無論我們行大禮，還是行小禮，或是鞠躬，身口意三門必須要和諧同心，身在行禮跪拜，口要誦經贊美，心要虔誠觀想，簡稱和合頂禮。我們經常會提起三門和合頂禮。此處“三門”指的是兩種身口意，其壹指自己的身口意，其二指頂禮對象的身口意。“和合”指的也是指兩種類型的和合：本身和合，與頂禮對象和合。壹、自身和合指的是自己的身口意和合。頂禮中身在頂禮跪拜，口頭要念誦上師頂禮文，心裏想著上師，達到自己的身口意三和統壹。反之，妳身在頂禮，嘴中不誦經，心裏胡思亂想，達不到身口意三和，這不屬於完整的頂禮，也無法達到消業的功德。
二、與頂禮對象和合指的是自己的身口意與頂禮對象的身口意相互和合。自身在跪拜頂禮時，把上師觀想在自己的頭頂空中，頂禮者對像端正立定，兩足並齊，合掌恭敬於胸前，然後雙手合掌上舉至額間，此時觀想對面觀想的上師額間（阿）字放白色光，照射到自身額間，此時自身業消凈，頂禮於上師的身，祈求加被，是為身項禮；然後合掌放於喉間時，觀想上師喉間（嗡）字放紅色光，照射到自身喉間，此時自身口業清凈，頂禮於佛語，祈求加被，是為口頂禮；最後合掌放於心間時，觀想上師心間（吽）字放藍色光，照射到自身的心間，此時自己的意業清凈，頂禮於佛意，祈求加被，是為意頂禮，三業既凈，然後展開兩手，匍匐於地，兩手壓地，額頭投地時心裏想消除自己無始劫以來五毒所造的業障，凈化五毒，排除五臟六腑的疾病，降服五魔，獲得五方佛的智慧加持，已得到了上師與佛陀的五大智慧。起來的時候，觀想自己的身和上師的身變成壹體，自己的口和上師的語變成壹體，自己的心和上師的意變為壹體。自己和上師身口意相應，這樣反復的觀想、頂禮，最終妳的身口意和上師的身口意變為壹體，真正與上師心心相印。
與本尊頂禮，頂禮前誦念壹遍本尊的儀軌，然後身在頂禮跪拜，口頭持本尊的心咒，心裏觀想本尊，這是自己的身口意三和頂禮本尊法；自己頭頂虛空之中對面觀想的上師額間（阿）字放白色光，照射到自身額間，此時自身業消凈，自身和本尊的身變為壹體；然後合掌放於喉間時，觀想本尊喉間（嗡）字放紅色光，照射到自身喉間，此時自身口業清凈，自口和本尊的口變為壹體；最後合掌放於心間時，觀想本尊心間（吽）字放藍色光，照射到自身的心間，此時自己的意業清凈，自己的心和本尊的心變為壹體，五體投地時，自己和本尊不二之中消除了壹切不凈的業障，自己獲得五大雍仲本尊的成就，跟自心頂禮，與本尊壹禮壹持心咒壹觀想。
各教派之間有各自不同的觀想方法，因此五體投地頂禮觀想方法也分很多種，每壹本尊頂禮的觀想，也略有不同，以下簡單說說五體投地頂禮觀想方法：
壹、自身觀想菩提身：就是身體正直，雙足腳跟並攏，腳尖展開，雙手結定印，把自己的身體觀想成宇宙，宇宙萬物的所有五官妙欲皆具備在我們的身體中，之後自身觀為不生不滅的菩提身；
二、雙手觀為十度：右手五指從大拇指數起，代表布施持戒忍辱精進禪定等之五波羅密，與左手五指從小拇指數，代表力量慈悲發願方便智慧波羅密相合，是為十度，壹步壹步的趨入菩薩之地。又右手方便與左手智慧，合而為壹，即從方便與智慧門中，成就色法二身意。又右手世俗菩提與左手勝義菩提；
三、合十如意寶：雙手合掌形如蓮花即將開放，大拇指放在掌內，觀作心願如意法寶。合十代表般若波羅蜜多十度，也表示世上所有美好的，珍貴的，妙吉祥的，清凈無塵的聖物都供養給諸佛菩薩與上師。積累無上的功德與福報；
四、身受加被的觀想：雙手合十放在頭頂時，觀想把如意寶供養於諸佛菩薩與上師的身體，諸佛菩薩與上師額頭（阿）字放白色光，照射到自身額間，心想自己身體所做的所有惡業即不健康和不良行為，得到佛的身體加持，即是佛的美滿相好；
五、口受加被的觀想：然後合十放於喉間時，把如意寶以及所有美好的東西供養於諸佛菩薩與上師的語言，觀想諸佛菩薩與上師喉間（嗡）字放紅色光，照射到自身喉間，心想消除自己語言所造的所有罪過，得到佛六十支妙語功德與諸佛菩薩上師的妙語加持；
六、意受加被的觀想：合十放在心間時，把如意寶以及所有美好的東西供養於諸佛菩薩與上師之心，觀想諸佛菩薩上師的心間（吽）字放藍色光，照射到自身的心間，消除自心的業障，得到佛菩薩的心的加持，就是慈悲和智慧；
七、消除五毒觀想法：展開兩手，匍匐於地，兩手壓地，額頭投地時心裏想消除自己無始劫以來五毒所造的壹切業障，即打敗自己的傲慢，取得佛的智慧；
八、斷除煩惱觀想：左手是智慧，右手是方便，兩手伏地時，用力前推，即以智慧之利劍，將八萬四千煩惱，悉行斬斷後，用方便之舟筏，將壹切眾生，渡登彼岸；
九、驅逐心魔觀想：全身平伏在地上，雙手伸直，做合掌舍利塔的手勢，放在頭頂時，觀想自己獲得諸佛菩薩和上師的加持，有害於我者，皆系四魔，天魔、陰魔（又名蘊魔）、欲魔、死魔，今伏地用力壹推，即將四魔驅逐，無復為害；
十、推開解脫之門觀想：起身完畢，雙手打開，收回，輔助於身體，起立，觀想本人化身萬千，而且自己前方有害我的仇敵之人，左邊父親，右邊母親，周圍有三界六道輪回中的壹切眾生，跟我壹起同時向無量數佛菩薩頂禮，願以此功德，度盡諸有情，推開解脫門，悉證菩薩果。有些書中雲：以上觀想法，可擇其壹二，依法作觀，功德無量，此外尚有密法上之觀想，即右手為起分，左手為證分，二手相合，成熟度脫之道。又右手主脈五氣息，與左手支脈五氣息，二者相合，兩脈氣息，聚於心間，成就雙入之道，此義甚深，可於自己本師前求口訣。念此咒壹贊壹禮，或口誦此咒繞塔，壹次可變為千數。