孫思邈體現了以仁治病的精神。他在《大醫精誠》壹書中寫道:“大醫治病，須心平氣和，無欲無求，先顯大慈大悲，誓救壹般精神之苦。如果有人生病來求助，不要問他是窮是富，是老是少，是不是討厭友好的朋友，是不是無知，是不是俗，這些都像是他最親的人的想法。切不可瞻前顧後，操心吉兇，保命。看到他的苦惱，如果妳也有，那是深深的悲哀。不要回避危險和邪惡。妳壹天到晚忽冷忽熱，饑腸轆轆，疲憊不堪，壹心節省，無心作任何努力。這可以做壹輩子的大醫，卻是壹個有精神的賊。醫生的身體...再到病號家裏，縱再續前緣到處走，也不東張西望；絲竹補耳，無似娛；珍貴的羞恥和反復的推薦，食之無味；看看盧和陳，看看有沒有什麽。夫為博士法，不可多言戲言，講戲謔，講是非，講人情，賣弄名聲，敗壞醫生，以自己的德行為榮。壹不小心治療了壹個病，他會趾高氣揚，臉上帶著病容，但又會有自信的樣子。他叫大話西遊，這個醫生很優秀。”這幾句話已經顯示了孫思邈高尚的醫德。
據說孫思邈擅長陰陽，推臺階，解數字很有技巧。人生不仕，隱於山中。親自收藥治病。他收集民間驗方和秘方，總結臨床經驗和前人醫學理論，在醫學和藥理學方面做出了重要貢獻。後人尊稱他為“藥王”。借鑒《黃帝內經》臟腑理論，在《千金方耀》中首次提出了以臟腑寒熱虛實為中心的雜病分類和辨證論治。張仲景整理研究《傷寒論》後，將傷寒歸為十二篇，提出傷寒十五忌，受到後世傷寒學家的高度重視。他收集了東漢至唐代的諸多醫學理論、方劑、用藥、針灸等經驗，以及上鉤、食療、指導、按摩等養生方法，寫成《千金方耀》三十卷，共分232門，接近現代臨床醫學的分類方法。書中包含5300個方藥和論著，方藥種類繁多，內容豐富。是我國唐代醫學發展中具有代表性的傑作，對後世醫學尤其是方劑學的發展有著明顯的影響和貢獻。對日本和韓國的醫學發展也起到了積極的作用。30卷本的《前進方毅》屬於他的後期作品，是對《前進方耀》的全面補充。全書共分189章，包含方劑、理論、方法2900余篇，記載藥物800余種，尤其對傷寒、中風、雜病、瘡瘍等療效顯著。
他堅持辨證論治的方法，認為人如果善於調養生活，就可以免於疾病。只要“良醫導之以麥飯石，救之以打針”，“身形有可治之病，世間有可除之災。”他非常重視醫德，不論“貧富老少，嫉妒朋友，愚昧無知”。正所謂“人命關天，還有個寶貝女兒。”他非常重視婦幼保健，著有《婦人方》三卷、《嬰幼兒方》兩卷，置於錢進方耀之首。
孫氏認為“人命為重，且有珍貴黃金，壹面助之，德行不止於此”，於是將自己的兩部作品命名為《千女》，命名為《千女歸黨》、《千女歸翼》。這兩部書的成就在於:壹是對張仲景《傷寒論》有深入的研究，為後人研究《傷寒論》提供了壹條途徑，特別是對廣義傷寒增加了更具體的內容。他創立了從方、證、治三個方面研究《傷寒論》的方法，開創了後世以方為證的先河。《千金方耀》是中國最早的醫學百科全書，理論、方法、方藥齊全。壹個是古籍記載，壹個是民間單方。廣泛吸收各方面的長處，雅俗共賞，輕重緩急適當。許多內容至今仍有指導作用，具有很高的學術價值，確實是中醫藥學的寶貴財富。《千金方耀》是對方劑學發展的壹大貢獻。該書匯集了從張仲景時代到孫思邈數百年的方藥成就的臨床經驗。看完仲景的方子，再看《錢進方》確實能讓妳大開眼界，開闊思路，尤其是不同淵源的方子用藥，可見孫思邈醫源之廣，醫術之高超。後人把方稱為方術的始祖。
