舊金山有計劃在Tuolumne河上修建大壩蓄水作為水庫，輿論開始對此施壓。赫奇·赫奇山谷將被封鎖，這壹計劃遭到了繆爾的強烈反對，他對赫奇·赫奇高度贊揚，甚至超過了約塞米蒂山谷。塞拉俱樂部的穆爾和羅伯特·安德伍德·約翰遜壹起反對山谷的洪水泛濫。穆爾甚至寫信給羅斯福總統，要求他停止這個項目。經過多年的爭論，公眾對該項目的看法兩極分化，羅斯福的繼任者伍德羅·威爾遜總統於6月5438+0913+2月19簽署了大壩建設法案。這場爭論的結果是，山谷被摧毀了，穆爾感到極度失落。
約翰·穆爾的遺產由他的曾孫邁克·穆爾繼承。他創立了壹個名為Access Adventure的組織，幫助身體殘疾的人坐在輪椅上進行戶外活動。紀念繆爾的命名:
●包括兩條繆爾小徑(位於加利福尼亞州和田納西州)。
●約翰·穆爾荒野(保護區)
穆爾小道附近的穆爾山
*穆爾冷杉林
加州穆爾海灘。
●約翰·穆爾中學
●約翰·穆爾學院
●蘇格蘭鄧巴的約翰·穆爾國家公園。
●東洛錫安的約翰繆爾路●還有小行星128523。
●1964年發行的美國約翰·繆爾紀念郵票。
●加州2005年發行的25美分日歷硬幣上刻有約翰·繆爾和加州禿鷹的形象。
●還有約塞米蒂國家公園的半穹頂巖壁。
●印第安納波利斯獎Lilly Medal的背面有穆爾的壹句名言，加州沙斯塔山上舊金山附近的穆爾森林。
●2006年6月6日65438+2月6日，加州州長施瓦辛格和妻子瑪利亞·施萊沃邀請約翰·繆爾到加州歷史、婦女和藝術博物館的加州名人堂..