以FF7遊戲剛開始的時間計算，薩菲羅斯在尼布爾海姆執行調查魔晄爐的任務，在親眼見到被魔晄浸泡的人類後開始對自己的身世抱有疑問。之後他查閱了大量的文獻資料，終於明白自己並非人類的後代，而是傑諾瓦（Jenova）計劃的產物。由於文獻資料有誤，他將傑諾瓦（Jenova）和古代種賽特拉誤認為同壹種生物。他開始憎恨人類，誓要將本來屬於古代種的星球從人類的手中奪回來。
之後，在古代種神殿的生命泉中，吸收了泉中知識的薩菲羅斯終於認清了傑諾瓦和古代種的區別，並且得知自己竟然是露克蕾西亞的兒子，懷著對人類極度的憎恨和內心的扭曲，從此走上了滅世之道。 雖然在兩年前被克勞德打敗，隕石計劃也被生命之泉(Life stream)阻止，但這並不等於他完全失敗，因為傑諾瓦（Jenova）並沒有完全被消滅。“即使是被打得支離破碎，傑諾瓦（Jenova）身體的每壹部分最後仍舊能重聚（Reunion）到壹起。”寶條的預言能實現嗎？ 在遊戲故事結束兩年後（FF7 AC中），傑諾瓦（Jenova）的思念體——迷之三人組：卡丹裘（kadaj）、羅茲（loz）、雅祖（yazoo）奪得了大空洞中的傑諾瓦（Jenova）的頭並成功合體，令薩菲羅斯復活，並與克勞德進行了戰鬥，最終薩菲羅斯被打敗，隨著自己身體的消失，說出了那句名言：“我，是不會成為回憶的。”