1996
1 雲霄飛車殺人事件
2 董事長千金綁架事件
3 偶像密室殺人事件
4 大都會暗號地圖事件
5 新幹線大爆破事件
6 情人節殺人事件
7 每月壹件禮物威脅事件
8 美術館館主殺人事件
9 天下壹夜祭殺人事件
10 職業足球選手威脅事件
11 月光奏鳴曲殺人事件(1小時特別篇)*
12 步美綁架事件
13 奇怪的尋親殺人事件
14 謎樣的訊息阻擊事件
15 消失的屍體殺人事件
16 古董收藏家殺人事件
17 百貨公司挾持事件
18 六月新娘殺人事件
29 電梯殺人事件
20 鬼屋之謎殺人事件
21 連續劇外景隊殺人事件
22 豪華客輪連續殺人事件(上)
23 豪華客輪連續殺人事件(下)
24 喪失記憶的美女事件
25 真假人質綁票事件
26 愛犬約翰殺人事件
27 小五郎同學會殺人事件(上)
28 小五郎同學會殺人事件(下)
29 電腦殺人事件
30 不在場證明殺人事件
31 電視臺殺人事件
32 咖啡店殺人事件
33 探險隊生還事件
34 山莊繃帶怪人殺人事件(上)
35 山莊繃帶怪人殺人事件(下)
36 周壹晚7:30殺人事件
37 仙人掌花殺人事件
38 紅鬼村火祭殺人事件
39 企業家千金殺人事件(上)
40 企業家千金殺人事件(下)
41 優勝錦旗被割事件
42 卡拉OK廳殺人事件
1997
43 江戶川柯南誘拐事件
44 崛田三兄弟殺人事件
45 敷面膜殺人事件
46 雪山山莊殺人事件
47 體育俱樂部殺人事件
48 外交官殺人事件(上)
49 外交官殺人事件(下)
50 圖書館館長殺人事件
51 高爾夫練習場爆炸事件
52 霧天狗傳說殺人事件(1小時特別篇)*
53 秘密兇器殺人事件
54 電玩公司殺人事件
55 列車時刻表殺人事件
56 清潔公司社長殺人事件
57 福爾摩斯迷殺人事件(上)
58 福爾摩斯迷殺人事件(下)
59 首次跑腿殺人事件
60 插畫畫家殺人事件
61 幽靈船殺人事件(上)
62 幽靈船殺人事件(下)
63 怪獸哥梅拉殺人事件
64 第三個指紋殺人事件
65 螃蟹和鯨魚綁架事件
66 夜路殺人事件
67 舞臺女演員殺人事件
68 暗夜公爵殺人事件(事件篇)
69 暗夜公爵殺人事件(疑惑篇)
70 暗夜公爵殺人事件(解決篇)
71 米花之狼殺人事件
72 三胞胎別墅殺人事件
73 少年偵探隊遇難事件
74 死神陣內殺人事件
75 金融公司社長事件
76 柯南對怪盜基德(1小時特別篇)*
77 名門連續慘死事件(上)
78 名門連續慘死事件(下)
79 行動電話殺人事件
80 放浪畫家殺人事件
81 當紅藝人綁架事件(上)
82 當紅藝人綁架事件(下)
83 綜合醫院殺人事件
84 滑雪別墅殺人事件(上)
85 滑雪別墅殺人事件(下)
1998
86 綁架現場確定事件
87 白鶴報恩殺人事件
88 德休拉別墅殺人事件(上)
89 德休拉別墅殺人事件(下)
90 花香殺人事件
91 搶匪住院事件
92 恐怖的登山殺人事件(上)
93 恐怖的登山殺人事件(下)
94 雪女傳說殺人事件
95 小五郎約會殺人事件
96 走投無路的名偵探 連續兩大殺人事件(2小時特別篇)*
97 離別美酒殺人事件
98 名陶藝家殺人事件(上)
99 名陶藝家殺人事件(下)
100 初戀情人回憶事件(上)
101 初戀情人回憶事件(下)
102 古裝劇演員殺人事件(上)
103 古裝劇演員殺人事件(下)
104 盜竊集團別墅事件(上)
105 盜竊集團別墅事件(下)
