1、 短信公眾號是基於短信通道，在短信下方的菜單功能，更加開放公正，覆蓋面廣。而微信公眾號是基於微信，受制於微信官方對規則的限制和更改，企業自主性不夠。
2、 短信公眾號不需要用戶下載APP，不需要關註賬號，非常方便，覆蓋率廣。而微信公眾號需要下載APP，申請賬號，關註企業公眾號，過程繁瑣覆蓋有限，多數企業關註率不到10%。
3、 短信公眾號成本低，通過5分錢成本的短信公眾號進行營銷推廣。而微信公眾號獲得用戶的成本高，做宣傳，送優惠（吸粉成本至少3~5元）。
4、 短信公眾號功能更強大，直接在短信頁面下單、查閱優惠，可調用企業APP、短信指令、接入H5頁面和打通客服電話系統等等。
5、 開發周期也不同，短信公眾號只需企業提供短信接入號、短信模板，開發周期非常短。微信公眾號根據功能不同，可能開發半年以上，需要定時推送文章，開發成本高費用高。