清朝康熙年間(1661—1722)，有二十多個文字獄。其中，莊婷的《明史》案最為觸目驚心，發生在大臣輔政時期(1661-1669)。1711戴名世南山收藏案。總的來說，康熙年間對知識分子采取了軟化寬容的政策，統治者並沒有把文字獄作為壓制反清知識分子或漢族文人思想的自覺政策。顧當時出版的詩集、散文集和王夫之的《資治通鑒》都帶有明顯的強烈的民族情緒，沒有受到考察。
雍正帝在位時間(1723-1735)較短，記錄在案的有近20起。雍正即位初期，作為統治集團內部權力鬥爭的副產品，出現了幾次文字獄；雍正後期，幾次文字獄轉而打壓漢族知識分子的反清思想和民族氣節。雍正即位之初，就以“親信”的罪名，多次提拔大禹，懲罰八帝、九帝等爭奪皇位的宿敵，年羹堯、隆科多等霸氣大臣，以及形成柯家小集團的漢人官員。雍正六年(1728)，湖南學者曾靜、張西策動陜甘總督嶽鐘琪造反，引發了曾靜文字獄大案——呂留良案。此後，文字獄出現了兩種新動向:壹是有意識地把文字獄作為壓制漢族知識分子民族意識和民族氣節的重要手段；二是控訴蜜蜂，大部分文字獄都是自下而上養的。壹些地方官員把找出禁忌語作為贏得信任的方法。
乾隆年間(1735—1795)，發生了100多起文字獄，尤其是乾隆中期，是中國網站最密集、三朝文學災難最多的時期。乾隆大興文字獄的目的是徹底消除漢人的反清民族意識。事實上，文字獄的受害者大多沒有傳播反清思想。有的人只是表達了壹絲對剃發更衣的不滿，壹些對明朝的眷戀，對自身處境的哀嘆。更多的受害者純粹是統治者貪圖文學，牽強附會，捕風捉影的結果。乾隆朝的文字獄達到了瘋狂、殘酷、荒謬的地步。魯迅先生曾經對清朝的文字獄有過精辟的總結:人們壹直以為文字的詛咒來源於嘲笑和詛咒清朝，其實並不盡然。有的不計後果；有的是瘋狂；有的鄉村歌曲迂腐儒雅，真不知禁忌；還有的是在野的無知之輩，真正關心皇室的...
文字獄的危害:(1)對思想、文化、士人風氣有不良影響。龔自珍名言，“怕聽到文字獄，寫書只為飯飯。”大意是“言語中聽到文字獄，嚇得馬上躲起來，文人以著書為生，不敢發表意見。”這是清朝文字獄後果的真實寫照。讀書和寫作總是遇到麻煩，所以學者不得不失去他們的思想和完整性，或者堅持八股和背誦孔子，孟子，朱成的教義，以進入科舉考試。或者遠離敏感的學術領域和現實，把全部精力投入到訓詁和考證上，史稱幹嘉之學。(2)文字獄敗壞了官場風氣。清朝大部分官員都考上了科舉。作為文人，他們可能成為文字獄的犧牲品；作為官僚，他們也是文字獄的制造者或幫兇。壹方面，他們不想觸網而死；另壹方面，我也不想因為沒有有效執行皇帝的詔書，不能嚴格追究寫作的責任而被定罪。於是他們不得不朝著謹小慎微，沒有思想，沒有節操的方向發展。