大型古籍整理項目《中華道藏》副主編，國家社科基金項目“道教授箓制度研究”
多年來參加中國哲學和宗教的教學與研究，先是主攻宋明理學，撰有《周易與宋理學》、《道教影響下的朱熹》、《論試程頤思想的個性特征》等。 1、執古之道以禦今之有 中國道教 1997年第1期
2、重視道教在海峽兩岸的紐帶作用 五緣文化與對外開放 上海交大出版社 1997年8月
3、物魅、人鬼與神祇——中國原始崇拜體系形成的歷史鉤沈 宗教哲學 1997年7月
4、道教三字經前言 道教三字經 上海古籍出版社 1997年12月第1版
5、大馬歸來話神緣 海內與海外 1998年第1 期
6、壹景壹木寓道心—— 中國宗教（夏季號） 1998年第2 期 香港青松觀盆景藝術鑒賞
7、中國的市場經濟和宗教的社會功能 宗教問題探索 1998年文集
8、踏罡步鬥的源流和宗教功能 宗教 1998年3~4期
9、《陰符經》要義發揮（連載壹、二） 三清文化 1999年第1 、2期
10、《廬山道教初編》[序] 廬山道教初編，華文出版社 2000年9月
11、《廬山道教初編》[序二] 廬山道教初編，華文出版社，2000年9月第1 版
12、眾星拱伏的鬥姥神 世界宗教文化 1999年第3 期
13、天地的根由 三清文化 1999年第3 期
14、虞集的道緣 弘道 2000年總第九期
15、道教對民間信仰的收容和改造 道心 2001年第24期
16、玉皇科儀及其文化內涵 中國道教 2001年第1期
17、《道教人物故事》[序] 復旦大學出版社 2001年8 月第1 版
18、宮觀與華夏文化的傳承 儒學與21 世紀中國 學林出版社 2000年12月第1 版
19、考鬼召神的心理分析——兼說中國宗教中的神秘主義 道教文化的傳播 南華大學宗教文化研究中心
20、五雷正法淵源考論 宗教學研究 2001年第3 期
21、兩宋新符錄道派的社會文化背景分析 道家與道教·道教卷 廣東人民出版社 2001，9
22、試論道教法術科儀的表演特征 世界宗教研究 2002，2期
23、密密宮觀擁金頂 世界宗教文化 2002，2期
24、關於宗教需要的斷想 宗教問題探索·2001年文集 2002，7
25、《茅山民間文學集成》序 茅山民間文學集成 上海科學 2001，10
26、道教法術的社會功能和時代轉換 道教與人生，宗教文化出版社 2002，6
27、劉、阮入天臺故事的文化透視 中國道教 2002，6期 2002，6期，東南文化，2004增刊
28、憶光德 上海道教 2002，3期
29、壹景壹木寓道心 弘道 13期，2002年
30、道教通向現代社會的端口 中國宗教 2002，6期
31、扶乩與道書創作 弘道 14期，2003年
32、現代社會與道教的發展空間 中國宗教學 宗教文化出版社，2003，4月。
33、找到道教通向現代社會的端口 道教教義的現代闡釋，宗教文化出版社，2003
34、湖北黃坡木蘭山上的兩項奇特風俗 世界宗教文化 2003，4期。
35、神緣網絡與當代文化生態 海峽兩岸五緣論，方誌出版社，03，11
36、明代彩繪全真宗祖圖和《明代彩繪全真宗祖圖研究》，弘道，04，1
37、魯迅“中國根柢全在道教”是肯定道教嗎？ 中國社會科學院院報，04，6，10，第3版。
38、略論道教整合民間信仰的教義基礎和基本方式，《人文與社會》，上海社會科學院出版社，2004，7。
39、近代全真儀式初探，《全真弘道集》，青松出版社，2004，7。
40、攻克人生的關卡－劉壹明《通關文》的現代價值，《中國宗教》，2004，9期。
41，召神役將的教義基礎——從神將系統看道教信仰的獨特性，《道教與神仙信仰》，人民日報出版社，2004，6
42，香港宮觀早晚功課經之討論 香港及華南道教研究，中華書局，2005，4月。
43，劉晨阮肇入天臺故事的文化透視（與中國道教02年重），
44、至真與至善——道教倫理思想的超越性與現實性，南嶽會議論文，《道教與倫理道德建設》，中國言實出版社，2005，4.
45、重返社會舞臺的努力——道教教義升溫的宗教社會學評析 道家文化研究，21輯。 1、呂祖無極寶懺註 青松觀香港道教學院 1997年6月初版
2、中國精怪文化 上海人民出版社 1997年10月第1 版
3、道教的內秘世界 文津出版社 1997年11月
4、中國科學思想史（合作） 安徽科學技術出版社 1998年1月第1 版
5、道教誌（合作） 上海人民出版社 1998年10月第1 版
6、中國古代養生格言（與人合作） 上海人民出版社 2000年1 月第1 版
7、道教故事圖說 上海書店出版社 2000年7月第1 版
8、周易與華夏文明（合作） 上海人民出版社 1998，12
9、道教法術 上海文化出版社 2002，1
10、中國道教科學技術史·漢魏兩晉卷（合作）中國科學技術出版社 2002，4
11、中國民間信仰與道教 東大圖書公司 2003，3
12、20世紀中國學術大典．宗教卷（合作） 福建教育出版社 2002
13、中華道藏（大型古籍整理項目，張繼禹主編，本人為副主編之壹）華夏出版社，2004年1月第壹版，總49冊，本人承擔部分為第36、37、38分冊主編並標點約140萬字。
14、道教風俗談（第二主編），上海辭書出版社，03，12。
15、欽賜仰殿與東嶽信仰（第二作者），上海辭書出版社，04，2
16、劉仲宇註釋太上玄門早課，14.5萬字，青松出版社， 2005年。
17、劉仲宇註釋太上玄門晚課，11萬字，青松出版社，2005，12.
18、二十世紀中國社會科學·宗教學卷，王雷泉、劉仲宇、葛壯主編，劉仲宇並撰稿約7萬字，上海人民出版社，2005，9。
19、正逢時運——接財神與市場經濟，19.3萬字，上海辭書出版社，2005，12 .