106 新聞照片殺人事件
107 鼴鼠星人之謎事件(上)
108 鼴鼠星人之謎事件(下)
109 偵探團大追蹤事件
110 料理教室殺人事件(上)
111 料理教室殺人事件(下)
112 帝丹小學7大不可思議事件
113 白色沙灘殺人事件
114 有氧潛水殺人事件(上)
115 有氧潛水殺人事件(下)
116 推理小說作家失蹤事件(上)
117 推理小說作家失蹤事件(下)
118 浪花連續殺人事件(1小時特別篇)*
119 假面超人殺人事件
120 蜂蜜雞尾酒殺人事件
121 浴室的密室事件(上)
122 浴室的密室事件(下)
123 天氣預報小姐誘拐事件
124 謎樣的阻擊者殺人事件(上)
125 謎樣的阻擊者殺人事件(下)
126 旅行戲團殺人事件(上)
127 旅行戲團殺人事件(下)
128 黑衣組織10億元搶奪事件
1999
129 來自黑衣組織的女子 大學教授殺人事件(2小時特別篇)*
130 競技場脅迫事件(上)
131 競技場脅迫事件(下)
132 魔術愛好者殺人事件(事件篇)
133 魔術愛好者殺人事件(疑惑篇)
134 魔術愛好者殺人事件(解決篇)
135 消失的兇器搜索事件
136 青色古城探索事件(上)
137 青色古城探索事件(下)
138 最後的上映殺人事件(上)
139 最後的上映殺人事件(下)
140 SOS!步美傳達的訊息
141 結婚前夜的密室事件(上)
142 結婚前夜的密室事件(下)
143 疑惑的天體觀測
144 上野出發北鬥星3號(上)
145 上野出發北鬥星3號(下)
146 本廳刑事的戀愛故事(上)
147 本廳刑事的戀愛故事(下)
148 路面電車突然停止事件
149 遊樂園高空彈跳事件
150 汽車爆炸事件的真相(上)
151 汽車爆炸事件的真相(下)
152 謎樣的老人失蹤事件
153 園子的夏日海灘冒險物語(上)
154 園子的夏日海灘冒險物語(下)
155 水中的鑰匙密室殺人事件
156 本廳刑事的戀愛故事2(上)
157 本廳刑事的戀愛故事2(下)
158 沈默的環狀線
159 奇怪的五重塔傳說(上)
160 奇怪的五重塔傳說(下)
161 流水亭之流水的殺意
162 空中的密室 工藤新壹首次推理(1小時特別篇)*
163 月亮星星太陽的秘密(上)
164 月亮星星太陽的秘密(下)
165 少年偵探團失蹤事件
166 鳥取縣蜘蛛公館的怪事(事件篇)
167 鳥取縣蜘蛛公館的怪事(疑惑篇)
168 鳥取縣蜘蛛公館的怪事(解決篇)
169 維納斯之吻
170 黑暗中的死角殺人事件(上)
171 黑暗中的死角殺人事件(下)
172 復蘇的死亡傳言(上)
173 復蘇的死亡傳言(下)
2000
174 第二十年的殺機 聖佛尼號連續殺人事件(2小時特別篇)*
175 被殺了四次的男人
176 黑衣組織的再會(灰原篇)
177 黑衣組織的再會(柯南篇)
178 黑衣組織的再會(解決篇)
179 咖啡店卡車亂入事件
180 紅色的殺機夜想曲(上)
181 紅色的殺機夜想曲(下)
182 九個門大搜查
183 危險的處方箋
184 詛咒面具的冷笑(1小時特別篇)*
185 被狙擊的名偵探(上)
186 被狙擊的名偵探(下)
187 在黑暗中傳出的神秘槍聲
188 命運的復活 洞窟中的偵探團
189 命運的復活 負傷的名偵探
190 命運的復活 第三種選擇
191 命運的復活 黑衣騎士
192 命運的復活 歸來的工藤新壹
