校名 1904年8月，嚴修、張伯苓東渡日本考察教育，歸國後，即將嚴氏家館和王益孫家館合並，招收新生，並於1904年10月17日正式成立中學。校舍在嚴宅偏院，規模狹小，當時校名初稱“私立中學堂”，不久先後易名“敬業中學堂”、“私立第壹中學堂”。此後得邑紳鄭菊如捐城西南“南開窪”地10畝，幾經周折，起建校舍。這片地位於天津城西南的開窪地帶，向有“南開窪”之稱，簡稱“南開”。“南開”地名由此而來。 經過這壹番周折後，學校在此起建校舍。 1907年秋，由嚴宅遷入新校舍，學校因所在地名改稱“南開中學堂”，後改稱“私立南開學校”，這是學校稱“南開”之始。
在南開大學的校門上鐫刻著四個大字“南開大學”，金光閃閃、蒼勁有力、飄逸揮灑。每壹個南開人都知道，這是毛澤東主席題寫的校名。這幾個大字已經成為南開的重要標識。 校徽 為紀念南開系列學校百年校慶，2004年10月17日南開大學啟用了新的校徽。
南開大學標誌形象的基本元素由圖形標誌和字體標誌兩部分構成。其中，圖形標誌是其核心元素，在實際應用中也稱為“校標”。
南開大學校標的核心圖像為八角形，它既是南開大學校標的原始形態，也是其核心形態。八角星行由兩個正方行疊加、結合而成，八個角皆為直角，分別指向東、西、南、北、東南、東北、西南、西北八個方向。壹是體現“方方正正做人”之意，二是體現南開人“面向四面八方，胸懷博大，廣納新知，銳意進取”之精神。
八角星行方圓互動，融合東西，體現了南開大學“智圓行方”的入世哲學、“追求卓越”的立世哲學和“允公允能”的濟世哲學。
校標中的“南開”二字凝練厚重，而孤形排列的“NANKAI UNIVERSITY”簡約明快，表征了南開大學是壹所歷史悠久、面向世界的東方學府，圖標下部以“1919” 具體說明南開大學的創建時間。
由來
1917年9月22日，天津南運河決口。當日夜裏，洪水湧進天津南開中學。10月，在張彭春親自指揮下，全校遷入河北政法學校。為同其他學校學生區別開來，每名學生胸前都佩戴著壹枚紙制的紫白色臨時校徽。紫白是南開校色（紫色意取“紫氣東來”），正是這枚紫白校徽，使學生們念念不忘自己是南開人。以後，每年的9月23日晚上，學校都要在飯廳裏舉行壹次“水災紀念會”。全體學生坐在飯桌前喝粥紀念，而且胸前都佩戴印有“南開”二字的紫白色卡片，同當年那個壹樣，只是下面加印了壹行小字：“民國六年水災紀念”。
變化
後南開大學校徽由盾徽改為圓形校徽，與新校徽不同之處在於底部的字樣為南開大學的所在地天津的拼音“TIANJIN”。原“TIANJIN“標誌又改為了"1919"，標誌著南開大學的建校時間，校徽顏色為南開校色青蓮紫。 校訓 允公允能 日新月異
“允公允能，日新月異”是南開辦學理念的凝結，治校傳統的升華，體現了南開人特殊的價值取向和精神品質，正如喻傳鑒先生所說：“‘公，能’二字，為全校精神之所寄，先生之所施教，本此二字，學生之所努力，也本此二字。”南開大學的校訓始創於1934年，在南開學校創辦三十周年的校慶紀念會上，校長張伯苓先生正式宣布“公”和“能”為南開校訓。
“允公允能”這種話語形式，語本《詩經·魯頌·泮水》：“允文允武，昭假烈祖。”允，即文言語首助詞。允公允能，意即既有公德，又有能力，德才兼備。張伯苓本意是，要使南開學生具有“愛國愛群之公德，與夫服務社會之能力”。“日新月異”，語本《禮記·大學》：“湯之盤銘曰：‘茍日新，日日新，又日新’。”意即與時俱進，每天每月都有新的變化，形容進步迅速。
張伯苓先生指出：“允公是大公，而不是小公，小公只不過是本位主義而已，算不得什麽公了。惟其允公，才能高瞻遠矚，正己教人，發揚集體的愛國思想，消滅自私的本位主義。”“允能者，是要作到最能，要建設現代化國家，要有現代化的科學才能，而南開學校的教育目的，就在於培養有現代化才能的學生，不僅要求具備現代化的理論才能，而且要具有實際工作的能力。”“所謂日新月異，不但每個人要能接受新事物，而且要成為新事物的創始者；不但要能趕上新時代，而且要能走在時代的前列。”
