據了解，木瓜是目前消費者真正接觸到的轉基因食品之壹，市面上的木瓜絕大多數是轉基因品種。
中國農業大學食品科學與營養工程學院專家稱，環斑病毒對於木瓜是毀滅性的災害，幾乎都要用到轉基因技術來抗擊這個病毒，讓木瓜產生抗性。所以木瓜如果不是轉基因，就基本沒有收成。由於轉基因木瓜全世界範圍內普遍種植，因此標不標識都不影響。
專家建議，應通過修訂《食品安全法》對轉基因食品的管理加以規定。可考慮利用食品安全風險評估委員會機制，對轉基因食品安全進行風險評估。壹旦得出某些轉基因食品不安全結論的，應立即采取相應措施，確保該轉基因食品停止生產經營，並告知消費者停止食用。
轉基因知識普及
目前市售聖女果、彩椒、小南瓜、小黃瓜都不是轉基因食品
網上流傳壹份轉基因食品名單，包括“聖女果、大個兒彩椒、小南瓜、小黃瓜”，對此專家並不認同。
中國農科院生物所研究員王誌興說，小番茄也叫聖女果、櫻桃番茄，是自古就有的番茄品種，只是因為個頭小、采摘不便、產量低，最早僅作為觀賞用，後來發現食用方便，口味經過改良後逐漸流行。個頭小是天生的基因差異，不是轉基因的結果。
中國農科院油料所副研究員吳剛表示，聖女果更接近人工馴化前的野生狀態，其實野生的板栗、核桃、蘋果等也都遠小於常規栽培品種。人類馴化野生植物壹般是為了提高產量，主要做法是增大果實，但隨著人們對食品要求的多樣化，出現了很多小型化的瓜果蔬菜，如早春紅玉西瓜等。這些小型化品種都來源於帶著祖先原始基因的種質資源，與轉基因無關。
吳剛說，小南瓜和小黃瓜也不是轉基因食品，僅僅是未充分成熟的南瓜和黃瓜。如果繼續在田間種植，小南瓜和小黃瓜最終會生長成普通的大南瓜和老黃瓜。
關於大個兒彩椒，吳剛表示，大個兒彩椒含有不同類型的花青素，表現為更豐富的顏色。花青素的變異在植物中很常見，像鮮花同壹個品種就有不同顏色，蘿蔔也有紅蘿蔔、綠蘿蔔、白蘿蔔等。“我國曾經批準過抗病毒甜椒的商業化種植，但與常規甜椒相比，轉基因甜椒並沒有明顯優勢，因此被市場自然淘汰。”
吳剛說，在有些品種中，突變產生的顏色甚至取代了野生的顏色，成為栽培品種的主流，如原始的胡蘿蔔以紫色居多，現在最常見的橙色胡蘿蔔是荷蘭育種家根據荷蘭國旗顏色選育出的。因此，目前市場上在售的果蔬，其顏色跟轉基因沒有什麽關系。
王誌興解釋，棉花、辣椒、玉米、水稻等有不同顏色，是天然存在的遺傳基因差異，並非轉基因的結果。比如彩色棉花從古就有，但由於彩色棉花纖維短、強度差，過去很少種植，而現在因為不染色吸引了部分消費者，農民就開始種植了。彩色辣椒也是天然存在的，只是過去未大面積種植，普通消費者很少見到。
吳剛表示，以上這些瓜果蔬菜都是常規育種手段非常容易做到的，用轉基因反而是不經濟的做法。“常規育種主要通過選育獲得具有新性狀的新品種。這裏面很重要的壹個工作就是‘選’。自然發生的基因變異，往往也是隨機發生的。”吳剛解釋說，“無論大小、顏色，在自然界的自然突變體中，都可以找到。育種家做的工作僅僅是將這些突變體找到，並和其他好的性狀聚合到壹起，成為品種。”