第1集 乾隆二十五年。阿裏和卓帶著女兒含香，及浩浩蕩蕩的回族隊伍準備進京，在途中，卻遇上了壹場刀光血影的搶奪。於北京城裏，小燕子、紫薇等人正為壹棟嶄新的酒樓粉刷油漆，壹個不慎！眾人竟濺滿了全身的彩漆，而在同時，忽聞太後即將回宮，眾人壹時驚慌失措辭！小燕子、紫薇兩人更來不及洗清臉上的油彩，即匆匆前往迎駕，然而小燕子與紫薇的狼狽醜態，卻讓太後留下深刻及不快的印象。
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還珠格格2分集劇情第2集 小燕子等人和回族客人真是不打不相識，最後小燕子因佩服回族勇士蒙丹的高超武功，便興起向蒙丹拜師學藝的念頭，並囑咐柳青兄妹妥善照顧身受重傷的蒙丹。小燕子和紫薇因出宮，而耽誤了太後的晚宴，於是又召來壹場嚴歷的責難，小燕子急中生智，輕松逃過壹劫。阿裏和卓帶著公主含香等壹行隊伍，已經來到京城，在市街上，處處擠滿著圍觀的民眾，而蒙丹等人卻以銳利的眼光註視著隊伍行進。
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還珠格格2分集劇情第3集 皇宮中鼓樂齊奏，乾隆大開宮門迎接自回疆遠道而來的阿裏和卓及女兒含香進宮。在宮中的大戲臺裏，含香也以別開生面的回族舞蹈敬獻乾隆，而乾隆卻為含香的風姿壹見傾心。小燕子因不忍見令妃失寵，竟鬥膽頂撞壹國之君，乾隆忿怒之下，便掌摑小燕子壹記耳光，小燕子和紫薇對壹向慈愛的乾隆，已生失望，小燕子更生氣得揚言要離開皇宮，離開永琪，壹時之間，眾人內心紛亂不已。
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還珠格格2分集劇情第4集 小燕子和紫薇對壹向慈愛的乾隆，已生失望，小燕子更生氣得揚言要離開皇宮，離開永琪，壹時之間，眾人內心紛亂不已。經過乾隆親臨漱芳齋，安撫著小燕子與紫薇的情緒後，父子三人又和好如初。不久乾隆冊封含香公主為“香妃”。
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還珠格格2分集劇情第5集 乾隆特派爾康、永琪護送香妃至城外送別阿裏和卓，但在眾人欲行回宮之時，蒙丹又帶著數名黑巾蒙面的武士殺出，並準備劫走香妃，於是爾康和永琪又和蒙丹等人再次交手，雙方展開壹場奮戰！小燕子、紫薇同情香妃遭遇，便起俠義之心欲助香妃、蒙丹這對苦情的戀人，但是兩位格格卻因此又陷入了另壹場危機之中。
第6集 被關入暗房的小燕子與紫薇狀況不明，簡直急煞了爾康和永琪，所幸又由才貌雙全的晴兒，以機智化解了小燕子和紫薇的危險，而聰明伶俐的晴兒，卻成為紫薇最大的威脅。小燕子、紫薇和香妃三人因為種種的刻骨經歷，她們的感情更為親密濃厚，香妃亦因得知音，而逐漸展露歡顏，此時，十五阿哥誕生子，皇宮中又是喜氣洋洋，然而，皇後和容嬤嬤卻見不得令妃、香妃的得寵，心中又燃起了嫉妒和不甘。
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還珠格格2第7集 小燕子和紫薇因想為香妃傳遞訊息給蒙丹，於是扮成太監出宮，眾人在聽取蒙丹和香妃間感人的愛情故事後，便興起了壹個大計劃。而小燕子等人當天的行逕又被太後得知，接著又是壹陣責罰，太後此番連漱芳齋裏的奴仆都不放過，個個被打得淒淒慘慘！小燕子和紫薇見不得奴仆受到傷害，紛紛挺身維護，然而，皇後趁機加油添醋，更讓太後使出嚴刑，結果漱芳齋裏，上上下下都成了慘不忍睹的傷兵，而他們這回的救星，卻又是那位聰敏善良的晴格格。