193 命運的復活 約會的場所
194 意味深長的音樂盒(上)
195 意味深長的音樂盒(下)
196 小蘭的初次推理
197 超級汽車殺人事件(上)
198 超級汽車殺人事件(下)
199 嫌疑犯毛利小五郎(上)
200 嫌疑犯毛利小五郎(下)
201 十個乘客(上)
202 十個乘客(下)
203 黑天使的翅膀(上)
204 黑天使的翅膀(下)
205 本廳刑事的戀愛故事3(上)
206 本廳刑事的戀愛故事3(下)
207 太順利的推理
208 迷宮的入口!巨大神像之怒(1小時特別篇)*
209 龍神山墜落事件
210 五彩傳說之水禦殿(上)
211 五彩傳說之水禦殿(下)
212 松蘑、熊和偵探團(上)
213 松蘑、熊和偵探團(下)
214 演講廳神秘事件
215 復仇的狗吠聲(上)
216 復仇的狗吠聲(下)
217 封印的目暮的秘密(上)
218 封印的目暮的秘密(下)
2001
219 名偵探的聚會 新壹對怪盜基德(2小時特別篇)*
220 壹直說謊的委托人(上)
221 壹直說謊的委托人(下)
222 人魚又再度悲泣(事件篇)
223 人魚又再度悲泣(疑惑篇)
224 人魚又再度悲泣(解決篇)
225 交易繁盛的秘密
226 格鬥遊戲的圈套(上)
227 格鬥遊戲的圈套(下)
228 充滿殺意的陶藝教室(上)
229 充滿殺意的陶藝教室(下)
230 謎壹樣的乘客(上)
231 謎壹樣的乘客(下)
232 高級公寓墜落事件
233 無法消失的證據(上)
234 無法消失的證據(下)
235 酒窖密室事件
236 南紀白濱神秘之旅(上)
237 南紀白濱神秘之旅(下)
238 大阪的3個K事件(上)
239 大阪的3個K事件(下)
240 新幹線護送事件(上)
241 新幹線護送事件(下)
242 元太的災難
243 毛利小五郎的冒充者(上)
244 毛利小五郎的冒充者(下)
245 向日葵館的槍聲
246 網中的謎事件(上)
247 網中的謎事件(下)
248 痊愈之森林的不在場證明
249 偶像們的秘密(上)
250 偶像們的秘密(下)
251 OK牧場的悲劇
252 圖畫中的綁架犯
253 本廳刑事的戀愛故事4(上)
254 本廳刑事的戀愛故事4(下)
255 松江玉造連句十四次比賽(上)
256 松江玉造連句十四次比賽(下)
257 世間奇妙的天罰
258 來自芝加哥的男人(上)
259 來自芝加哥的男人(下)
260 搖晃的西餐廳
261 雪夜恐怖傳說(上)
262 雪夜恐怖傳說(下)
2002
263 大阪雙重神秘、浪花劍士和太閣之城(2小時特別篇)*
264 法庭的對決 妃vs小五郎(上)
265 法庭的對決 妃vs小五郎(下)
266 情人節的真相(事件篇)
267 情人節的真相(疑惑篇)
268 情人節的真相(解決篇)
269 犯罪的紀念品(上)
270 犯罪的紀念品(下)
271 急忙掩飾的忽略(上)
272 急忙掩飾的忽略(下)
273 提問婆婆失蹤事件
274 幽靈屋的真相(上)
275 幽靈屋的真相(下)
276 警察手冊丟失事件
277 英語教師VS西部名偵探(上)
278 英語教師VS西部名偵探(下)
279 迷宮的陰暗(上)
280 迷宮的陰暗(下)
281 小小的目擊者們
282 水流石庭的玄機(上)
283 水流石庭的玄機(下)
284 中華街 雨中的似曾相識(上)
285 中華街 雨中的似曾相識(下)
