薩迦寺，坐落於西藏自治區薩迦縣奔波山上，是藏傳佛教薩迦派的主寺。1961年被國務院定為全國重點文物保護單位。“薩迦”系藏語音譯，意為灰白土。公元1073年（北宋熙寧六年），吐蕃貴族昆氏家族的後裔昆·貢卻傑布（1034～1102）發現奔波山南側的－山坡，土呈白色，有光澤，現瑞相，即出資建起薩迦寺，逐漸形成薩迦派。薩迦寺用象征文殊菩薩的紅色，象征觀音菩薩的白色和象征金剛手菩薩的青色來塗抹寺墻，所以薩迦派又俗稱為“花教”。
薩迦派采取血統和法統兩種傳承方式。貢卻傑面卒後，其子貢噶寧布（1092－1158）主持薩迦寺。貢噶寧布學識淵博，使薩迦教法趨於完整，被尊稱為“薩欽”（薩迦大師），為該派初祖。貢噶寧布的次子索南防摩為薩迦二祖。三子紮巴堅贊主持薩迦寺57年，為三祖。四子貝欽沃布的長子薩班貢噶堅贊（1182－1251）是薩迦派著名的人物，也簡稱薩班，或薩迦班智達，是為四祖。
公元13世紀初期，以成吉思汗為首的蒙古部落興起，用武力統壹了中原。1240年元朝闊端進兵西藏前，欲召見在各教派中聲譽較高的薩班貢噶堅贊。1244年薩班貢噶堅贊率侄子八思巴（1235－1280）去涼州（今甘肅武威），1247年在涼州會見闊端，並寫信說服西藏各派高僧和貴族接受了元朝的對藏條件，把西藏正式納入了祖國的版圖。忽必烈統壹全中國，建立元朝中央政府後，封八思巴為“帝師”賜玉印“命統天下釋教”，即管理全國佛教事務，並協助中央政府管理西藏，統領西藏十三萬戶，八思巴遵忽必烈所囑，在西藏清查戶口，制定法律，於1268年在薩迦正式建立起與中國其它行省相同結構的地方政權，八思巴成為隸屬於元朝中央政府的西藏地方行政長官，薩迦派勢力達到鼎盛時期。
14世紀後半葉，隨著元朝的滅亡，薩迦派在西藏的地位被噶舉派取代，但該派仍然維持下來。
薩迦派不禁娶妻，以道果教授為主要修法。薩迦派對發展藏族文化起過重要的作用。薩迦派協助元朝統領西藏時期，西藏結束了400多年的戰亂局面，社會生產得到發展，文化藝術出現了繁榮局面，當時薩迦派的壹些高僧在文學和史學方面都有不少的譯著和作品留傳下來，如薩班的《薩迦格言》、八思巴的《彰所知論》都是影響深遠的名著。八思巴奉忽必烈之命創制的蒙古新字，亦稱八思巴字，在中國文字史上占有重要地位。
薩迦寺建築在仲曲河兩岸，故稱薩迦南寺和薩迦北寺，全寺***有40余個建築單元，是壹座規模宏偉的寺院建築群。公元1073年貢卻傑布初建薩迦北寺時，結構簡陋，規模很小。後經薩迦歷代法王在山坡上下不斷擴建，加蓋金頂，增加了許多建築物從而形成了逶迤重疊、規模宏大的建築群。八思巴被元中央政府封為“帝師”，統領西藏後，薩迦北寺又成為西藏地方政權機關所在地。
薩迦南寺是公元1268年八思巴委托薩迦本欽（薩迦本欽是元朝時西藏薩迦地方政權的首席官員）釋迦桑布主持興建的，當時壹些漢族工匠也參加了施工，後屢次擴建整修，氣墊宏偉，平面呈方形，高墻環繞，總面積14760平方米。
