反擊的第壹槍從外星人建立的行星軌道基地打響。巡洋艦多恩黑暗神殿之怒利用其高速和強大的火力向基地推進，利用登陸艙和雷鷹突破基地外層，直奔目標普萊姆空間站。最終，要塞主人福柯的軍團成功取得了領先。
普利姆斯利的消防戰士充分利用空間站的走廊實施了伏擊。但黑暗聖堂武士團隊分散開來，從多個方向突破，用手榴彈和鏈鋸撕裂空間站的墻壁，從而包抄並粉碎了那些不擅長近戰的頑固外星人。
打通了軌道站的炮控室後，海軍陸戰隊立即在帝國海軍的協同突襲下，利用軌道站上的炮摧毀了剩余的軌道空間站。
與此同時，極限軍團攻入了散落在寧波的鈦堡壘，摧毀了防空炮塔，幹凈利落地處理了鈦指揮官。這場戰鬥以帝國的徹底勝利而告終。
寧波薩紀念旗:雖然鈦人擁有先進的技術，給帝國造成了巨大的損失，但黑暗神殿堅定而無情地重申著帝國的教義:人類是這個星系中最完美的生物，其他外星人只有被消滅的命運。
傑魯拉斯聖戰由最高元帥魯多度斯於645.M39年發起，正是在這場戰役中，首次使用了掠地十字軍。傑魯斯是壹個已經滅絕很久的星系，最後被帝國重新發現。帝國為合並這些世界做出了努力，但由於銀河系長期以來相當繁榮獨立，對帝國的合並請求嗤之以鼻。被派去傳播人類大世界統壹思想的傳教士甚至被殺害。不久，更多的牧師來到了，但這壹次他們的布道得到了黑暗聖堂武士的支持。
聖戰使周圍的世界屈服，並孤立了傑魯拉斯星系的首都傑魯拉斯星球。星球是高度強化的巢穴首都世界，每壹次對黑暗神殿的圍攻都有不小的損失。
聖戰最終演變成了攻城，神廟的攻城能力還不如其母帝國的拳頭。守軍叫囂他們的堡壘是大賢者戰爭時Logo Donne親自設計的，這更加激怒了黑暗神殿，讓他們下定決心贏得這場勝利。最後，他們發現了古老的科學含義，技術軍士西瑪格斯開發了蘭德攻擊者十字軍。這種新型蘭德襲擊者讓聖戰軍撕開防線，挺進巢穴首都。最後，所有的巢穴都被占領或者投降了。
傑魯拉斯紀念旗:在傑魯拉斯城被攻破的那壹天，黑暗神殿按照世界古老的法律處決了1%的反抗者。旗幟上的劍代表最高元帥魯多度斯，被絞死的骷髏代表被處決的叛軍。
昏庸的內政部最高領主郭戈·範迪爾自稱是天主教會和內政部的最高領袖，開始了著名的“血腥統治”，數百萬人因這家夥的偏執而慘遭屠殺。殘酷的鎮壓和瘋狂的屠夫是他統治的標誌，直到塞巴斯蒂安·托爾，壹個神聖的人物，重新團結了那些仍然對範迪耶有堅定信念的人。在此期間，黑暗神殿很少關註帝國的事務，而當聖戰艦隊返回太平星域時，發現戰士的占領世界在軌道上被轟炸，範迪爾的叛亂得到了充分的證實。最高元帥Sekinandus宣布對Fandier發動聖戰，與母親帝國的拳頭，火鷹，靈魂飲者和火星技術守衛壹起，但黑暗神殿獨自攻擊地球。
幾個月來，混合軍圍攻聖公會教堂毫無進展，直到皇帝冠軍納維爾在外墻上破了壹個缺口。戰鬥很激烈。團旗手倒下，內維爾自己扛著聖物，帶領部隊從缺口處勝利。戰鬥結束後，帝國拳王拉澤蘭授予納維爾連長的頭銜，以表彰他無與倫比的勇氣。在攻下外墻後，忠於皇帝的軍隊開始了攻占宮殿內部區域的戰鬥，這在荷魯斯反叛後從未發生過。當皇帝新娘的領袖艾麗西婭·多米尼克殺死範迪時，圍攻結束了。範迪爾死後，塞巴斯蒂安·托爾成為英國聖公會的主教，塞基納多斯帶領他從太平星域帶來的士兵繼續鎮壓皇帝的敵人。雖然範迪爾的死結束了血腥統治的時期，但叛教時期持續了幾個世紀，塞基納多斯用余生消滅了那些背叛皇帝的人。
聖地榮譽旗:在榮譽旗上描繪聖地是任何其他皇權都無法夢想的無比榮耀，暗黑破壞神神殿的冠軍——皇帝，就享有這份獨壹無二的榮耀。雙頭鷹所束縛的國教象征代表皇帝和新娘，也暗示宗教必須服從和低於帝國的意誌。
