吸煙會加重肝臟負擔。經常抽煙會影響肝臟的脂質代謝作用，令血中脂肪增加，使到良性膽固醇減少，惡性膽固醇增加。這個原因令肝臟的解毒功能增加負擔。
腸
吸煙會導致結腸癌。患此癌的機會則與吸食煙草的份量成正比。研究顯示停止吸煙雖然可以減低其他疾病例如心臟病、肺癌等的機會，但患上結腸癌的危險就仍然非常大。
眼部
吸煙會引起白內障，影響視力。研究顯示每天吸煙超過壹包的白內障患者是從不吸煙者的2倍。
生殖系統
吸煙對脊髓的神經中樞起抑制作用，使吸煙男人性欲變弱，又由於吸煙能使血管收縮、痙攣，引起末梢血循環障礙。因此，吸煙是導致陽萎的最主要原因。澳洲和加拿大已在香煙盒上直截吸煙會引致多種腦部疾病，會減低循環腦部之氧氣及血液，引致腦部血管出血及閉塞，而導致麻痹、智力衰退及中風。中風原因是吸煙導致腦部血管痙攣，使血液比較容易凝結。吸煙者中風機率較非吸煙人士高出兩倍。
喉部
吸煙可導致喉癌。喉癌患者以男性居多。
心臟及血管
研究發現，吸煙會使血液中的血小板粘性增加，這使血液更容易凝固，從而容易在冠狀動脈中形成血栓。同時，吸煙還會使血液中低密度膽固醇增加，這使脂肪物質容易在血管內沈積而形成冠狀動脈粥樣硬化。如果冠狀動脈發生硬化，其內腔便會變細，壹旦血液在裏面凝固動脈便被塞住，這時氧氣便不能被送到該部分的心臟肌肉中去，而心肌細胞便會因缺氧而衰竭死亡，這便是心肌梗死。局部的心肌梗死會使人發生心絞痛，大範圍的心肌梗死則會使人休克，或者由於心臟突然停止跳動而死亡，這便是急性心肌梗死。吸煙令血管收縮，減慢血液及氧份循環，最終導致血管壁變厚，誘發冠心病及中風。吸煙會令手腳血液流通完全受阻，以致截肢。
醫生們對吸煙人的勸告是：如果妳有高血壓、高血脂、心臟病或心臟病家族史，妳就應立刻停止吸煙，因為吸煙會使妳罹患心肌梗死的危險性提高幾十倍。因吸煙而導致的心臟病死亡率占全部的25%。50歲以上吸煙人士的患病率提高2倍。50歲以下吸煙人士的患病率提高9至14倍。
肺部
吸煙會引致肺癌。90%的總死亡率是由吸煙所導致。壹個人每天吸食十支煙，其患病率是非吸煙人士之十倍。被破壞的細胞不能回復正常。初期病徵不會被察覺，直至癌性細胞漫延至血管及其他器官。（到目前為止，肺癌是造成人類死亡最多的壹種癌癥，同時肺癌幾乎無法早期發 現。被診斷為肺癌的患者3年後的存活率低於5%，5年後的存活率幾乎為零。醫生們建 議：吸煙人應每隔3～6個月做壹次胸部透 視，如出現幹咳、痰中有血絲、胸內隱痛及發熱等癥狀時，切不可掉以輕心，應立即去醫院進行痰脫落細胞檢查。只有這樣才能增加早期發現肺癌的可能性。）吸煙亦會引致肺氣腫，肺部支氣管內積聚之有毒物質，會阻礙人體吸入之空氣正常呼出，令肺部細胞膨脹或爆裂，導致患病者呼吸困難。重度肺氣腫患者是十分痛苦的，為了吸入足夠的氧氣，他們不得不上體直立且高頻率地喘息，即使在平地上他們也必須慢慢地行走。有些更嚴重的患者則必須依靠氧氣袋才能維持生命，他們在有生之年必須集中全部的努力去做壹個簡單的動作--喘氣。
有的醫生認為，與肺氣腫相比，肺癌應算作是壹種十分仁慈的疾病，因為肺癌使人痛苦的時間與肺氣腫相比要短得多。
胃部
患有腸胃性疾病者，吸煙足以使腸胃病更惡化。患有胃潰瘍或十二指腸潰瘍者，潰瘍處的愈合會減慢，甚至演變為慢性病。吸煙能刺激神經系統，加速唾液及胃液的分泌，使胃腸時常出現緊張狀態，導致吸煙者食欲不振。另外，尼古丁會使胃腸黏膜的血管收縮，亦令食欲減退。
骨骼
吸煙人士的斷骨康復期要比不吸煙人士長。可能是煙所含的尼古丁及壹氧化碳拖緩了骨胳的再生的進度。尼古丁令血管收縮，降低了流到新生骨骼的血量。吸煙時吸入的壹氧化碳，亦同時減少進入身體的氧氣比率。吸煙會引致盤骨炎及背痛。每天抽煙十支以上，將盤骨炎患病率提高壹倍。有嚴重背痛的人大部份都有很大煙癮，這是由於吸煙會引致流向關節盤的血液減少，關節盤因而提早退化。吸煙會引致關節炎。每天吸食壹包煙，將提高患病率達50%。停經後女性吸煙者更容易患骨折及關節病。吸煙導致骨質流失更快。婦女由青春期至踏入更年期，每日持續吸煙壹包，其骨骼比非吸煙者少百分之五至十。當步入更年期後吸煙者的骨質流失率更快。吸煙會幹擾雌激素，而雌激素正是骨骼發展的重要荷爾蒙。
支氣管
吸煙是導致慢性阻塞氣管疾病的主要發病因素。因為吸煙能引致支氣管上皮細胞的纖毛變短和不規則及其和運動發生障礙，降低局部性抵抗力，容易受到感染。
肝臟了當地印上這個信息。另外，吸煙可影響精子的活力，使畸形精子增多，停止吸煙三至六個月後，方可恢復正常。如想要壹個聰明、健康的孩子，嬰兒專家提倡壹定要停止吸煙三到六個月。