這兩所大學在學科方面還是各有所長的，只能說鄭州大學檔次比河南大學更高，但是說到名氣河南大學可是百年老校，河南大學：歷史悠久，文化底蘊豐富。河南大學的前身河南留學歐美預備學校，在開封清代貢院舊址誕生，首任校長為著名教育家林伯襄先生。
鄭州大學有3個世界壹流學科建設學科：臨床醫學、材料科學與工程、化學。2個國家重點學科：凝聚態物理、材料加工工程。4個國家重點（培育）學科：中國古代史、有機化學、化學工藝、病理學與病理生理學。
在第四輪學科評估中有7個B+類學科：馬克思主義理論、考古學、化學、材料科學與工程、水利工程、化學工程與技術、公***管理。鄭州大學作為壹所211大學，沒有壹個A類學科，這是所有人不能接受的的地方。
目前鄭大有壹級學科博士點21個，壹級學科碩士點55個，博士後科研流動站24個。有國家重點(培育)學科6個，國家臨床重點專科建設項目37個。國家級科研平臺12個，省部級以上重點科研機構129個。4個學科(領域)進入ESI前1%，9個學科(群)入選河南首批優勢特色學科。
有專任教師3720人，兩院院士9名，社科院學部委員1名，英國與加拿大院士3名，“傑青”“長江”“千人”20名，國家級教學名師5人，教授721人，具有博士學位教師1800余人。
如今的河南大學有12個學科門類，94個本科專業，42個碩士學位授權壹級學科，20種碩士專業學位授權類別，12個博士學位授權壹級學科，15個博士後科研流動站，6個河南省優勢特色學科，39個省壹級重點學科，同時也建有30多個國家和省部級研究教學平臺。
如今的河大聚集了院士、“長江學者”特聘教授、國家傑出青年基金獲得者“973”計劃和國家重大科學研究計劃首席科學家、“萬人計劃”科技創新領軍人才、青年千人、國家“百千萬人才工程”、中國科學院“百人計劃”、全國傑出專業技術人才等結構合理的師資隊伍，集聚了萬師強、傅聲雷、周樹和丁建清等壹批領軍人才。
而鄭州大學的快速發展壯大，也借勢了鄭州的整體城市發展，其“211工程”高校的身份也幫助其在近20年間，後來者居上，發展成為河南省綜合實力最強的壹所大學，真算是壹個後起之秀。雖然鄭州大學建校不如河南大學悠久，但因地處河南省會鄭州，迎來了更多的發展機遇，不斷實現跨越式發展，使院校變得更大更強。