在向佩拉貢星座的刺客聯盟宣戰後，最高元帥魯多度斯與惡魔聯盟成員範·庫爾魯斯的宮廷部隊以及壹支來自血色玫瑰姐妹的軍隊並肩作戰。他們追蹤刺客聯盟到了佩拉貢四號，這是壹個多山山谷中有熔巖的星球。最初的登錄遇到了零星的抵抗，但最終，黑暗神殿(包括年輕的新信徒赫爾布·萊茨)和姐妹們將刺客部隊擊退到了他們的神殿，壹座位於活火山中間的建築。魯多度斯迅速猛攻火山的堡壘，他的劍兄們奪下大門，繼續防守，直到帝國軍突破防線。當黑暗聖堂武士和修女像風暴壹樣湧入柱狀火山。範·庫爾魯斯法官與刺客的導師對峙並殺死了他，但他受了重傷。
然而，這壹切只是他毀滅的開始。當刺客導師的力量下降時，他開始顯示出惡魔的力量。壹道黑光過後，惡魔的力量控制了虛弱的法官。壹個強大的虐待狂惡魔控制了法官的身體，轉過頭開始對付他曾經的盟友，瞬間殺死了十二個兄弟。最高元帥盧杜多斯，皇帝冠軍尤裏卡和牧師傑西面對著名的怪物名為火與血的戰爭。忍受著劇烈的疼痛，這些英雄們以巨大的力量和堅定的意誌與之抗爭，但似乎魔鬼的力量似乎更大。無奈之下，盧杜多斯將壹個裝滿揮發性聖油和烈性炸藥的安蒂拉聖球扔進了熔巖中。爆炸撕裂了整個表面並引發了劇烈的地震，巖石和柱子湧入沸騰的底部。被控制的法官掉入巖漿中，帝國士兵迅速逃離現場，避免與敵人壹同葬身火海。雷鷹炮艇冒著猛烈的噴發迎接剩下的修女和黑暗神殿。雖然許多炮艇後來消失在火山塵和霧中，但大多數部隊得以逃脫。為了確保沒有惡魔和信徒的痕跡，盧杜多斯下令對地表進行不間斷的軌道轟炸，直到它撕開，將整個地表淹沒在巖漿之下。
範·庫爾魯斯紀念旗:這個被殺死的怪物先後擁有刺客長老和惡魔法官。雖然他們曾經是皇帝忠誠的仆人，但被玷汙的人永遠不會被審判。破碎的表面和沸騰的地幔表明這顆行星在黑暗神殿強大艦隊的炮火下支離破碎。在壹個自稱“聖軍”的組織控制了位於Odimaxingyu的長期不為人知的巢穴世界Rasteay之後，他們進行了壹次大清洗，哪怕是最輕微的變異都被消滅了，整個世界被壹種基因病毒徹底洗禮，只有最純粹的人類幸存了下來。經過這次“凈化”，654.38+0.4億人口的巢穴只剩下250萬居民。
從那以後，拉斯特拉成了聖地。幾個世紀以來，人們見證了異端山和純凈平原。前者滿是變異體，後者滿是聖光。在阿薩拉從事聖戰的基弗哈特元帥來到這個世界，見證了純潔的奇跡。然而，當他發現這裏有血腥的人祭時，元帥立即下令在聖戰開始前將世界徹底清洗壹遍，與人祭無關的居民被赦免而死，這也為基弗哈特元帥在過去幾年中受到的感激埋下了伏筆。
拉斯特萊蒂紀念旗:這面旗代表在異端山上，那些殺害無辜的血腥暴徒被基弗哈特元帥燒死在火刑柱上。通過這壹行動，苦難的世界又壹次回歸了皇帝的聖光。
最高元帥赫爾布·萊茨和三支黑暗神殿的十字軍應邀前來援救阿米登。奧凱的領袖格茲庫爾·馬格·烏魯克·瑟拉卡領導了有史以來最大的waaaaaaaaagh！被包圍的星系和世界很快在奧克的入侵下淪陷。雖然阿米登的艦隊盡了最大努力阻止奧克人的入侵，但入侵規模太大，無法阻止。黑暗神殿在阿米登進行了壹場妳死我活的戰鬥，但他們最大的成就是在太空中取得的。
阿米登紀念旗:被斬首的骷髏象征戰敗的種族——奧克，大鐵十字黑劍代表黑暗神殿的最高元帥，右下角的七星圖形代表阿米登世界。
在基茨莫特！攻勢之下，杜克雷星系的所有世界在壹夜之間淪陷。赤紅之拳很快被派去對付奧克入侵者。到達後，該團立即采用打了就跑的戰術，取得了巨大的戰果。
