他在《國史大綱》壹書中說:“為了創造壹種新的古代史觀，我們也應該稍微修正壹下我們的極端懷疑主義。”錢先生後來坦率地明確表示，他是在尋求真理，而不是盲目懷疑古史。
在此基礎上，我提出了壹個新的理論:“...我懷疑姚典、愚公和《易傳》。我離開莊周後，懷疑的比嚴剛還多。但是，我寧願用考古名，也不願懷疑古名。懷疑和信仰都要經過考驗，余。
就跟正氣凜然壹樣，沒什麽大區別。"[9]
錢穆《先秦諸子年譜》壹書考證秦漢古籍數十種，並大量引用雷學啟《竹書年譜證》，列舉先秦時期的事件順序。後來，他出版了《劉翔宇父子年譜》壹書。這本書以28條不通的論據駁斥了康有為的《新經偽經研究》，以至於當時沒有學者為康有為辯護，晚清以來影響巨大的經學與古文之爭也就此告壹段落。
錢穆對中國古代政治制度所依賴的文化抱有真誠的信仰，認為中國傳統政治不能簡單概括為“君主專制”，而實際上是“壹種適應國情的民主政治”。錢穆的徒弟余英時稱他為“壹生喚起故國之魂”。正是出於將中國傳統政治制度置於中國文明制度的框架中尋求客觀的理解，錢穆主張中國傳統政治制度應該在固有文明的真理基礎上重新審視，而不是事後批評和詆毀。