南明迅速崩潰的原因之壹：鄭芝龍水師不能協防長江防線。南京處於長江轉彎處，它的地形很特殊，城的北面和西面是長江，長江正好形成壹個90度的直角構成了南京城市北邊和西邊的兩道天然城墻，東面和南面則是面積達上千平方公裏的低矮的丘陵和平原地帶。北面和西面的長江在南京這壹段非常寬闊，寬達到1500米，也就是1.5公裏，水深15米到30米，最深有70米，水流也較快，每秒有3米。壹旦打起仗來，南京政權想要自保，就壹定要控制長江的制江權。如果南京政權無法控制長江，就等於將自己北方大門交給敵人，那麽南京是絕對守不住的。
南京的南面，東面都是低矮平原丘陵山崗地帶，以南京為中心畫壹個圓，在長江以南半徑150公裏之內根本無險可守。東面從南京直到鎮江，江陰，無錫的100,200公裏內都是平原地區，只有壹些小河小湖。南面的溧水，溧陽，馬鞍山，蕪湖的地形和東面也差不多，100,200公裏內根本沒有適合防禦的地形。南京自古以外的敵人基本都來自兩個方向，壹個是北方，壹個是西方和南方。其中如果單純從北方入侵南京，倒是不太容易成功。為什麽呢？主要就是因為南京北方有壹個天然障礙長江。南京長江寬達1.5公裏，古代采用木帆船自然需要更久的時間，遭遇風雨天氣還要封江的。南京歷史上作為首都的朝代有很多，但真正從北方殺過來的敵人是極少的！如果單單從北方進攻南京，其實進攻壹方並不有利！歷史上南京附近曾經有成功防禦超強敵人的先例，這個敵人就是強大的金軍。當時完顏亮率領60萬金國大軍南下試圖滅南宋，壹路沿著海路南下，但在山東沿海被南宋海軍大敗，幾乎全軍覆沒。見從海路進攻浙江杭州不成，完顏亮決定從陸路和內陸江河進攻，那麽就必須渡過南宋賴以防守的天險長江。當時完顏亮過於輕敵，他選擇在南京附近的馬鞍山渡江。結果南京附近正聚集著南宋最強悍的壹支水軍，他們在南宋書生名將虞允文率領獲得采石之戰的大勝。采石之戰大敗以後，完顏亮還不死心，隨即轉軍到揚州附近試圖在此處渡江，又被南宋水軍逼近水寨擊敗。完顏亮憤怒之下下達了三天不過長江，高峻軍官全部斬首的命令，同時下達了士兵逃亡殺其戰友的連坐法。
金國官兵忍無可忍，隨即發動叛亂。完顏亮被亂箭射死，他雄心勃勃的南侵也就完全失敗了。為什麽從北方進攻不容易成功，甚至像完顏亮這樣有60萬大軍都不行呢？ 因為南京的北面是長江，從北面打過來想占領南京就必須殲滅南京政權的水軍。可惜這又談何容易，既然這個政權定都南京，而南京城門外幾百米就是長江，這個政權不管再弱智低能，也肯定會極為重視水軍的建設。北方的湖泊河流不多，從北方而來的敵人水軍不可能很強大。而且即使有強大水軍，也很難到達長江。拿完顏亮為例，其實他在北方也有水軍，但從海路走被殲滅在海上，走大運河又因為梁山泊是枯水期，大船無法通過，所以他的水軍主力到不了長江。海陵王完顏亮雖然有精銳的女真步軍馬軍，但這些部隊對於突破長江沒有任何幫助。而金軍能夠到長江作戰的水軍，無論數量質量都遠不是南宋水軍的對手。金國在長江作戰的水軍都是平底小船，速度慢，抗風浪能力差，裝備的水戰武器也相當落後。南宋水軍則有當時世界上最適合水戰的堅固海鰍船（鯨魚船），體積大，操縱性能好，速度快，不但裝備大量海戰武器，更可以輕松撞沈金軍艦船。同時南宋還使用了當時最先進的水戰武器霹靂炮，也就是發射火藥彈的投石武器，之前的海戰更是使用了火藥武器火箭，這都是當時最先進的海戰武器。打不敗南京政權的水軍，北方打過來的敵人就無法攻陷南京。
所以單單從北方攻擊南京的入侵在歷史上少之又少，而大部分都是從西面，南面沿著長江殺過來的。雖然在南京附近渡江不容易，但湖北境內的長江中遊地段是比較容易渡江的地區。這壹段水流較慢，灘塗較多，又有很多登陸點，防守壹方很難面面俱到，這些都對進攻壹方有利。加上湖北離中原地區平原地形的河南省近在咫尺，北方騎兵幾天內就可以突破中原的防禦殺到長江邊。所以古代北方侵略者多從湖北境內強渡長江，然後乘船沿著長江東進北上或者水陸同時進軍，從西面，南面進攻南京，將城中守軍擊破。那麽主戰場其實就不在南京，而是在湖北境內了。如果湖北的戰役能夠獲勝，南京就沒有危險，如果湖北作戰失敗，南京特殊地形決定它無法抵抗從西面西南面的敵人，失敗也就是必然的。
