我們都知道，李世民也是人，人無完人，是人就有錯誤。貞觀後期，唐太宗開始有了壹些變化，先從納諫開始體現出來。貞觀十年（636年），魏征發現他“漸惡直言”，這是唐太宗走向壹些錯誤的開始。
壹是征伐高句麗，這個被某些人認為是錯誤的舉動，但是，就當時形勢來看，此征是必要的和需要的。第壹，發動戰爭的責任是高句麗，高句麗悍然進攻唐朝附庸國新羅挑起戰端，為了維護權威，唐需要發動戰爭來保護自己的附屬國的利益。第二，戰爭中，唐軍是正義和人性的，這也是保證唐軍損失非常小的壹個外在條件，在唐軍攻占的城池中，均擁護唐軍。但是由於為了保持正義性和人性化，導致偏求穩，而使戰期拉長。第三，唐軍的撤退和後續戰爭，充分體現了李世民的胸懷和高超的戰略思想，唐軍以2000人的損失消滅高句麗數十萬人，千古罕見。撤退之時，敵將城墻跪拜，也實屬罕見。唐軍後期的軍事騷擾和政治封鎖，使高句麗的實力每況愈下，最終高宗消滅高句麗。
還有奢侈現象的明顯增加。在貞觀十六年的時候，唐太宗下詔說，太子所用之物其他機關不得限制，結果造成太子的嚴重浪費現象。唐太宗自己也開始修造宮殿，貞觀十壹年在東都洛陽修飛山宮，二十壹年又修翠微宮。這些使唐太宗後期沒有前期勤儉.
還有壹個大的錯誤就是參與史官所寫的起居註當中。這是專門寫皇帝日常生活和朝政言論的，皇帝無權幹涉，這是歷來的傳統，歷來的皇帝都沒有看，尊重史官的職權和地位。而史官也是公正直書，從不掩飾什麽，從不害怕皇帝打擊報復。但唐太宗這個名君卻犯了壹個頗大的歷史錯誤，影響幹預了史官的公正性。當然，沒有任何完整證據表明太宗大量歪曲歷史。同時，不僅僅是太宗，自春秋，看史者何止數百，董狐直筆，陳壽索賄，太史被宮，不要說清朝的文字獄了，另外，許敬宗對李世民並沒有好感，這樣表明，唐初歷史應該具有可信度的。
唐太宗在貞觀初期不顧大臣魏征和李大亮的勸阻，對歸順的北方遊牧民族部落要土地給土地要物資給物資，結果這些部落享受夠唐朝的恩惠後胃口反而越來越大，索性就叛亂了。
後來唐太宗也自己檢討：“中國百姓，實天下之根本，四夷之人，乃同枝葉，擾其根本以厚枝葉，而求久安，未之有也。初不納魏征言，遂覺勞費日甚，幾失久安之道。”
貞觀二十年（646年），遼東戰役回來時，唐太宗得病，此後壹直調養，由此開始服用方士提煉的金石丹藥。先前唐太宗還曾經嘲笑秦皇漢武迷戀方術和尋求丹藥，現在自己也不由自主地陷進去了。貞觀二十壹年（647年），唐太宗又得了“風疾”，煩躁怕熱，便讓人在驪山頂峰修翠微宮，第二年，派人從中天竺求得方士那羅邇娑婆寐，病情不斷惡化。貞觀二十三年（649年）五月己巳（二十六）日（7月10日）駕崩於含風殿，享年五十二歲。