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還珠格格2第8集 有太後的存在，漱芳齋裏又是危機重重了，甚至於乾隆皇都未必能為小燕子與紫薇的婚事實現承諾，於是暗示著小燕子應多讀書識字以討好太後的歡心，永琪遂為小燕子編了壹套“成語大全”，但是，小燕子卻將成語念的啼笑皆非，眾人即為小燕子的學問苦惱。而曾受乾隆特許，不用著滿人服裝、習滿人規矩的香妃，卻在太後、皇後的勢力威脅之下，形同屈辱的被扒除回服，香妃極力的抗拒，卻換得了暴力相向。
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還珠格格2第9集 香妃受不住眾人的侵犯與羞辱，遂而跳樓欲尋短見，幸得小燕子舍身相救，而乾隆甚為大怒！於是將皇後及眾嬤嬤痛責壹番，而皇後又是不甘心，對付小燕子等人的心意，即更為堅定。乾隆皇帝壹再暗示爾康、紫薇及永琪、小燕子的婚姻危機，此時背負著晴兒威脅的紫薇，終於將滿懷的疑惑，化做淚水而崩潰了，紫薇和爾康也在壹場紛亂中，發生了嚴重的誤解，兩人的山盟海誓也因此起了陣陣的漣漪。
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還珠格格2第10集 在會賓樓裏，紫薇和爾康，兩人仍在負氣中，紫薇借酒澆愁，小燕子也是喝得不亦樂乎，然而紫薇的風姿，卻引起了鄰桌客人的覬覦，爾康壹時難耐客人的輕挑無禮，於是和眾人在會賓樓裏展開壹場鬥毆。喝醉酒的紫薇和小燕子，兩人又被太後逮著了整肅的機會，但是兩位格格卻醉得不醒人事，而且大鬧慈寧宮的浴室，她們將皇後、容嬤嬤等人，誤打誤撞修理得落花流水，最後兩人又落得被關在暗房裏的命運，而晴兒此時又再度施以援手。
第11集 紫薇和爾康經過壹場心痛的折磨後，誤會終於冰釋了。香妃在禦花園裏展露了其身異稟，她輕動舞姿，身上的香味即四溢散發，接著壹群蝴蝶竟翩翩飛舞而來，並且圍繞在香妃、小燕子、紫薇身邊，此番美麗情景，震撼了皇宮，乾隆對香妃更是愛不釋手了。小燕子因想學香妃引蝶，於是命眾奴仆壹同采集花瓣，且泡了壹夜的花瓣澡，她期盼此舉能讓花香沾身，吸引蝴蝶的駕臨，然而，小燕子引不來蝴蝶，卻引來了成群的蜜蜂，而且螫了滿頭的包。
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還珠格格2分集劇情第12集 皇後得知小燕子被蜜蜂螫了滿頭包，特別來到漱芳齋裏看笑話，小燕子心有不甘，於是巧計將花瓣塞進皇後的帽子裏，結果當皇後來到禦花園時，壹群蜜蜂又襲擊皇後和容嬤嬤，見皇後驚嚇得花容失色，小燕子等人卻笑得樂不可支。爾康、紫薇等人在皇上壽誕之日，精心籌劃了精彩的節目為乾隆做壽，乾隆大為驚喜，然而正當眾人沈浸於歡樂的壽宴當中時，卻在漱芳齋裏找到謀害乾隆的證物，小燕子、紫薇等人百口莫辯，眾主仆隨即被關入大牢。
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還珠格格2分集劇情第13集 由於皇後的煽惑，太後親自審問設巫蠱謀害乾隆的案子，紫薇、小燕子、金鎖等人在牢中惶恐害怕，但為了照應彼此，眾人卻紛紛搶著認罪，而紫薇最後為保護小燕子、金鎖等人之安危，於是在太後用極刑屈打之下，無奈的承認這場莫須有的滔天大罪。乾隆經過壹夜理性分析之後，他已了然了壹切的陰謀，可惜仍不及拯救紫薇的傷害，而智慧過人的晴兒，卻找出了施蠱嫁禍者的破綻，這個震憾的發現，也驚嚇了皇後及容嬤嬤。
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還珠格格2分集劇情第14集 紫薇雖是壹名受害者，但在自已受到傷害後，仍不忘為加害人著想，並懇求乾隆勿再追究嫁禍之人。原本即是虛弱身驅的紫薇，在經過挾棍極刑的劇創之後，竟在眾人殷殷關懷之下昏厥了，而皇宮中的太醫，針對紫薇的病情，卻已是愛莫能助，爾康與乾隆痛心疾首，眾人無法置信在花樣年華中的紫薇，生命會是如此的短暫，大家陷入了絕望與哀戚之中，此時，香妃帶著其王室的祖傳秘方前來，並讓紫薇服下壹顆珍奇的藥丸。
