印第安·喬把謀殺歸罪於波特，而波特很難說清楚。喬讓鎮上的人相信醫生是被喝醉的波特殺死的。波特很快就被抓進了監獄。湯姆和哈克盡力安慰可憐的波特。他們的良心因知道真相而受到折磨。
第12章:月經想盡辦法找靈丹妙藥。
貝基因為悲傷生病了，她好幾天沒來上課。湯姆想和她和好，但又放不下自尊，所以整天悶悶不樂。波莉月經以為他病了，就想盡辦法用各種土方給他治療，給他吃各種藥。後來，湯姆給壹只貓倒了止痛藥，貓立刻變得緊張起來，在屋子裏跑來跑去。月經突然意識到自己不應該這樣折磨湯姆。
第13章:三個小海盜起航。
湯姆傷心絕望，覺得家人朋友甚至全世界都拋棄了他。偏偏好朋友喬無緣無故被媽媽打了壹頓。他們壹拍即合，打算離家出走當海盜。他們還找到了哈克，邀請他加入。哈克高興地加入了。於是這三個人起航，去傑克遜島當海盜。
第14章:無憂無慮的海盜生活
當他們到達傑克遜島時，三個小海盜過著無憂無慮的海盜生活。在他們的營地裏，他們有吃有玩，他們每天都在周圍玩耍。這壹天，他們看到壹艘船在打撈死者。鎮上的人以為他們淹死了，正在打撈他們的屍體。半夜，湯姆壹個人偷偷溜回家打聽情況。
湯姆半夜回到家。
湯姆溜回家後，躲在波莉·月經的床下，偷聽她和哈珀夫人的談話。他們都認為他們的孩子淹死了，並不斷承認他們對他們如此惡劣。當湯姆聽到他們哭泣時，他為他們感到難過。然而，當湯姆得知鎮上的人在周日為他們舉行了葬禮時，湯姆突然想到了壹個政變，然後溜回了海盜的營地。
湯姆安撫他改變主意的哥哥
三個小海盜還在傑克遜島上，遠離城鎮，吃喝玩樂無拘無束。湯姆和喬在哈克的指導下學會了抽煙，但很快他們就被濃烈的煙味嗆住了，失去了興趣。不久，喬開始想家，哈克也說想回去。最後，在湯姆告訴他們壹個絕妙的計劃後，他暫時平息了這場叛亂。
湯姆出現在他的葬禮上。
孩子們都以講述死者過去的所作所為而自豪。壹個孩子找不到話說，就說:湯姆·索亞有壹次打了我壹頓。人們在教堂裏埋葬了三個淹死的孩子，但是湯姆、哈勃和哈克走進了教堂。人們先是震驚，然後欣喜若狂。當湯姆回到家，他被扇了無數個耳光，親了無數次。
湯姆和貝琪互相生氣。
湯姆成了大人物。貝琪想和湯姆和好，但他忘恩負義，總是和其他女孩在壹起。後來，貝琪還和男孩子壹起讀了壹本書，以牙還牙。湯姆生氣了，貝琪高興了，湯姆生氣地回家了，貝琪沒有心情再玩了。那個男孩想通過在湯姆的書上倒墨水來報復他，貝基看見了，但她不會告訴湯姆。
第19章:和月經復合
湯姆回到家，把前幾天回家的真相告訴了月經，月經以為是騙人的，但他很開心。他認為這是壹個善意的謊言，他喜歡這樣的善意謊言。最後，他證明了這不是湯姆善意編造的謊言，他很欣慰，赦免了湯姆的過錯。
第20章:湯姆代替貝基受罰。
校長總是讀壹本神秘的書，所有的學生都想讀。這壹次，校長忘了拿課桌的鑰匙。貝基偷看了那本書，但湯姆看見了。貝基急忙把它撕了，她又羞又惱。校長找到了被撕掉的書，並逐壹詢問。當問到貝基的情況時，湯姆挺身而出。貝基尊敬他。
假期前的惡作劇
在期末考試的考場上，大家各顯神通。像往常壹樣，校長去畫壹幅美國地圖，但是舊的畫不好，孩子們嘲笑他。這時，天花板上掛著壹只貓，用爪子扯下了校長的假發，露出了他金色的光頭。孩子們突然大笑起來。孩子們終於成功地報復了校長。
第22章:蕭條的假期
湯姆加入了這個新組織。並保證在會員期間，不吸煙，不咀嚼，不褻瀆。湯姆立即發現他患有強烈的吸煙和罵人的欲望。7月4日，美國獨立日(右)，但他很快就放棄了這個東西——防磨鏈“不到48小時，他寧願放棄這個願望，把希望寄托在法官Fraisse身上。他顯然是死了，因為他身居要職，死後會有隆重的儀式。他申請退款，但當晚，法官舊病復發，不治身亡。湯姆發誓再也不會相信這種人肉了。他試著寫日記，但是三天前，什麽都沒發生，所以他放棄了理解這個想法。後來他們來古巷鎮恢復親情和催眠，但也走了。這個城鎮比以往任何時候都更無聊，更沒有生氣。有人號召男孩和女孩加入這個團隊，但往往是有限的。除了聚會太有意思，沒有聚會的日子，肉是空的，味道更差。
第23章:湯姆出庭作證
法庭已經開始審訊發生在墓地的謀殺案，莫夫波特即將被處以絞刑。就在這時，湯姆以證人的身份跑到法庭上，說出了事情的真相，而印第安人喬·喬則迅速逃跑，莫夫波特因無罪被判無罪。
第24章:坐立不安的湯姆
湯姆和哈克害怕印第安人喬·喬說出謀殺的真相後會回來謀殺他們。白天，他們很高興在波德的感謝中說出真相，但晚上，他們變得非常害怕喬·喬·喬，壹個印第安人，會再次來到他們身邊，但法院仍然沒有抓住逃跑的兇手。
第25章；尋找寶藏
壹天，湯姆想去尋寶，於是他和哈克壹起到壹個寡婦家後面的枯樹陰影下去挖海盜留下的財寶，但是沒有找到海盜留下的財寶，他們約定明天白天壹起去壹個陰森的鬼屋碰碰運氣。
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