薩迦南寺基本上仿照漢區古代城池樣式，是具有很好防禦性能的堅固城堡，護墻河至今仍依稀可辨。城堡內為殿堂僧舍。大經堂總面積5775平方米，正殿由40根巨大的木柱支撐直通房頂，最粗的木柱直徑約1．5米，細的也有1米左右。其中前排中間的話根柱子，被稱為四大名柱，即“元朝皇帝柱”（據傳為忽必烈所賜）、猛虎柱（相傳此柱由壹猛虎負載而來）、野牛柱（相傳此柱為壹野牦牛用角頂載而來）、黑血柱（相傳是海神送來的流血之柱）。正殿高約10米，大廳可容納近萬名喇嘛誦經，內供三世佛、薩迦班智達及八思巴塑像。薩迦寺另壹重要殿堂為歐東拉康，內有11座薩迦法王靈塔，殿內墻上繪有八思巴早年的畫像和修建薩迦寺的壁畫。殿後堂有反映西藏歷史上的重要事件即薩班與闊端會晤的壁畫。歐東拉康的南側有座“普康”，是該寺修密的宗僧人誦“普巴（多見橛）經”的處所。
從南寺大殿出來，經廊道而至前院，再沿數十級長梯，即可到大殿頂層。平臺的西、南兩面有寬敞的長廊，廊墻上繪有珍貴壁畫，南壁繪有薩迦祖師像，西劈繪有大型曼陀羅（壇城）。
薩迦南寺曾經過多次維修，特別是在1948年的大修中，局部有較大的改變，在大殿前增加了壹些附屬建築物，大殿內的木板壁改成了泥墻，重繪了不少壁畫，尤其是把圍墻上開有垛口的女兒墻改成西藏形式的平合檐等。但從整體上看，南寺融藏漢建築風格於壹體，是藏式平川式寺廟建築的代表。
薩迦王朝當政時期是政教合壹的地方政權。因些，薩迦寺除了具有規模宏大的寺院外，還有壹些官署府邸之類的建築。公元1265年八思巴回薩迦寺時，為他自己建立了壹個“喇讓”，專門管理他的私人財物和有關事宜。八思巴死後，傳至貢噶洛珠堅贊時（14世紀前半期），薩迦昆氏家族分裂為4個“喇讓”（“喇讓”原指西藏宗教領袖的住所，後演變為宗教領袖辦理政教事務的機構），“喇讓”則以父子相承，而薩迦法王的寶座則由這4個“喇讓”輪流繼任。這4個“喇讓”為：細脫喇讓、拉康喇讓、仁欽崗喇讓和都卻喇讓。
細脫喇讓的建築為壹長56．6米寬40米的長方形四合院，高四層***16．3米。原來是八思巴任法王時管理衛藏十三萬戶時的官邸，後來壹直是薩迦王朝的政府所在地，最後成為四大喇讓之壹。
拉康喇讓的建築原是八思巴圓寂的地方，在薩迦南寺大經堂右側城堡內，有三樓壹頂，高與大殿差不多，後為四大喇讓之壹。
仁欽崗和都卻兩個喇讓，均為八思巴時代的建築，具有相當規模。至15世紀時，三個喇讓絕嗣，而都卻喇讓的阿旺貢噶仁欽和白瑪頓堆旺久兄弟，為了爭奪薩迦法王的王位，發生矛盾，互不相讓，於是分別建立彭措頗章和卓瑪頗章兩房，薩迦法王就分別由這兩房中的長子輪流擔任。他們的宮殿建築當然也是薩迦寺院建築的重要組成部分。
薩迦寺從建寺至今已有900多年的歷史，其間薩迦王朝統治全藏70余年，寺內所藏文物極其豐富，其中尤以經書最為著名。薩迦寺的圖書資料集中在三個地方，即北寺的“烏則”、“古絨”的藏書室和南寺的大殿，藏書的總數約有24000函左右。“烏則”為該寺最早的藏書室，據說在八思巴以前就放滿了圖書，八思巴時代也有少量的珍本藏入該室。該室除藏有大量古藏文抄本外，還有為數不少的梵文貝葉經和漢文經卷。這些經書部部都由金汁、銀汁、朱砂或墨汁精工寫成。南寺大殿的藏書數量最多，據說這裏的書籍是八思巴任法王時集中了全藏的書寫家抄寫的。“古絨”藏書室內的絕大部分藏書也是手抄本。其書寫時代可能稍晚於“烏則”和南寺大殿。