(1)具有過程可控、降解快、生產過程全封閉的特點；
(2)能源利用效果好，可將廢棄有機物中的低品位生物能源轉化為可直接利用的高品位沼氣；
(3)操作簡單，與好氧處理相比，厭氧消化不需要通風動力，設施簡單，運行費用低，屬於節能處理方法；
(4)產品可重復使用，適用於處理高濃度有機廢水和廢棄物。經過厭氧消化後，垃圾基本穩定，可用作農業肥料、飼料或堆肥原料；
(5)厭氧微生物生長速度慢，常規方法處理效率低，設備體積大；
(6)厭氧過程中會產生H2S等惡臭氣體。