286 工藤新壹NY事件(事件篇)
287 工藤新壹NY事件(推理篇)
288 工藤新壹NY事件(解決篇)
289 迷茫森林中的光彥(上)
290 迷茫森林中的光彥(下)
291 孤島的公主與龍宮城(事件篇)
292 孤島的公主與龍宮城(追求篇)
293 孤島的公主與龍宮城(解決篇)
294 愛與決心的粉碎(上)
295 愛與決心的粉碎(下)
296 屋形船--震驚的釣魚
297 法庭對決II妃vs九條(上)
298 法庭對決II妃VS九條(下)
299 友情與殺意的關門海峽(上)
300 友情與殺意的關門海峽(下)
301 惡意和聖者的行進(上)
302 惡意和聖者的行進(下)
303 歸來的受害人
2003
304 震動的警視廳 1200萬人質(2小時特別篇)*
305 看不見的嫌疑犯(上)
306 看不見的嫌疑犯(下)
307 無聲的證據(上)
308 無聲的證據(下)
309 和黑暗組織的再會(交涉篇)
310 和黑暗組織的再會(追蹤篇)
311 與黑色組織接觸(決死篇)
312 夕陽染紅的女兒節人偶(上)
313 夕陽染紅的女兒節人偶(下)
314 欄桿損壞的了望臺
315 陽光普照的地方
316 沾汙的假面英雄(上)
317 沾汙的假面英雄(下)
318 幸運的雪茄盒(上)
319 幸運的雪茄盒(下)
320 不在場證明的隱身術
321 消失的綁架逃逸車(上)
322 消失的綁架逃逸車(下)
323 服部平次壹籌莫展(上)
324 服部平次壹籌莫展(下)
325 火焰中的赤兔馬(事件篇)
326 火焰中的赤兔馬(搜查篇)
327 火焰中的赤兔馬(解決篇)
328 生日飲酒之迷
329 金錢買不到的友情(上)
330 金錢買不到的友情(下)
331 疑惑的咖喱飯(上)
332 疑惑的咖喱飯(下)
333 相似的公主(上)
334 相似的公主(下)
335 東京現影所的秘密(上)
336 東京現影所的秘密(下)
337 墜落事件的隱情
338 4輛保時捷(上)
339 4輛保時捷(下)
340 廁所裏隱藏的秘密(上)
341 廁所裏隱藏的秘密(下)
342 豪斯登堡的新娘(1小時特別篇)*
343 便利店的陷阱(前篇)
344 便利店的陷阱(後篇)
2004
345 與黑衣組織直面對決滿月之夜的雙重迷案(2個半小時特別篇)*
346 尋找屁股上的印記(上)
347 尋找屁股上的印記(下)
348 愛與幽靈與地球的遺產(上)
349 愛與幽靈與地球的遺產(下)
350 被遺忘的手機(上)
351 被遺忘的手機(下)
352 釣魚大會的悲劇(上)
353 釣魚大會的悲劇(下)
354 小小的委托人(上)
355 小小的委托人(下)
356 基德的空中漫步(壹小時特別篇)*
357 戀人是春天的幻影
358 本廳刑事的戀愛物語5(上)
359 本廳的刑事戀物語5(下)
360 不可思議的春天的獨角仙
361 帝丹高中學校怪談(上)
362 帝丹高校學校怪談(下)
363 都市的烏鴉
364 ***時性事件(上)
365 ***時性事件(下)
366 顯而易見的碼頭慘劇(上)
367 顯而易見的碼頭慘劇(下)
368 魔女棲息的糖果之家
369 跟隨者的懸念
369 好運男子的歷險
370 四處輾轉的遊戲軟件
371 沈沒的航線(上)
372 沈沒的航線(下)
373 巨毒蜘蛛的陷阱
374 星星和香煙的暗號(上)
375 星星和香煙的暗號(下)
376 限時15時!
