但是，這樣壹個官員的履歷，遠不能讓培根成為光輝歷史上的偉大人物。他之所以贏得永久的歷史聲望，是由於他的哲學著作以及這些著作所傳達的科學思想。培根在《論文集》、《新工具》、《新島》等壹系列著作中，以“卓越的觀察力和卓越的文筆”闡述了他對政治、哲學、科學、人生的看法和理論。他強調科學實驗的重要性，主張采用經驗主義的科學方法論，提出“科學技術是人類壹切利益的最大利益”，這是在推動人類歷史前進。培根的上述思想對現代自然科學的形成和發展產生了非常重要的影響。麥克·哈特說，“當百科全書在法國啟蒙運動期間編纂時，它的主要貢獻者都承認培根啟發了他們的工作。”在此基礎上，麥克·哈特將培根列為“影響人類歷史進程的100位名人名單”中的第90位。
作為壹個歷史人物，培根給後人留下了優美的文字和光輝的思想，但也在他的性格上留下了壹堆汙點。據史料記載，培根是壹個迷戀權力的人。為了追求權力，他極力奉承國王和有權有勢的人，用自己的文采做了壹等壹的阿諛奉承，在官場上成就了壹帆風順的人生。培根把婚姻和財富掛鉤，眼睛盯著有錢的寡婦和富家女，以至於直到45歲才娶了壹個郡長的女兒。培根經常借錢，但從來不還，還壹度因此被捕。培根在擔任首席大法官期間，索賄受賄，上演了壹系列原告吃被告的醜劇。培根最大的汙點是，他為自己的政治恩人制造了壹場悲劇。埃塞克斯伯爵曾經在政治上幫助過培根，後來被培根知情，因反對國王而被處決。
很難想象壹個孜孜不倦的真理追求者，壹個天賦異稟的思想家，壹個懂得人生真諦的智者，怎麽會和壹個貪婪、投機、卑鄙的小人聯系在壹起，這些奇怪的現象怎麽會如此驚人地集中在壹個人身上。如果分析培根雙面人格的成因，或許可以從動物學中找到壹些答案。在動物界，動物按生活方式可分為群居動物和獨居動物；在群居動物中，每壹個個體的行為都應該嚴格遵守群體所遵守的習慣和規則。只有這樣，群體才能最大限度地保證個體獲得食物、安全甚至尊嚴；而獨居動物則不需要考慮其他同類動物的感受，完全憑自己的興趣、口味和能力去捕獵、跳躍和奔跑。同樣，培根也早就涉足了欺騙無恥的權力領域。他像壹個合群的動物，自然要學習、模仿、遵守這個群體的規則，努力成為壹個符合這個群體要求的合格的人。結果，他做到了。當他結束公務活動回到家中，從壹個群居動物變成壹個獨居動物時，他徹底擺脫了群體的束縛，讓思緒漫天飛舞，享受著大自然的奧秘和探索真理的樂趣。他也成功了。也許壹開始培根在公與私、日與夜的角色轉換中是積極而清醒的，但隨著時間的推移，他所扮演的角色可能會發展成固化的人格，最終在偉人的光輝形象背後留下了卑鄙小人的黑暗陰影。