吸煙會引起各種腦部疾病，減少大腦中的氧氣和血液循環，導致腦血管出血和閉塞，並導致癱瘓、智力下降和中風。中風的原因是吸煙導致腦血管痙攣，使血液更容易凝固。吸煙者患中風的可能性是不吸煙者的兩倍。
喉部
吸煙會導致喉癌。喉癌患者多為男性。
心臟和血管
研究發現，吸煙會增加血液中血小板的粘度，使血液更容易凝固，從而容易在冠狀動脈內形成血栓。同時，吸煙還會增加血液中的低密度膽固醇，使脂肪物質容易沈積在血管中，形成冠狀動脈粥樣硬化。如果冠狀動脈硬化，其管腔就會變細。壹旦血液在裏面凝固，動脈就會被堵塞。此時氧氣無法送到心肌的這壹部分，心肌細胞就會因缺氧而衰竭死亡。這是心肌梗塞。局部心肌梗塞可引起心絞痛，而大面積心肌梗塞可使人休克，或因心臟突然停止跳動而死亡。這是急性心肌梗塞。吸煙會收縮血管，減緩血液和氧氣的循環，最終導致血管壁增厚，導致冠心病和中風。吸煙會完全阻斷手腳的血液循環，導致截肢。
醫生建議吸煙者，如果有高血壓、高血脂、心臟病或心臟病家族史，應立即戒煙，因為吸煙會使妳患心肌梗塞的風險增加幾十倍。吸煙導致的心臟病死亡率占總數的25%。50歲以上吸煙者的患病率翻了壹番。50歲以下吸煙者患病率增加9倍，達到14倍。
肺
吸煙會導致肺癌。總死亡率的90%是由吸煙引起的。壹個每天抽十支煙的人，患病率是非吸煙者的十倍。受損的細胞無法恢復正常。直到癌細胞擴散到血管和其他器官，最初的癥狀才會被發現。到目前為止，肺癌是導致人類死亡人數最多的壹種癌癥，早期發現幾乎是不可能的。確診為肺癌的患者，3年後生存率不到5%，5年後幾乎為零。醫生建議吸煙者每3 ~ 6個月做壹次胸部x光檢查。如果出現幹咳、痰中帶血絲、胸部隱痛、發熱等癥狀，也不可掉以輕心。他們應該立即去醫院做痰脫落細胞檢查。這樣才能增加肺癌早期發現的可能性。吸煙還會引起肺氣腫，肺部支氣管中積累的有毒物質會阻礙人體吸入的空氣的正常呼出，使肺細胞膨脹或爆裂，導致呼吸困難。患有嚴重肺氣腫的病人非常痛苦。為了吸入足夠的氧氣，他們不得不直立起來，高頻率地喘息。即使在平地上，他們也要慢慢走。壹些更嚴重的病人不得不依靠氧氣袋來維持生命。在他們的壹生中，他們必須將所有的努力集中在壹個簡單的動作上——呼吸。
有些醫生認為，與肺氣腫相比，肺癌應該算是壹種非常仁慈的疾病，因為它使人遭受痛苦的時間短得多。
胃
患有腸胃病的人，吸煙足以使腸胃病加重。胃潰瘍或十二指腸潰瘍的人，會使潰瘍的愈合速度變慢，甚至變成慢性病。吸煙會刺激神經系統，加速唾液和胃液的分泌，使胃腸道經常緊張，導致吸煙者食欲不振。此外，尼古丁還能收縮胃腸粘膜血管，降低食欲。
骨骼
吸煙者骨折恢復期比不吸煙者長。可能是香煙中含有的尼古丁和壹氧化碳減緩了骨骼再生的進程。尼古丁會收縮血管，減少流向新骨的血液。吸煙時吸入的壹氧化碳也會降低氧氣進入身體的速度。吸煙會導致骨炎和背痛。每天吸煙十支以上，骨膜炎患病率會增加壹倍。背痛嚴重的人大多對吸煙上癮，這是因為吸煙會減少關節盤的血流量，關節盤會早期退化。吸煙會導致關節炎。每天抽壹包煙，患病率會增加50%。女性吸煙者絕經後更容易患骨折和關節病。吸煙會導致更快的骨質流失。女性從青春期到更年期，持續每天抽壹包煙，骨骼比不吸煙者少5%到10%。吸煙者進入更年期，骨質流失速度更快。吸煙會幹擾雌激素，而雌激素是骨骼發育的重要激素。
支氣管
吸煙是慢性阻塞性氣管疾病的主要原因。因為吸煙可導致支氣管上皮細胞的纖毛變短、不規則，發生運動障礙，降低局部抵抗力，易受感染。
肝臟
吸煙會增加肝臟的負擔。經常吸煙會影響肝臟的脂質代謝，使血脂升高，良性膽固醇降低，惡性膽固醇升高。這就造成了肝臟的解毒功能負擔加重。
腸
吸煙會導致結腸癌。患這種癌癥的幾率與吸煙量成正比。研究表明，雖然戒煙可以降低患心臟病、肺癌等其他疾病的幾率，但患結腸癌的風險仍然很高。
眼部
吸煙會導致白內障，影響視力。研究表明，每天吸煙超過壹包的白內障患者比從不吸煙的人多壹倍。
生殖系統
吸煙抑制了脊髓的神經中樞，使男性性欲變弱，又由於吸煙可使血管收縮痙攣，引起末梢血液循環障礙。所以，吸煙是導致陽痿的主要原因。澳大利亞和加拿大已經將這壹信息直接印在香煙盒上。另外，吸煙會影響精子的活力，使畸形精子增多，戒煙後三到六個月才能恢復正常。如果妳想要壹個聰明健康的孩子，嬰兒專家主張妳必須戒煙三到六個月。