然而在Oke開始全面入侵後，緋紅拳開始撤退。他們需要緊急支援。龐大的Oke部隊指向了無價的Ducray鑄造世界和上面密集的人口。帝國不能容忍這些星球落入野獸手中。附近的黑暗神殿立刻投入戰鬥，隨即，戰事再次陷入僵局。在杜克雷ⅶ號上，銀河系的命運危在旦夕。
基茨莫特最終在貧瘠的平原上被壹個皇帝冠軍殺死。沒有了指揮官，基茨莫特的部隊失去了中心，迅速棄兵而逃。自此，戰役進入掃蕩階段。緋紅拳和黑暗神殿在戰鬥中往往會陷入壹對五的局面。然而兩人都在戰場上獲得了榮譽，成為了杜克雷永遠的英雄。
基茨莫特榮譽旗:罕見的兩個戰爭團的榮譽旗，表示同壹個母團的兩個戰爭團長久以來的特殊關系。
加州二中壹個小而危險的宗教團體必須被消滅。在被異端法庭調查並移交給死神衛調查後，發現由於壹個基因領主的滲透，Setus的巢穴首府已經有大量居民被感染。這種雜交將對整個人類世界的精神和身體產生多年的影響。
顯然，Setus的巢穴已經成為了可怕的Tyrone先鋒的登陸地。必須清除外星人的影響，凈化所有巢穴。黑暗神殿應該以正義之怒要求皇帝之光再次照耀塞塔斯的巢穴首都。
吉恩·畢曉普和他的追隨者藏在巢穴首都的黑暗深處。找到並摧毀它需要很長時間。管道、道路、隧道和被遺忘的城市組成的迷宮，成為壹個充滿死亡的獨特戰場。黑暗聖堂武士在這條狹長的走廊裏不斷與泰龍蟲群戰鬥。以緩慢而巨大的代價，每個地區都被徹底清理了。在暗黑破壞神神廟的努力下，Setus Nest Capital和California II轉危為安。
賽圖斯紀念旗:在高聳的巢穴首都，勇敢的騎士們表演著古老的屠殺史詩，雖然大多數戰鬥都在巢穴首都的地下進行。
在瓊尼德聖戰中，黑暗聖堂武士受到審判法庭的邀請，幫助其奪回壹些重要信息和聖物。
在喬納德星球上有壹個帝國研究中心，那裏有無數的機械信徒在為帝國海軍工作，比如螺旋槳或者激光炮的研發。這個研究和發展所有的秘密創造和聖物，以及可能導致黑暗異端的東西。在沒有任何警告的情況下，Jonaide所在的城市爆發了公開叛亂，對當地居民和研究機構構成了嚴重威脅。
後來發現這是因為壹些潛在的心靈術士被混亂和謊言的不純力量欺騙了，他們用虛空引擎在現實世界中打開了壹扇虛空之門。壹年時間，75%的人口變得混亂並組成了軍隊，與混亂的惡魔和其他混亂的生物展開了攻擊。
在奪回世界的常規手段失敗後，審判法庭發布了滅絕令。然而，在執行滅絕命令之前，黑暗神殿的部署部隊奪回了未被汙染的文件和帝國人員。
橋奈德紀念旗:另壹個輝煌的榮耀。黑暗神殿騎著“光矛”和“旋風”的火焰，奪回了重要的物資和人員。在獲救者的眼中，他們是推動火焰的拯救天使。壹支黑暗靈族攻擊部隊占領了壹個綽號為“森特拉提之眼”的大型防禦空間站，並將其人員變為奴隸，將武器瞄準了森特拉提上的世界，殺死了星球表面的數千人。
然而，黑暗靈族沒有註意到暗黑神殿的戰艦出現在軌道上。當黑暗神殿接收到防禦平臺傳來的三維傳輸圖像，並檢測到大量能量射向地表時，他們正好在星球的另壹邊。
黑暗聖堂武士以他們的方式突襲了空間站，但令他們驚訝的是，他們面對的不僅是黑暗的艾爾達，還有艾爾達軍隊。兩支軍隊正在互相開火。黑暗聖堂武士對此並不以為然，他們同時與兩個外星種族作戰，並在接下來的幾個月裏將他們全部消滅。行星空間站再次被奪回，行星表面的異形被徹底消滅。
Centrati紀念旗:無畏騎士再壹次用皇帝的鐵腕捍衛了他的世界。手持盾牌的鐵騎士立場堅定，象征著不朽。作為死亡天使，艾琳·布羅克維奇的帝國精神將把他的火焰帶到每個人類世界。