衛生健康委制定並組織實施疾病預防控制規劃、國家免疫規劃和嚴重危害人民健康的公共衛生問題幹預措施，制定檢疫傳染病名錄和監測傳染病。負責衛生應急工作，組織和指導突發公共衛生事件的預防和控制以及各類突發公共衛生事件的醫療救援。
按照國家要求，遵循全檢原則者必須在疫區進行，核酸采集對象應為患者、疑似患者和密切接觸者。此外，人員遵循“願查則查”的原則。