377 桃太郎解密之旅(上)
378 桃太郎解密之旅(下)
379 深山溫泉、雪中之夜和年輕女子事件(上)
380 深山溫泉、雪中之夜和年輕女子事件(下)
381 誰的推理秀(上)
382 誰的推理秀(下)
383 甲子園的奇跡--絕不能輸給看不見的惡魔(2小時特別篇)*
2005年
384 目標毛利小五郎
385 斯特拉迪瓦裏小提琴的不和諧音(前奏曲)
386 斯特拉迪瓦裏小提琴的不和諧音(間奏曲)
387 斯特拉迪瓦裏小提琴的不和諧音(尾奏曲)
388 醉在薩摩的小五郎(上)
389 醉在薩摩的小五郎(下)
390 本廳的刑事戀物語6(上)
391 本廳的刑事戀物語6(下)
392 謎樣的身長相差20厘米
393 似乎是綁架的事件
394 怪屋大冒險(封印篇)
395 怪屋大冒險(操縱篇)
396 怪屋大冒險(解決篇)
397 辛辣苦口卻又甘甜的湯
398 奇妙壹家的委托(上)
399 奇妙壹家的委托(下)
400 持有疑惑的小蘭
401 寶石搶匪現行犯(前篇)
402 寶石搶匪現行犯(後篇)
403 不可思議的天使之館(上)
404 不可思議的天使之館(下)
405 呼叫救護車的男子
406 柯南和平次的推理魔術(裝置篇)
407 柯南和平次的推理魔術(公館篇)
408 柯南和平次的推理魔術(解決篇)
409 同時進行的舞臺和綁架(上)
410 同時進行的舞臺和綁架(下)
411 神社鳥居之驚悚暗號(上)
412 神社鳥居之驚悚暗號(下)
413 完全壹半犯罪之謎
414 追逐蘭色小鳥的少年偵探團
415 佛滅前出現的惡靈(事件篇)
416 佛滅前出現的惡靈(推理篇)
417 佛滅前出現的惡靈(解決篇)
418 米花町閣樓之家
419 八頭蛇的劍(上)
420 八頭蛇的劍(下)
421 銀杏色的初戀(上)
422 銀杏色的初戀(下)
423 偵探團和青蟲四兄弟
424 來自小醜的圖片郵件
2006年
425 被組織的魔掌觸碰的瞬間(2小時特別篇)*
426 給小蘭的情書
427 超神秘的上學路(上)
428 超神秘的上學路(下)
429 無法回到從前的兩人(上)
430 無法回到從前的兩人(下)
431 本廳的刑事戀物語7(上)
432 本廳的刑事戀物語7(下)
433 柯南--奇怪的孩子
434 名犬庫班的功勞
435 註目於偵探團的采訪(上)
436 註目於偵探團的采訪(下)
437 新壹與上戶彩，四年前的約定
438 追蹤魚的短信
439 然後誰都不在就好了
440 極限賽車表演
441 臨終的啊……
442 被鋼筋阻擊的男人6/12
443 嘆息趕海(上)
444 嘆息趕海(下)
445 俄羅斯藍貓的秘密
446 被封印的歐式窗戶(前篇)
447 被封印的歐式窗戶(後篇)
448 目黑的秋刀魚事件
449 本廳刑警的戀愛物語--虛偽的婚禮
450 詭計VS魔術(前篇)
451 詭計VS魔術(後篇)
452 金比羅劇院的怪人
453 法庭上的對決3 毛利蘭VS宮野誌保 (前篇)
454 法庭上的對決3 毛利蘭VS宮野誌保 (後篇)
454 顛倒的結尾（前篇
455 顛倒的結尾（後篇）
456 我喜愛的推理
457 園子的紅手帕（前篇）
458 園子的紅手帕（後篇）
459 怪人 循規蹈矩的男人
461 消失的壹頁
2007年
462 黑暗組織的影子 年幼的目擊者
463 黑暗組織的影子 奇妙的照明
464 黑暗組織的影子 謎樣的高額報酬
465 黑暗組織的影子 珍珠的流星
466 堅不可摧的雪人（前篇）
467 堅不可摧的雪人（後篇）
468 池塘邊的奇怪事件
469 怪盜KID與四幅名畫（前篇）