校訓中文標準字體源自1962年4月吳玉如為張伯苓校長夫婦合葬墓碑撰寫的碑文拓片，後加以標準化處理。 校歌 由來
為鞏固團體精神，南開在五四運動前就創制了校歌，編校歌的動議，是1917年5月16日在東京南開同學會歡迎當時赴日本參加遠東運動會的張伯苓老校長和南開運動員茶話會上，由留日南開學生張蓬仙提出的。
1918年末，張伯苓老校長從美國哥倫比亞大學留學回校後，即請音樂教員孫潤生審定壹歌，為“於聚會之時，千人合唱，以期神會而鑄就南開真精神”，曲子采用的是西方的聖誕之歌——《on Christmas Tree》。
歌詞
渤海之濱 白河之津 巍巍我南開精神
汲汲駸駸 月異日新 發煌我前途無垠
美哉大仁 智勇真純 以鑄以陶 文質彬彬
渤海之濱 白河之津 巍巍我南開精神 南開鏡箴，又稱四十字鏡箴、容止格言，是流傳於南開體系的大中學校，僅次於“允公允能，日新月異”的校訓，他是由著名教育家、南開體系創建人張伯苓訂立的。南開體系的各所學校在重要通道處都設有大鏡子，提醒過往的師生隨時註意儀容儀表，這些鏡子上都鐫刻有這段鏡箴。鏡箴要求南開學子擁有整潔合適、積極向上的儀容儀表以及平和、寬仁的處世態度，提醒學生註意修身養性，提高自身的道德情操。每逢開學時節，新生們都會被要求背誦鏡箴，不忘張伯苓老校長的諄諄教誨。
原文
面必凈，發必理，衣必整，紐必結。
頭容正，肩容平，胸容寬，背容直。
氣象：勿傲、勿暴、勿怠。
顏色：宜和、宜靜、宜莊。
來歷
張伯苓信奉這樣的理念：壹衣不整，何以拯天下。所以為了培養學生的合適的著裝習慣和文明行為，張伯苓特意在天津南開中學東樓中的過道左側（壹說校門入口處壹側）立壹面壹人高的大鏡子，上面鐫刻著張伯苓請嚴範孫書寫的四十字：“面必凈，發必理，衣必整，紐必結。頭容正，肩容平，胸容寬，背容直。氣象：勿傲、勿暴、勿怠。顏色：宜和、宜靜、宜莊。”（《南開四十年校慶紀念特刊》）使學生出入校門有所儆戒，後得名“鏡箴”，壹直流傳下來。 在南開主樓後廣場上，懸掛著南開精神的象征——校鐘。兩邊銅鑄支架也呈鐘型，支架上架壹橫梁，校鐘懸掛其上。此鐘體積巨大，重達3000多公斤，古香古色，給人壹種滄桑感。每年新生入學，必到此鐘處舉行儀式。南開校鐘靜靜地懸在主樓的後廣場，學校每逢新生入學和畢業生離校都會鳴鐘紀念。
當年的校鐘系德國克虜伯工廠制造，原是為慶祝李鴻章壽辰而制作的紀念鐘，銅鐘鐘面鑄有整部《金剛經》，重達壹萬三千余斤。1904年，八國聯軍侵入天津，英軍曾將該鐘取走作日常用鐘，八國聯軍向天津交還政權後，大鐘移至海光寺，後海光寺贈與南開大學作為校鐘。銅鐘置於思源堂西側，以4根弓形梁柱做支架，並懸掛於約2米高的臺基之上。翻看南開舊時的照片，當時那口銅鐘頗為壯觀，是當時南開的壹景。九壹八事變1周年時，南開師生為銘記國恥，每日連敲校鐘9響，次敲1響，再敲8響，用以象征南開人將銘記九壹八國恥，鐘聲轟鳴，聲震方圓數裏。
1937年7月28日，日軍進攻天津，而駐紮在海光寺的日軍則將炮口直接對準八裏臺的南開大學。南開罹難，建築被毀，圖書設備遭到野蠻劫掠，而萬斤大鐘亦不知所終。戰後學校多方查索校鐘，張伯苓校長曾致函中國駐日代表團團長商震將軍在日本幾個掠奪物品集中地搜尋，但都杳無無音，校鐘終難逃被毀的厄運。1997年7月，為銘記南開園被侵華日軍炸毀60周年的慘痛歷史，學校決定重鑄校鐘。新鑄校鐘是由南京金陵古藝術青銅研究所所長、南京靜海寺警世鐘設計者王鐘泉設計，江蘇冶金機械廠鑄造的。大鐘的鐘槌與南京警世鐘的鐘槌***同出自壹棵有著80年樹齡的檀木，壹南壹北兩棵鐘槌堪稱壹對孿生姐妹。
新的南開校鐘重達3000公斤，鐘高1.937米，寓意要師生員工牢記1937年日軍炸毀南開。鐘的周邊雕刻著60枚校徽圖案，意寓60周年，鐘的正面是“南開”兩個大字。鐘上文字由著名書法家康殷先生書寫，左面是校歌，中間是校訓。
南開大學校鐘銘文：
河海泱泱，立學啟庠；
英彥蔚起，山高水長；
翔宇負笈，邦國之光；
七七事變，倭寇似狂；
毀我校園，景鐘雲亡；
今茲重鑄，宮生喤喤；
莘莘學子，濟濟堂堂；
允公允能，蹈勵發揚；
日新月異，科教騰驤；
猗歟南開，宏業無疆。