此外，這裏還藏有壹部明永樂八年附有禦制後序的內地印制《華嚴經》。北寺“古絨”藏有天文、歷算、醫藥、文學、歷史等方面的藏文書籍3000函，其中很多是宋、元、明各代的手抄本和稿本，而且多為歷代法王批註校釋過的珍本。現在保存完好而又為人們特別珍視的要算南寺大殿法墻中的藏書，大殿後部和左右兩側靠墻處為通壁大書架，架上擺滿了經文典籍，大小版本約有2萬余函，其中最大壹部名為“八千頌鐵環本”經書，長1．31米寬1．12米。這些經典中有的珍本和孤本，是極為寶貴的文化遺產。因此，有些學者認為薩迦的藏書和壁畫可以同敦煌相比美，稱之為第二敦煌。除這三個較大的藏書室外，其它小殿和兩個法王的頗章內，也有為數不少的抄本和印本書籍。
除些之外，薩迦寺還存有歷史檔案文件十作箱，據說其中有不省是薩迦派執政時期的重要文件，其它多系烏拉差役、稅收、封文、民間訴訟之類的文件，是研究西藏土封建農奴制度的珍貴資料。此外，薩迦寺還藏有印版2000余塊，其中有“薩迦歷代史略”、“薩迦教主法王傳記”、“薩迦傳法記”等頗有價值的印版。
薩迦寺的歷史文物非常豐富，作為西藏地方和中央政府關系的歷史見證，保存有元代中央政府給薩迦地方官員的封誥、印璽、冠戴、服飾；有宋元以來的各種佛像、法哭、刺繡、供品、瓷器以及法王遺物等。其中年代悠久、制造精美、價值很高的文物有兩顆印，壹為玉質梵文印，壹為銅質刻有漢、藏、蒙三種文字的三體印，上面刻有漢文“成化二十壹年九月禮部造”字樣。據不完全統計，薩迦寺的各種佛像約有兩萬多尊，其中很多系元、明以來的珍貴文物，其中鑄有“大明永樂年施”款識的銅佛有數十尊。薩迦寺有四件珍奇的寶物，即貢布古如（由竹青白瓦巴從印度請來的依怙神像膠）、朗結曲丹（由大譯師帕白洛紮瓦修建的佛塔，塔裏經常出水，被視為神水）、文殊菩薩像（系薩班的本尊像，據說在像前念七天文殊經就能打開智慧之門）、玉卡姆度母像（八思巴供奉的本尊佛像），四大奇寶中三件是佛像。薩迦寺的鎮寺之寶是當年忽必烈送給八思巴的壹個黑木匣子，匣中有壹只碩大的白皮書海螺，寺中僧人視其勝於生命，只有宗教吉日才開啟木匣，捧出海螺由高僧吹奏。薩迦寺收藏的各種瓷器約有2000余件，其中多為元、明時期的瓷器，也有少量宋瓷。唐卡和壁畫是西藏寺院繪畫藝術的兩大奇葩，薩迦寺僅唐卡就存有3000余幅，據鑒定，宋、元、明時期的珍貴唐卡有360余幅。薩迦寺壁畫色彩鮮艷、形象生動，除了宗教內容外，壁畫還記錄了八思巴來往內地和西藏，在北京受封等場面。薩迦寺藏有薩班的袈裟壹件，翠紅金絲緞面、紅綢裏、繡花鞋壹只，系內地制品，八思巴遺物有涼帽壹頂，鞋三只，也系內地制品。此外，該寺還珍藏有元代武器多件，都是極為珍貴的歷史文物。
薩迦寺每年都舉行或大或小多次法事活動，其中規模較大、獨具特色的要算薩迦寺夏季和冬季金剛神舞法會。薩迦寺夏季神舞在每年藏歷七月進行，冬季社舞歷十壹月十十九日開始。神舞表演時，舞者都戴著薩迦寺護法神和各種靈獸面具，神舞用簡單的故事情節，形象地反映了藏傳佛教密宗神舞的滅殺魔鬼的基本內容。每年適逢這兩個法會時，成千上萬的遠近僧俗群眾都要趕到薩迦寺朝拜觀瞻，祈禱神舞能給人間帶來幸福和吉祥。