470 怪盜KID與四幅名畫（後篇）
471 失去控制的租賃車！
472 工藤新壹少年時的冒險（前篇
473 工藤新壹少年時的冒險（後篇）
474 妃英理律師之戀
475 厄運最高獎
476 元太的必殺射門（前篇）
477 元太的必殺射門（後篇）
478 真實的30分鐘
479 與服部平次***度的3天
480黃色不在場證明
81 山姥的刀（前篇）/2007.07.30
482 山姥的刀（後篇）/2007.08.06
483 消失的巡警
484 黑色照片的去向(後篇)
485 黑色照片的去向(後篇)
486 從右向左招財貓 07.09.03
487本廳刑事戀愛物語8 左手無名指 07.10.15
488電視臺的惡魔 07.10.22
489法庭的對決3 目擊者是檢察官
490服部平次vs工藤新壹 滑雪場的推理對決
2008年
491紅與黑的碰撞 開始
492紅與黑的碰撞 血緣
493紅與黑的碰撞 絕叫
494紅與黑的碰撞 冥土
495紅與黑的碰撞 昏睡
496紅與黑的碰撞 入侵
497紅與黑的碰撞 覺醒
498紅與黑的碰撞 攪亂
499紅與黑的碰撞 偽裝
500紅與黑的碰撞 遺言
501紅與黑的碰撞 嫌疑
502紅與黑的碰撞 潔白
503紅與黑的碰撞 決死
504紅與黑的碰撞 殉情
505律師妃英裏的證詞（前篇）
506律師妃英裏的證詞（後篇）
507卡拉OK包房的死角（前篇）
508卡拉OK包房的死角（後篇）
509紅白黃色與偵探團
510柯南vs雙重暗號之謎
511推理對決！新壹VS沖矢昴
512破碎的星座圖
513殺意源自咖啡之香(前篇)
514殺意源自咖啡之香(後篇)
515怪盜基德的瞬間移動魔術
516風林火山 迷宮的鎧甲武士
517風林火山 陰與雷霆的終結
518明治維新神秘之旅(探索篇)
519明治維新神秘之旅(解讀篇)
520 告密的紅酒
2009年
521殺人犯、工藤新壹
522新壹的真相與蘭的眼淚
523真正想問的事
524討厭的藍色火花(前篇)
525討厭的藍色火花(後篇)
526真兇送來的禮物
527假面戲劇中隱藏的惡意
528以柔克謎(前篇)
529以柔克謎(後篇)
530都市傳說的真相(前篇)
531都市傳說的真相(後篇)
532初戀的傷痕
533 呼喚過去的傷痕
534 新傷痕與吹口哨的男人
535 舊傷痕與刑警之魂
536 消失名畫背後的秘密
537 怪盜基德VS最強金庫(前篇)
538 怪盜基德VS最強金庫(後篇)
539 給愚蠢者的遺產
540 毛利小五郎不當偵探的日子(前篇)
541 毛利小五郎不當偵探的日子(後篇)
542 讓魚兒消失的壹角巖(前篇)
543 讓魚兒消失的壹角巖(後篇)
544 彈奏不和諧音符之手
545 霧中尖叫的魔女(前篇)（9月5日播出）
546 霧中尖叫的魔女(後篇)（9月12日播出）
OVA
OVA版1 柯南對基德寶刀爭奪戰
OVA版2 十六人的嫌疑者
OVA版3 柯南與平次與消失的少年
特別版：
1. 工藤優作-仿徨的紅蝴蝶
2. 工藤有希子-飛上天空的十顆行星
3. 工藤優作-仿徨的紅蝴蝶
4. 世紀百科-追尋謎壹樣的水星怪獸
5. 青山剛昌短篇動畫集
6. 少年偵探團7分鐘特輯（名偵探柯南幕後工作公開紀錄片）
劇場版
1. 引爆摩天樓
2. 第十四個目標
3. 世紀末的魔術師
4. 瞳孔中的暗殺者
5. 往天國的倒計時
6. 貝克街的亡靈
7. 迷宮的十字路口
8. 銀翼之奇術師
9. 水平線上的陰謀
10.偵探們的鎮魂歌
11.紺碧之棺
12 戰栗的樂譜
13.漆黑的追跡者
14.迷霧的狙擊手（流傳消息，不明）
15.月光之下的幻影（流傳消息，不明）