1、表中第1欄至第3欄按當月內銷銷售收入的實際發生情況填報。
2、第4至第7欄：有此情況的，按實際情況填寫。
3、第8欄“免稅貨物”：根據當月轉廠出口銷售收入填寫。實際操作中可以從該申報系統中取得數據，具體方法如下：首先，在該系統主畫面，選擇“綜合數據查詢”——“免抵退基礎數據查詢（全部）”——“間接出口貨物明細查詢”，進入“間接出口貨物明細查詢”模塊。假設我們以2003年1月為例，在該模塊下按“篩選”鍵，出現畫面（如圖43），在“條件輸入”的“字段含義”中選擇“所屬期”；在“運算關系”選擇“等於”；在“值”中錄入200301（表示2003年1月），然後按右邊的“增加”鍵，即可完成篩選條件的設置。（方法二：直接在圖43中按“編輯條件表達式”就會彈出畫面（如圖44），在該編輯畫面錄入如下內容：“SB_YM=”200301””，為避免表達式錄入錯誤，企業錄完表達式後，可以按下“校驗”鍵檢查語法是否出錯，如無錯再按“確定”鍵即可完成篩選條件的設置返回圖43畫面），再按下“確定”鍵執行篩選任務即可。
接著，當篩選出符合條件的記錄出來後，在該模塊下按下“擴展”——“計算小計”，在彈出的畫面中的“人民幣離岸價”的“總和”金額就是我們想要的數據，如果企業納稅申報表上填報的“當月的轉廠出口銷售收入”與該數據不壹致時，就會影響電腦的審核。
4、第9欄“出口貨物免稅銷售額”：根據當月所有的直接出口銷售收入（包括單證齊和單證不齊的部分，但不包括前期單證不齊本期收齊部分）填寫。在實際操作中可以根據《出口貨物免、抵、退稅申報明細表》（當期出口明細）第12欄出口銷售額人民幣的合計數填報。
5、第10欄“本期進項稅額發生額”：根據本月取得的增值稅專用發票、收購憑證、運輸發票以及進口貨物海關代征增值稅的完稅憑證計算的準予抵扣的進項稅額填報。
6、第11欄“進項稅額轉出”：填寫納稅人已經抵扣但按規定應當轉出的進項稅額總數。該欄等於第12欄至第17欄的合計數。
7、第12欄“進項稅額轉出”的“免稅貨物用”：根據轉廠出口銷售收入所耗用的進項稅額填報。實際操作中，可以依照以下公式計算：第12欄=“本月取得的進項稅金”乘以“本月的轉廠比例”。其中“本月的轉廠比例”=增值稅納稅申報表中（第8欄）除以（第1欄+第4欄+第8欄+第9欄）。
8、第13、14、15、17欄：有此情況應如實填寫。
9、第16欄“免抵退貨物不得抵扣稅額”：是指本期免抵退稅不得免征和抵扣稅額。實際操作中，假設Ａ=《出口貨物免、抵、退稅申報明細表》（當期出口明細）第15欄出口銷售額乘征退稅率之差的合計數（以Y表示）－ “進料加工免稅證明”中的“不予免征和抵扣稅額抵減額”的“出具證明匯總”金額 － 上期結轉免抵退稅不得免征和抵扣稅額抵減額。當Ａ大於零時，就在“第16欄”填上Ａ即可；當Ａ小於等於零時，則“第16欄”=0。
10、第20欄“銷項稅額合計”： 根據當月的內銷銷售收入乘以對應的征稅稅率計算填寫。
11、第21欄“進項稅額合計”=表中第10欄“本期進項稅額發生額” －第11欄“進項稅額轉出”。
12、第22欄“上期留抵稅額”=上個月納稅申報表的第29欄“期末留抵稅額”。
13、第23欄“免抵退貨物已退稅額”=上個月《生產企業出口貨物免、抵、退稅申報匯總表》的第20欄“當期應退稅額”。（註意：由於新舊免抵退稅申報方法有所不同，稅款所屬期為2003年1月時，該欄壹律以“0”填寫，從2003年2月開始該欄才以上述公式計算填寫。）
14、第24欄“應抵扣稅額合計”=本表第21欄＋第22欄－第23欄。
15、第25欄“實際抵扣稅額”：當本表第24欄大於等於第20欄時，第25欄“實際抵扣稅額”=第20欄；當本表第20欄大於第24欄時，第25欄“實際抵扣稅額”=第24欄。
16、第26欄“應納稅額”=本表第20欄－第25欄。
17、第29欄“期末留抵稅額”=本表第24欄－第25欄。