能海上師求法回到成都後，能海上師在成都東郊的近慈寺開始弘揚格魯派大乘法。格魯派的根本傳承上師是宗喀吧大師，大師以“皈依三寶、發菩提心、自利利他、正法久法。”的道風征服過整個藏傳佛教中的各各派別，其法承主要思想是依《菩提道次第廣論》和《密宗道次第廣論》，昭覺寺主修的密法為《大威德金剛》的傳承。
能海上師的法傳弟子清定上師，原是國民黨重慶站政治部的中將主任，才到當時國民黨的腐敗便憤然出家修學佛法，後因蔣介石不時的來求清定上師還俗，便由剃度師重慶的澄壹老法師親自出面向成都的昭覺寺為清定上師專門討藏經樓的單，這樣清定上師便住進了昭覺寺的藏經樓，憑借當時川東、川西兩處微妙的政治、軍事關系得以安身昭覺寺，後來又從能海上師學習藏傳密法。壹九五二年因歷史問題入獄，上世紀七十年代平反出獄，後因恢復昭覺寺又將清定上師請回來主持恢復和修建，密法就在昭覺寺紮下了根。清定上師在修建了密宗殿傳播密法的同時，又恢復了昭覺寺的禪堂，至今在昭覺寺的禪堂門口裏面的石碑上，還留有清定上師寫下的“空、寂、圓、明。”四個大字！清定上師圓寂後，這壹法門在清定上師的家鄉浙江省三門縣多寶寺得到了發揚光大，至今仍就正法住世！
和慈清大和尚回到成都後，便到成都市文殊院任住持方丈，其弟子濟塵大師便隱遁在成都西北郊彭州市（原彭縣）九峰山地區潛修，後來在銀廠溝建接引寺，在九隴建佛山古寺，濟塵大師在佛山古寺大傳穢跡金剛法，大師圓寂後其弟子廣悟師住持佛山古寺！
三千大千世界變幻無常，佛法便在這變幻之中隨緣度化眾生！