內部組織:
昭通市教育局有18個科室:黨委辦公室、行政辦公室、教育督導室、財務計劃處、教育處、職業與成人教育處、法規監審處、民族教育處、人事處、學校安全管理處、三生教育處、招生考試處、教育科學研究所、教學儀器站、電教中心、學生資助管理中心、紀委、綜合辦公室。
主要職責:
(壹)貫徹執行黨和國家的教育方針、政策、法律和法規；研究制定全市教育實施意見和規範性文件，並監督實施。
(二)研究提出全市教育改革和發展戰略，制定全市教育體制改革的具體措施和實施方案，並指導實施。
(三)編制全市教育發展規劃，負責各級各類教育的統籌規劃和協調管理；指導中小學布局結構的規劃和調整。
(四)綜合管理全市基礎教育、普通教育、學前教育、職業教育、民族教育、成人教育和特殊教育，指導和管理各縣區教育，負責教育督導評估、審批高中設立和撤銷、中等職業學校專業設置，負責審批市屬社會力量辦學。
(五)促進義務教育均衡發展，促進教育公平；推進基礎教育教學改革，全面實施素質教育。
(六)負責本部門教育經費的統籌管理；參與制定籌集教育經費、教育撥款和教育基礎設施投資的政策措施；監督全市教育經費的籌集和使用；負責中央、省、市各級教育經費和補助的分配、管理和監督；管理國外教育貸款和省內外部分教育援助。
(七)統籌和指導全市教育督導工作；負責組織和指導中等及中等以下教育的督導、檢查和評估，指導基礎教育質量監測。對全市民辦教育進行統籌規劃和綜合管理，規範民辦教育辦學秩序，促進民辦教育健康發展。
(八)指導全市教育系統的精神文明建設和思想政治、德育、體育、衛生、藝術、國防教育等工作；指導教育研究、電化教育、教學儀器設備、普及實驗教學等。，推進現代教育技術裝備和教育信息化建設；管理全市教育學會。