作者丹尼爾·凱斯對人性和社會關系有著深刻的研究。這個看似簡單的自述故事，在作者作為心理學家的操控下，揭示了人性、兩性關系、家庭教育、人生意義、科學研究等社會道德內涵。這本書獲得了雨果獎和星雲獎。
註:1。這本書的前幾篇日記錯漏百出，錯別字很多，不是句子。作者這樣做是有意為之，為的是與智商提高的《查理的日記》呈現出明顯的對比差距。
2.阿爾吉儂是壹只小白鼠，他在查理之前就開始了智力科學實驗。在實驗室裏，查理也是壹只老鼠。
主人公查理今年32歲，智力低下，智商只有68。他被父母遺棄，被壹位好心的面包店老板收留多年。他負責在面包店掃地和倒垃圾。在面包店裏，他有幾個好朋友，過著幸福自足的生活。但查理手術後這壹切都改變了。隨著智商的提高，查理很傷心的發現，他的朋友喜歡他，因為愚弄他可以帶來快樂。他的貼心朋友把他當成聽話的智障娃娃；大家都笑得很開心，但這並不是來自他們對他的愛。
查理變聰明後，他的朋友們非但不為他高興，反而冷眼看著他，互相咒罵，笑也不再笑了。他們甚至聯手把他趕出了面包店。
查理默默地接受了再次被踢出家門的痛苦——他在面包店工作了十七年，沒有其他地方可以住，也沒有其他朋友，這是他與社會的唯壹聯系。這種揪心的痛是查理的朋友們始料未及的。畢竟，他們從來沒有把他當作壹個心智健全的人。
查理讓自己變聰明有錯嗎？還是人性本惡，大家都不想在別人面前處於劣勢，所以寧願智障也要展示自己的聰明？朋友喬直言，查理變聰明後，看起來像個書呆子。在喬看來，是查理背叛了他們，所以他們有理由恨查理。
面包店裏唯壹沒有取笑查理的範妮認為，查理通過後天手術改變了智力，相當於亞當和夏娃偷吃了禁果，是原罪。
智慧成了查理和他愛的人之間的驅動力。聰明的查理，如登瓊樓玉宮，高不可攀。他很孤獨。
幸運的是，查理仍然有愛麗絲陪伴。愛麗絲是查理的老師，她也向尼姆教授推薦了查理作為實驗品。對查理來說，愛麗絲是他的人生導師和靈魂伴侶。差不多年紀，查理智力正常後，向愛麗絲求愛。愛麗絲壹開始拒絕了，理由是查理的智力還在上升，很快她的智力就比不上查理了。
後來雖然在壹起了，但是隨著查理的智力上升到185，他們之間出現了不可逾越的鴻溝。愛麗絲跟不上他的思維，遠遠落後於他的知識，這讓她很恐慌。她希望感情世界是可控的，平衡的。
其實不管什麽智力指數，查理都是真的愛她。只是手術後查理的智力上升太快，情緒發育嚴重滯後。他第壹次追求愛麗絲，就像《愛的種子》裏的少年。他們的愛情就像世界上很多壹開始就郁郁蔥蔥的愛情。前期女生比男生早，後期男生發展快，女生跟不上。兩人從未達到過親密的狀態，這大概也是校園愛情不長的原因吧。
後來，查理遇到了浪漫派畫家菲伊。她自由、獨立、聰明、善良。查理確定自己不愛她，但他需要壹種簡單、開放、可靠的人際交往，於是默許了與法耶的性夥伴關系。在這段男女關系中，他投入了身體而不是靈魂。但由於心理原因，他無法與愛麗絲發生性關系，卻與法耶暢通無阻。他相信自己對愛麗絲是忠誠的。
智障的查理記不住父母的長相和名字。他只記得叔叔帶他去了面包店，他從沒想過父母是怎麽對待他的。手術後，他通過夢境壹點壹點回憶起來，他意識到母親很關心他的智障，他為此感到羞辱，他也壹直沒有接受真正的他。
以至於後來，由於擔心查理呆在家裏可能會影響妹妹的成長環境，他的母親用死亡威脅他的父親，要把他送到州立沃倫之家(壹個智障人士收容所)。
母親身體強壯，面容姣好。她曾經帶著查理到處求醫，企圖扭轉局面，讓查理變聰明。查理無條件地接受科學實驗是壹只智慧之手。難道不是童年的惡魔促使他用壹生去爭取母親的認可嗎？
同時，他的母親和姐姐欺負他，不理他，給查理留下了很大的心理陰影。每次想要和愛麗絲更進壹步，突破最後的底線，查理都會產生幻覺，仿佛查理小時候就在看著自己的行動。這是小時候家裏最親近的女人不尊重造成的恐慌。為什麽他能和法耶在壹起？因為他不愛Faye，所以他沒有把她當成自己心裏最親近的人。