這種例子歷史上有很多，比如蒙古人攻打南宋時期的荊襄鏖戰，清軍攻打大明時期在湖北擊破明軍和農民軍，還有三國時期的幾次湖北大戰。 當年三國時期的曹操率領幾十萬獲勝之師南下滅東吳，周瑜率領5萬精兵在湖北赤壁市和曹軍決戰。曹軍雖然步兵馬兵強大，但水軍不是吳軍對手，最終遭受慘敗，水軍全軍覆沒，陸軍也損失慘重，這也是著名的赤壁之戰。由此曹魏直到滅亡之前，幾十年內再也無法消滅東吳！而反例是吞並蜀國成功的晉軍主力出動六路軍隊滅掉東吳。當時晉軍水軍主要從湖北安徽壹線沿著長江東進南京。東吳水軍在湖北安徽境內和其決戰，卻接二連三的大敗，布置的攔江鐵索和江底的鐵錐也沒有發揮作用，從而完全失去制江權。接著晉軍的水軍直開到南京附近，吳國統治者孫皓雖然還有壹部分軍隊，無奈從軍事上已經無法守住南京。
他見大勢已去隨即投降，結束了輝煌的三國時代。而後來的太平軍也是和晉軍壹樣，只是他們是從南面的湖南先攻占湖北的武漢，然後幾十萬軍民沿著水陸東進攻占清朝兩江總督府所在地南京，由此在此定都13年。所以說，從北邊攻打南京不容易，因為擊破此處南京政府的水軍比較困難。那麽從西邊和南邊沿著長江攻占南京相對比較容易，因為此時決戰地點其實就不在南京，而是在湖北安徽。壹旦入侵敵人能夠在湖北占據制江權，那麽南京就很難守住，因為南京附近其實只有長江作為天險，敵人控制長江那麽南京也就無險可守。
歷史上從東面進攻南京的先例不多，因為南京東邊200多公裏以外就是大海，在古代自然不存在敵人。不過壹旦有這種的進攻，南京就很難守住。因為從東面進攻南京，從軍事上來說，南京是最無法防守的。如果從北邊西邊南邊進攻南京，長江就成為南京的天然保護，必須擊敗南京的水軍才有可能取勝。如果敵人從東邊進攻南京，如果入侵者有強大水軍自然最好，如果沒有也無所謂，甚至可以不用理會水軍，完全從陸路進攻。此時對於防守南京壹方來說，長江的作用就正好相反，不再是天然屏障，而是南京守軍撤退和運送增援補給兵員的最大障礙。由於南京附近地形不適合防守，守軍就會處於壹個很不利的地位。想要守住南京，就必須集中比敵人強大的部隊進行陸地決戰，而且決戰地點只能選在南京外圍至少50公裏以外，因為南京城附近地形更不適合防禦。南京城外十幾公裏處除了紫金山以外，只有幾座小山坡或者說小山崗，這種地形對防守壹方來說沒有任何意義，因為山太矮，敵人騎兵都能沖的上去。這些地形對於防守壹方沒有意義，對於進攻壹方卻不同。
由於南京城內地形普遍比城外要低的多，反而壹旦進攻的敵人占領了這些小山小崗，卻能以這些高地向城中攻擊，形成對城內遠程攻擊的最好火力點。所以從壹般軍事角度考慮，而萬壹外圍決戰失敗就必須立即放棄南京撤退，歷史上從東面攻占南京成功的例子也有壹些，但多是近代的事情。南京內城城墻東傍鐘山，西據石頭，南憑秦淮，北控後湖，周長35.267公裏，現存基本完好的明城墻23.399公裏，是世界上現存最長的古代城墻，是中國少有的保存良好的古代城墻，是南京現存最大的古代建築。這個城墻在冷兵器時代是絕對的殺手鐧，任何部隊都很難攻打進去，後來清軍攻擊南京，南京的守將目睹揚州大屠殺沒有敢於抵抗開城投降，不然的話也會有壹場血戰。對於南京這種地形，古往今來的有識之士很清楚。所以南宋並沒有在南京定都，因為當時金軍太強大，南宋壹路潰敗逃過長江，戰鬥力已經大受打擊。所以宋高宗趙構怕南京是守不住，反而離長江較遠的杭州安全得多，將首都定在了浙江。而在南京定都的朱元璋也深知南京防禦能力的薄弱，明軍除了大建水軍控制制江權以外，為了增強南京的防禦能力，花費21年之久和巨額資金修建了長達30多公裏的南京城墻。南京城墻非常堅固，僅次於西安古城墻。這堵高20米，款15米的城墻在古代可謂極難攻破，可惜進入火藥時代以來就不行了，不可能長時間防守。當年太平軍用幾千斤黑火藥埋入地下炸塌了南京鳳儀門城墻壹段，最終沖入城去。所以南明堅持抵抗的關鍵在於長江水師能否掌控制江權。