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南京腦科醫院成立於1947，前身為衛生部南京精神病醫院，是全國首家國家神經精神專科醫院。目前是江蘇省精神衛生指導中心，江蘇省唯壹的三級甲等神經精神專科醫院。
占地面積6-6萬平方米，建築面積7萬多平方米。擁有CT、MR、數字減影血管造影、伽瑪刀、神經導航系統、高壓氧等大型設備。床位900張，設有神經內科、神經外科、精神科、兒童精神科、老年精神科、醫學心理學、康復科等10個臨床科室和8個醫技科室。