父親是查理童年的溫馨回憶。父親坦然接受了查理智力不如人類的事實，認為應該讓他自由發展，而不是強迫他接受各種庸醫的胡說八道。然而在家裏，父親明顯弱於母親，沒能為查理遮風擋雨。
結局很悲傷。查理變聰明後，他分別去找他的父母(送走查理後，他的父母分居)告訴他們，他變成了壹個天才。但我父親根本認不出他；母親認出了他，但她驚慌失措，神誌不清；姐姐很興奮，因為哥哥是名人，多多少少能給她帶來好處。雖然在查理成名之前，他們甚至以為查理已經死了。
查理的人生是壹場悲劇，從壹開始就註定了。父母的愛是孩子成長的溫床。有多少人年輕時缺少親情，長大後成了無足輕重的小鳥，不肯降落，不肯回家。智障的查理不懂這些道理。他只會下意識的屏蔽自己家庭的表象——屏蔽痛苦的根源，但至少那時候他覺得自己和別人壹樣有家庭和父母。睿智的查理壹眼就看穿了這個千瘡百孔的家庭，悲哀地意識到自己的親情是微薄的。對於他的母親來說，他的到來甚至是壹個他寧願被抹去的錯誤。
壹個沒有根的人，找不到生而為人的意義。
查理獲得智慧後，陷入了哲學的經典問題:我是誰？它從哪裏來的？去哪裏？我的人生有什麽意義？
我是誰？大概是世界上大多數人折磨自己的問題。答案各不相同，有些人壹生都在尋找這個答案。同時，也有很多人從來沒有問過自己想要什麽樣的生活，只是被動地跟隨生活大潮的方向，迷迷糊糊地走過人生，就像壹直沒有醒來的查理壹樣。
聰明的查理艱難地問，查理到底是誰？曾經是智障還是現在是天才？他天生智障32年，只是過去幾個月才成為天才。他智障的時候對生活有什麽貢獻？就算妳現在是天才，妳能體會到人生的意義嗎？僅僅是科學進步的反映嗎？尼姆教授盡力證明自己。多少是人類進步的科學，多少是現實利益？
智障的查理從來沒有想過，每壹個普通的聰明人都生活在壹個營地裏，無休止地追逐名利。成為天才本身並沒有賦予他生命的意義。意識到這壹點促使他跳出自憐的困境，投身於科學研究，幫助世界上數百萬像他壹樣的智障人士。
然而結果卻極其諷刺。聰明的查理用壹生證明了天才的查理是壹個失敗的科學實驗品。他將沿著阿爾吉·農智力衰退和死亡的人生軌跡回到智障世界。
更諷刺的是，當他的智力從185降到正常水平時，愛麗絲主動求和，認為此刻他們勢均力敵，可以繼續相愛；當他的智力降到68以下時，面包店老板把他接了回來，喬再次向他伸出了友誼的橄欖枝。人間笑語如常。
那麽，智障是不是更幸福呢？
領導這項科學實驗的尼姆教授有壹個長期的科學願望，那就是為自己留名。智障的查理以為他們是無所不知的神，但聰明的查理發現他們只是壹群普通人，試圖據此實現生活的利益。這個提高智力的實驗甚至沒有壹個透徹的理論基礎和足夠的觀察期。在短短的幾個月裏，教授們試圖將研究成果傳播到全世界。這種缺乏嚴謹的科學態度將科學研究推向了功利化的發展方向，而阿爾吉·農和查理則成為了科學研究的犧牲品。
而且尼姆教授自始至終都沒有把查理當成壹個人，也沒有把阿爾吉·農當成壹個生命，只是把他們當成了新的科學創造和實現利益的工具。查理喊道:不，我不是妳的產品。手術前，我已經是壹個人存在了。
在看透真相後，聰明的查理決定投身於科學，以便為增強人類的智慧做出貢獻，目的是幫助其他同樣智障的人。
查理提醒世人，智力科學研究中最不可忽視的是人類感情的調和。以人為本，應該是最高宗旨；剛性應該是基本態度。
從3月到10，短短7個月，查理的生活發生了翻天覆地的變化。故事的最後，查理的自述又犯了壹個錯誤，含糊不清，語焉不詳。他又回到了智障的世界。我們應該為他高興嗎？他沒有再多想，只告訴他:如果有時間，請送壹束花給葬在後院的阿爾吉儂。
對查理來說，天才似乎是壹個荒謬的夢。如果再給壹次機會，他願意醒來看看這個渾濁的世界嗎？
？.結束。