克爾凱郭爾出生在哥本哈根的壹個富裕家庭，是所有兄弟姐妹中最小的壹個。克爾凱郭爾的父親早年是個鄉下農民。後來他白手起家，成了城裏的暴發戶。他娶了壹個有錢人的女兒，成為哥本哈根的上流社會的壹員。後來，他的妻子去世，克爾凱郭爾的父親娶了另壹個女人，並在晚年得到了他的小兒子索倫·克爾凱郭爾。
克爾凱郭爾的父親是虔誠的基督徒(所有丹麥人壹出生就自動成為路德教徒)。他沒受過什麽正規教育，但他勤奮自學。他很憂郁，他深信自己早年的不敬虔行為受到了上帝的詛咒(而克爾凱郭爾的大多數兄弟姐妹都不會活到三十四歲——那是耶穌被釘死在十字架上的年齡)，他對克爾凱郭爾的管教非常嚴格，尤其是宗教教育。克爾凱郭爾深受父親的影響。另壹方面，克爾凱郭爾從小生活富裕，但體弱多病，與哥哥相處不好。種種因素造成了克爾凱郭爾憂郁的性格。
從65438年到0830年，克爾凱郭爾開始學習心理學和哲學，並在次年開始準備神學學位。但在1834年，他的宗教信仰陷入低潮，生活變得頹廢，直到1838才恢復過來。1840年完成學位考試，同年向雷金·奧爾森求婚，1841年獲得相當於其他系博士學位的哲學碩士學位。
1841年，克爾凱郭爾覺得自己無法擺脫抑郁癥，更談不上擁有幸福的婚姻，於是最終決定與魏珍妮解除婚約。這對他以後的創作生涯影響深遠。
後來，他成為壹名活躍的作家，用不同的筆名發表了許多不同的文學和哲學作品。終其壹生，他強烈反對當時被命令的黑格爾哲學，致力於對神學的反思。
克爾凱郭爾於1855年死於哥本哈根的壹家醫院。臨終時，他拒絕接受丹麥國家教會的聖餐，也不讓教會參加其葬禮。
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