自然崇拜包括對天上、地下各種自然對象的神化和崇拜。在古代社會，由於人們對於大自然的依賴感和神秘感，認為自然現象和自然力存在壹種神秘力量在支配，就把它們奉為神靈，並且加以祭拜和祈禱。中國古代自然崇拜的對象極為廣泛，包括日月星辰、風雨雷電、河海山川、水火以及動植物類、男女生殖器等等，主要都是與人類生產和生活直接相關的自然物和自然力。不久又出現將自然神人格化和社會化的復雜現象，人們由自然崇拜的人格化發展到相信上帝和天命，初步建立了以上帝為中心的天神系統。鬼魂崇拜首先來自於對祖先的崇拜，古時的人死後，他的子孫非常想念他，夜裏作夢就會夢見他，因而認為人在死後還有靈魂存在，並且認為祖先的靈魂能夠行使神的職能和後代交流，所以子孫便以陪葬、祭祀等方式安慰先靈，祈求祖先保護自己。除了對自己的祖先崇拜之外，古人還對原始部落、部落聯盟和氏族***同體內的領袖、英雄、聖賢等，進行祭祀和崇拜。人們相信地上所發生的壹切事情及結果，都是神鬼意誌的體現，並且相信通過虔誠的方式祭拜和取悅神靈，就能影響神鬼的意誌，從而對自己產生神秘的保佑作用。這樣，原始的宗教文化和形式就產生了，並且形成中國上古社會的普遍信仰。 殷商時代的統治階級最崇尚鬼神，社會上下廠泛興起祭祖神靈之風。(小戴劄記·表記篇)說：“殷人尊神，率民以事神，先鬼而後禮。”說明此時祭祀神鬼的風氣相當普遍。
為了和神靈溝通，這時有了專營此事的巫祝。殷商蔔文，“巫”字象兩手捧王之形，為事神之狀。 (國語·楚辭)謂“在男曰覡，在女曰巫。"巫覡又合稱巫。古時巫醫不分，(呂氏春秋·勿躬)謂“巫彭作醫”。“祝”(說文)謂為“主贊事者”，即負責祭祀祈禱之禮儀者。另有“蔔”，(說文)謂：“灼剝龜也，象炙龜之形，壹日象龜光之從橫也。”蔔者替人占蔔吉兇，周代出現了占書《周易)。巫、祝、醫、蔔是古代社會宗教活動不可缺少的職業。這些人都是當時的"大知識分子"，並不象後來名聲那麽狼藉。後世道教廟宇之中管理香火者稱為"廟祝"，還是古代社會遺留下來的名稱。
巫、祝、醫、蔔擅長各種各樣的巫術，他們所從事的祈禱、降神、占夢、祈雨、醫病、占星、望氣、祝由、符咒、預言等巫術，為後世道教所繼承。在道經之中亦有此類內容，如(太上三五正壹盟威錄)是早期道教專門講述以符錄召神劾鬼的道經。(盤天經)根據雲氣在天空的位置、變化和移動方向等預言氣候和社會的變化。(通古大象歷星經)以天上星宿的位置、軌道、光度變化等占蔔人間吉兇禍福等等。其中有著宗教迷信的成分，同時也包含原始科學研究的成果。
周繼殷商而統治天下，把祭祀天地與崇敬祖先統壹起來，稱為敬天尊祖，規定宗祖文王於明堂以配上帝。此時祭祖神鬼成為國家祀典，設置官員專門管理，並且形成了天神、地抵、人鬼的神鬼系統。〈周禮上〉說，“大仲伯之職，掌建邦之天神、人鬼、地祗之禮。”
屬於天神約有上帝、青黃赤自黑五帝及日、月、星、鬥、風、雲、雨、雷、電諸神；屬於地抵的有社稷、山川、五嶽、四瀆之神；屬於人鬼的主要是各姓的祖先及本民族崇拜的聖賢、忠烈之士。春秋以降，巫風依舊，尤以荊楚地區方甚。(國語·楚語)觀射文謂"家為玉史"，實際反映了當時楚國的社會風尚。屈原所作(楚辭·九歌)源於楚地民間祭神歌曲，(離騷)中有巫鹹降神，(招魂)中有巫陽下招，皆為楚國風尚。據(史記·封撣書)，漢初劉邦註意保存傳統祭禮，增祀五帝，並不謂說，“吾甚重詞而敬祭，今上帝之祭及山川諸神當詞者，各以其時禮詞之如故。”漢武帝即位之後，“尤敬鬼神之祖”，詞太壹神於東南郊，遍把五嶽四讀之神。而道教的多種崇拜正是直接承襲這些神道巫風而逐漸興起的，上述諸神也正是道教多種信仰的來源。許多神靈為道教所吸收，變成道教信奉的神抵。如上帝演化成為玉皇大帝、雷神演化成為雷聲普化天尊、社神演化成為土地神等等。其他如五嶽大帝、四海龍王、門神、竈神等，最初都是民間信奉的神靈，又轉化成為道教之神，從而使道教神學與中國民俗文化密不可分。道教的許多經書，托稱為神靈降授，或介紹某位神靈的生平事跡，或介紹對某位神靈念誦的經懺，以及贊頌詞章、祭禱科儀、上奏表文等等。道經之中有關齋醮科儀的種種內容，即由古人祭神儀式演化而來。如建醮壇、設齋供的內容，即等於古人祭神之禮；唱贊詞、誦寶誥的內容，即含有言辭悅神之意；上表章、宣疏文的內容，也不外申訴和祈禱作用。在道教法術之中，道士通過祭拜、掐訣、念咒、畫符、步置、召神等手段，充當神人之媒介，溝通神靈，希圖達到某種神通，這些內容在道經之中也占有壹定數量。
關於道教來源於古代宗教及巫術的結論，近代學者聞壹多先生曾言：“我常疑心這哲學或玄學的道家思想必有壹個前身，而這個前身很可能是某種富有神秘思想的原始宗教，或更具體點講，壹種巫教，這種宗教，在基本性質上，恐怕與後來的道教無大差別，雖則在形式上與組織上盡可截然不同。”正因為道教在繼承古代巫風巫術的基礎上而加以宗教化，後來出現的道經不可避免地大量滲入了古代巫術和祭禮的成分。因此，原始宗教文化與巫術，是道經神學的來源之壹。