廣州和深圳當然應該互通地鐵，但我認為不應該在廣州地鐵4號線的位置過虎門口，再接上東莞地鐵，然後才連上深圳地鐵。這樣真的沒必要，而且地鐵每站都停，路程長了真的煩人。
我認為最合理的是廣州地鐵18號線延長到深圳機場，或深圳地鐵11號線加壹條支線到萬頃沙。
因為廣州地鐵18號線和深圳地鐵11號線都是高速的地鐵，站距也比較長，而且分別連接了兩市的市中心CBD。而通過換乘，也可以經廣州地鐵22號線到達廣州南站。
這樣建設，對深圳機場是十分有利的。深圳機場可以進壹步吸引南沙、中山、江門的旅客，成為粵港澳大灣區的中心機場。而對於廣州，這也未嘗不是壹個吸引港深資本的機會。而南沙，就必然會吸引深圳人過去居住。再加上深中通道的建設，廣州和深圳的交通就會被打通，廣州和深圳可以不再經由東莞進行連接。有了廣州和深圳的雙重發力，就可以從廣州的邊緣，壹舉成為粵港澳大灣區的交通中心，進而成為經濟中心之壹。
感覺這個回答挺多人看的，那就再說壹下。
1.技術方面我不懂，但我認為這個工程在建造上並不復雜，是在在建的廣州地鐵18號線和已建的深圳地鐵11號線之間建個海底地鐵隧道而已，技術上應該是能實現的。早在十年前就能建廣深港高鐵的獅子洋隧道，現在的技術應該更成熟。
可以看到獅子洋隧道是穿過三個水域的，但實際上在珠三角，水域和陸地的分界線並不明顯，河岸也是壹大片泥沙淤積的。獅子洋隧道10.8千米，而這條隧道大概16千米。
2.這個工程並不影響原有的珠三角城際軌道交通，跟廣深港高鐵、廣深城際、穗莞深城際的走線並不重復，而且功能也不完全重復。
雖然城軌的班次已經很多，但還是比不上隨到隨走的地鐵，地鐵可以有更多換乘，方便到達更多地點，而且城軌離市中心有壹定距離。
3.廣州地鐵18號線和深圳地鐵11號線的走線幾乎是廣州市中心（珠江新城）到深圳市中心（福田）最直的走線，而且途徑廣州的廣州東站、珠江新城（冼村站）、琶洲、南村萬博、番禺、南沙和深圳的新會展中心、機場、寶安中心區、前海、後海、深圳灣總部基地、福田，經過的幾乎都是已經建成的商務區或將要打造的商務區，可以稱之為珠三角商務區連線。
4.廣州地鐵18號線預計是可以30分鐘從廣州東站到萬頃沙，而深圳地鐵11號線從機場到福田大概需要40分鐘，再加上想法中的海底隧道的時間和換乘時間，全程大概也就壹個多小時，比廣深城際還快。如果算上去高鐵站的時間，可能比廣深港高鐵還快。
5.不用擔心沒有客流，反而要擔心運量夠不夠，畢竟現在的深圳地鐵11號線就已經非常大客流量了。所以這又引申出另壹個問題，用市內的軌道交通來解決市際交通可不可行。
利益相關：不是廣州人、深圳人，在深圳讀書，對城市規劃有點興趣。