中心通過深化內涵建設、制度建設、人才建設，確立了以質量為生命、以科研為依托、以人才為基礎、以疾病控制為中心的發展方向和工作宗旨。本中心認真貫徹新時期衛生工作方針，面向現代化，面向世界，面向未來。根據21世紀醫學科技和衛生事業發展的需要，重點學習現代醫學科技發展中的新理論、新知識、新技術、新方法，註重先進性、針對性和實用性。堅持多種形式的教育，註重質量和實效；堅持普及與提高相結合，為優秀衛生技術人員脫穎而出創造良好環境；堅持實事求是、因地制宜的原則。加強疾控中心隊伍素質培訓，通過研究生培養、在職教育、進修和在職培訓，提高工作人員的專業知識、專業技能和政策水平。把人才培養和科技進步作為疾病控制發展的重要戰略。
在人員培訓方面，中心重點加強人員的在職培訓。每周各部門業務骨幹認真備課講課，組織全體員工集中進行業務學習。這不僅增加了全體員工的業務知識，普及了預防醫學常識，而且在中心形成了良好的學習氛圍。重點選派壹批中青年業務骨幹外出參加各種進修學習，吸收國內外新知識、新技術，使他們掌握各學科的新知識、新技術，培養他們分析和處理復雜問題的能力。這不僅拓寬了業務人員的視野，也提高了中心的整體業務水平。在時間、人員、設備、經費等方面優先考慮學科帶頭人。