千金方耀在食療、養生、養老方面做出了巨大貢獻。孫氏能活到100多歲，是他積極倡導這些理論並結合自身實踐的結果。孫思邈生前的光輝業績受到人們的崇敬。被譽為“藥王”、“真人”、“藥聖”，隋唐對他器重有加，名士以禮相待。他去世後，人們在他的故居尖山畔祭奠於成。《喬世寧序》中說:“築山燒香，關中繁華，雖華曰、真武未逮。”孫思邈在日本也享有很高的聲譽，尤其是日本名醫丹波康萊和小島康譽上實。
孫思邈對藥理學的研究傾註了大量的心血。從藥物的采集加工到對其藥性的認識，從方劑藥物的組合配伍到臨床治療，孫思邈通過參考前人的醫學文獻，結合自己幾十年的臨床經驗，寫出了中國醫學發展史上具有重要學術價值的兩部醫學巨著。其中，《千金方耀》收錄方劑5000余首，既有診斷、證候等醫學理論，又有內科、外科、婦科、兒科等臨床學科。不僅涉及排毒、急救、養生、食療，還涉及針灸、按摩、指導、呼吸等，可謂是對唐代以前中醫發展的壹個很好的總結。《千金方毅》方藥近三千首，涵蓋本草、婦人、傷寒、小兒、滋補、中風、雜病、瘡癰、色脈、針灸，對《千金方耀》作了必要而有益的補充。書中收集的800多種藥物中，有200多種藥物詳細介紹了藥物收集和加工的相關知識。特別值得壹提的是，該書收錄了晉唐時期失傳於民間的《傷寒論》篇，單獨構成九卷或十二卷，成為唐代唯壹的傷寒論研究著作，對《傷寒論》篇的保存和傳播起到了積極的推動作用。
在臨床實踐中，孫思邈總結出“阿是穴”、“痛為焦點”等許多寶貴經驗，用動物肝臟治療夜盲癥，用羊甲狀腺治療地方性甲狀腺腫，用奶、豆、糠預防腳氣。對於孕婦，建議住處幹凈安靜，保持心情舒適，分娩時不要緊張；對於寶寶，建議母乳餵養要定時定量，平時要陽光充足，衣服不要穿太多...這些思想在今天仍有壹定的現實意義。
孫思邈崇尚養生，身體力行。正因為他熟悉養生藝術，所以能活到100多歲，從未失傳。他將儒家、道家和外國古印度佛教徒的養生思想與中醫的養生理論相結合，提出了許多實用的養生方法，至今仍在指導人們的日常生活，如保持心態平衡，不盲目追求名利；飲食要適度，不要暴飲暴食；註意氣血的循環，不要懶惰，不要萎靡不振；生活有規律，不要違背自然規律...
由於《千金方耀》和《千金方毅》的巨大影響，這兩部著作被稱為中國古代醫學百科全書，起到了承漢魏、繼宋元的歷史作用。兩本書出版後，備受世人矚目，甚至飄洋過海，廣為流傳。在天寶、萬吉、田明、永嘉、寬正年間，日本曾出版過《千女》，其影響可見壹斑。孫思邈死後，人們把他隱居的五臺山改名為王耀，並在山上為他建了壹座寺廟雕像。每年農歷二月初三，當地人都會舉行廟會，紀念孫思邈對中醫的巨大貢獻。廟會持續了半個月，四面八方的遊客前來參觀悼念。
歷史上他的作品有30多種，但大部分都失傳了。《千金方耀》和《千金方毅》共30卷，是我國著名的醫學著作。其他的，如照顧他人的理論，太清單晶和皮林中國方面的要點，仍然是部分丟失。
孫思邈也是世界上導管插入術的發明者。根據記錄，有壹個病人得了尿瀦留疾病，不能排尿。孫思邈看到病人痛苦的樣子，心想:“吃藥太晚了。如果妳試圖將管子插入尿道，尿液可能會流出。”他看到鄰居的孩子在玩洋蔥管。洋蔥管又尖又細又軟。孫思邈決定試壹試，於是挑了壹根合適的蔥管，在火上輕輕壹燒，切掉尖頭，然後小心翼翼地插入患者的尿道，再用力吹壹吹。很快尿液真的順著洋蔥管流了出來。病人的胃漸漸癟了，病也就好了。