壹般來說，使用新型冠狀病毒抗原試劑盒時，應先進行手的清潔和消毒。然後打開藥盒，取出藥盒中的物品，仔細閱讀說明書，因為不同品牌和操作有細微的差別，避免得出錯誤的結果。
閱讀說明後，打開樣品提取物並將其倒入樣品提取管中。如果鼻腔內分泌物較多，檢測前先清洗鼻腔，清洗鼻腔後取出棉簽，避免用手接觸棉簽頭，以免影響檢測結果。
測試時，頭向後擡起，將棉簽在鼻腔內推進約1cm至約1.5cm，並在鼻腔內旋轉四圈，停留約15秒，以保證采樣時增加接觸面和采樣量，然後將同壹棉簽放入另壹側鼻孔內采樣，進行上述操作。
取完樣品後，放入提取管中，將棉簽頭放入提取液中，旋轉30秒左右，擠壓棉簽頭五次，翻轉提取管，從蓋子上滴三滴左右提取液到檢測卡上進行檢測。
新型冠狀病毒抗原檢測結束後，應將采樣物品密封，避免暴露在空氣中，約10分鐘至15分鐘即可判定結果。