺功能室、病理科、資料室、病案科、醫學工程科、營養科。
研究部門
細胞生物學實驗室、細菌免疫學實驗室、結核分子生物學實驗室、藥理學實驗室、病理解剖學實驗室、流行病學實驗室、中心實驗室和動物實驗室。
其他部門
工會、紀檢監察室、疾控中心結核病臨床防治中心、圖書情報中心。