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還珠格格2分集劇情第15集 經過香妃的急救，紫薇終於死裏逃生。紫薇也在眾人細心呵護的照料之下漸漸的康復了。晴兒親眼目睹著爾康對紫薇深摯的情愛，深受震憾感動！於是晴兒向太後求情，希望太後能成全爾康和紫薇“驚天地、泣鬼神”的愛情，聽完晴兒壹席話，太後卻陷入更深的迷惑之中。見不到香妃的蒙丹，已經難耐無盡的等候，他苦悶異常，而剛經歷壹場生離死別的爾康，非常能體會蒙丹的痛楚，於是構思了壹個大計劃。
第16集 蒙丹在眾人的計策協助下，終於順利的混進皇宮中，並且和朝思暮想的含香在漱芳齋裏見面了，小燕子等人在小阿哥滿日宴上，紛紛退席齊聚漱芳齋，此舉亦引起了太後、皇後的猜測狐疑，於是眾人也趕到漱芳齋瞧個究竟，然而，太後等人卻瞧見數位戴著特殊面具的人，正在漱芳齋裏搖鈴驅鬼，小燕子、永琪等人見太後突然造訪，於是假借驅鬼儀式，對著作惡多端的容嬤嬤裝神弄鬼，嚇得心術不正的容嬤嬤魂飛魄散、奪門而逃。
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還珠格格2分集介紹第17集 小燕子心情特好，壹時興致以玩焰火棒慶祝，她舉著焰火棒在屋頂上翻跟頭。點點星火跳躍，亦吸引了太後的目光。而眾人玩興大起，個個追逐著星火，漱芳齋裏已然是沒上沒下，熱鬧非凡。壹個不慎！小燕子卻撞倒了尋火光而來的太後，並在混亂中，將太後的背心燒壞了，太後壹怒！欲將小燕子和紫薇逐出皇宮。永琪為扭轉太後對小燕子的成見，於是急欲改造小燕子，但是小燕子和永琪之間，卻發生了嚴重的沖突，最後小燕子在忿怒之際，離家出走了。
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還珠格格2分集介紹第18集 小燕子私自離宮後，眾人處處遍尋不著，永琪亦是後悔莫及與心焦。小燕子這壹離宮，即打定永不回宮的決心，於是也遠離了柳青兄妹與會賓樓。小燕子壹時好奇，進入壹家棋社，接著又在棋社與老板賭彩，最後竟落得在棋社落難做苦工的命運。永琪等人為隱瞞小燕子的失蹤，個個憂心如焚的謀策，以搪塞乾隆皇的來訪然而小燕子私自離宮的消息，還是被壞心眼的容嬤嬤得知了，她和皇後得意的向太後通風報信，太後當下又是吃驚震怒不已！
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還珠格格2分集介紹第19集 小燕子離宮之後，皇宮已鬧得雞飛狗跳！乾隆特派福倫、鄂敏在北京城裏城外四處搜尋。小燕子陷在棋社之中，被老板娘百般虐待，而小燕子又因反抗，吃盡了不少的苦頭，她餓得饑腸轆轆，連在夢裏，竟也得不到食物裹腹，此時，小燕子才深刻體驗到永琪等人對她的重要。壹日良機，小燕子終於逃離了棋社，這次她再也不願好強，顧慮自尊了，她逃到會賓樓，向柳青兄妹與蒙丹求救，眾人得知小燕子的遭遇之後，莫不震驚憤怒！
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還珠格格2分集介紹第20集 永琪知道小燕子在棋社所受的委屈之後，帶著蒙丹、爾康柳青等人壹同去棋社為小燕子報仇。回宮後的小燕子，因在外生活的磨難與教訓後，和永琪的誤會終告冰釋了，而永琪與爾康也借機向太後表明期盼太後成全兩對愛侶的心跡。香妃在漱芳齋裏和眾人喝酒慶祝，然而回到寶月樓時，卻讓乾隆見到香妃嬌媚的醉態，不禁又勾起乾隆欲征服香妃的舉動，而香妃為保住清白，竟拿出匕首刺傷了乾隆！